«Се́рпухов» — российский футбольный клуб из города Серпухова, основанный в 2006 году в результате объединения клубов «Локомотив-М» Серпухов и ФК «Серпухов». До 2018 года назывался «Звезда». Выступает в любительском первенстве страны. В 2006—2009 гг. выступал в зоне «Центр» второго дивизиона. Домашний стадион — «Труд». Спортивная база расположена в Серпухове, ранее базой клуба являлся ДОК «Зелёный шум». Цвета клуба — красный и белый.
«Зеленоград» — российский любительский футбольный клуб. Образован в 2002 году, официально зарегистрирован в 2003 году. Территориально размещается в городе Зеленограде Москвы. В 2007—2010 годах имел статус профессионального клуба: провёл 4 сезона во втором дивизионе чемпионата России и 7 матчей в четырёх розыгрышах Кубка России.
«Витязь» — российский футбольный клуб из города Подольска, Московская область. Основан в 1996 году. В 2001—2007 годах выступал в зоне «Центр» Второго дивизиона, в 2008—2009 годах — в Первом дивизионе, с 2010 по 2017 годы — вновь в зоне «Центр» Второго дивизиона.
«Хи́мик» (Новомосковск) — российский футбольный клуб из Новомосковска, Тульская область. Выступал в первенстве СССР в классе «Б» и второй лиге под названиями «Шахтёр», «Труд» и «Химик» (1954—1979) и первенстве России во второй и третьей лигах — «Дон», «Химик» и «Химик-Арсенал». Сейчас выступает в чемпионате Тульской Области.
«Лобня» — российский футбольный клуб из города Лобня Московской области. В 2006 году занял 3-е место в зоне «Центр» Второго дивизиона и вышел в 1/32 финала Кубка России.
«Бата́йск-2007» — российский футбольный клуб из города Батайск Ростовской области. 29 июля 2010 года снялся с первенства второго дивизиона зона «Юг». С сезона 2014 выступает в чемпионате Ростовской области.
ФК ПСК «Сахали́н» — российский футбольный клуб из города Южно-Сахалинска, основанный в 2004 году. Лучший результат в истории — 16 место в Первенстве ФНЛ 2014/15. Двукратный победитель зоны «Восток» второго дивизиона. Является частью профессионального спортивного клуба «Сахалин».
«Апати́т» — российский футбольный клуб из Кировска. Основан в 2001 году. Дважды становился победителем зонального турнира первенства среди ЛФК.
«Псков-747» — российский футбольный клуб из Пскова. Основан весной 2006 года под названием «СК 747». Непродолжительное время именовался «747-Псков». С 2008 года играет во втором дивизионе, зоне «Запад», под нынешним названием.
«Распадская» — российский футбольный клуб из Междуреченска. Основан в 1994 году. Лучшее достижение в первенстве России — 15 место в зоне «Восток» второго дивизиона в 1998 году.
«Петровка, 38 — Смена» — российский футбольный клуб из Москвы. Основан в январе 2007 года под названием ФК «МУВД на ВВТ».
«Rambler — Кубок России по футболу 2008/2009 годов» — российский футбольный турнир среди профессиональных российских клубов, а также двух команд ЛФЛ. Проводился по системе с выбыванием начиная с 1/512 финала. Первая стадия турнира стартовала 16 апреля 2008 года. Впервые финал Кубка России был сыгран за пределами Москвы — матч состоялся 31 мая 2009 года в Химках на стадионе «Арена Химки».
«Истра» — российский футбольный клуб из одноимённого города в Московской области. В сезонах 2008, 2009, 2010 и 2011/12 выступал на профессиональном уровне во Втором дивизионе, зона «Запад». Обладатель Кубка Московской области 1999 и его финалист в сезоне 2005.
«Зо́ркий» — российский футбольный клуб из Красногорска Московской области. Выступал в Классе «Б» и второй лиге чемпионата СССР и Первенстве ПФЛ России (2017/18—2019/20). С сезона 2022/23 выступает во Второй лиге.
«Калу́га» — российский футбольный клуб из одноимённого города. Основан в 2002 году как футбольный клуб «МиК». Профессиональный статус и название «Калуга» получил 18 декабря 2009 года. В сезонах 2010—2022/23 выступал в третьем по уровню дивизионе России в группе 3. Наивысшим достижением команды в этот период являлось 5-е место в первенстве зоны «Центр» Второго дивизиона 2012/13, а также выход в 1/32 финала Кубка России в сезонах 2012/13 и 2016/17.
«Волгомост» — российский футбольный клуб из города Москвы. Создан 6 октября 2000 года на базе сборной команды ГУП «Мосгортранс», до апреля 2009 года носил название «Спартак-Авто». До сентября 2015 года клуб назывался «Столица».
На сегодняшний день в Подмосковье активно развивается 143 вида спорта: 12 зимних олимпийских, 43 летних олимпийских, 88 неолимпийских, а также национальные виды. По состоянию на 31 декабря 2008 года к услугам населения Московской области предоставлено 5765 физкультурно-оздоровительных и спортивных сооружений с единовременной пропускной способностью 147,7 тысяч человек. В их числе: 130 стадионов, 42 Дворца спорта и универсальных спортивных комплекса, 179 плавательных бассейнов, 1765 спортивных зала, 2503 плоскостных сооружений. Годовой прирост составил 220 спортсооружений с единовременной пропускной способностью 5,2 тысяч человек
«Динамо» Бийск — российский футбольный клуб из города Бийска. Основан в 1998 году.С 2008-го года по 2014-й год принимал участие в первенствах России среди команд 3-го дивизиона, зоны «Сибирь». С сезона 2015-го года «Динамо» прекратило выступление на межрегиональном уровне.
«Труд» — многофункциональный спортивный комплекс в подмосковном Подольске вместимостью 11 962 зрителя. В 2009, с 2011 по май 2017 и с 2018 по 2019 год являлся основной домашней ареной для футбольного клуба «Витязь», выступавшего сначала в первом дивизионе ПФЛ, затем во Втором дивизионе ПФЛ и Третьем дивизионе / ЛФЛ лиги «А», лиги «Б» с 2022 года относящейся к Четвёртому дивизиону. В 2020 году он проводит лишь часть матчей. Также был домашней ареной для ФК «Авангард» Подольск в 2009 году. В 2012 году сыграли матч смоленский ФК «Днепр» и мурманский ФК «Север» из-за занятости стадиона в Смоленске. В 2014 году один матч также провел ПФК ЦСКА, поскольку основной на тот момент стадион «Арена Химки» был дисквалифицирован на одну кубковую игру. На нем также играют множество любительских команд. Также в 2019 года играл женский футбольный клуб «Подольчанка». В 2024 году футбольный клуб «Калуга» провёл домашний матч на «Труде» из-за неготовности поля на калужской арене. Крупнейший стадион Чемпионата Московской области по футболу среди мужских команд и Первого женского дивизиона в зоне «Запад».
«Строгино́» — российский профессиональный футбольный клуб из одноимённого района города Москвы. С сезона 2013/14 выступает во Второй лиге. Домашние матчи проводит на стадионе «Янтарь».