Войдома — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Впадает в озеро Лендерское на реке Лендерке. Длина реки составляет 15 км, площадь водосборного бассейна 590 км².
- В 5,6 км от устья, по правому берегу реки впадает река Пюрика.
- В 0,3 км от устья, по левому берегу реки впадает река Мануноя.
Комариная — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии, параллельно проходящей менее чем в 10 км западнее государственной границе. Впадает в озеро Шаверы, через которое протекает река Лендерка. Длина реки составляет 16 км, площадь водосборного бассейна 80,2 км².
Короппи — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Впадает в губу Неунаш озера Тулос. Длина реки составляет 4,6 км, площадь водосборного бассейна — 325 км².
Кюляйоки — река в России, протекает по Суоярвскому району Карелии.
Лабийоки — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Мануноя — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 300 м по левому берегу реки Войдомы. Длина реки составляет 14 км.
Нижняя Охтома — река в России, протекает по Пудожскому району Карелии. Вытекает из болот западнее Водлозера, впадает в Водлозеро в 5 км северо-западнее деревни Кевасалма, в 8 км западнее деревни Куганаволок. Длина реки составляет 11 км. Высота устья — 136,3 м над уровнем моря.
Омельянйоки — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Пай — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 8 км от устья реки Термант по правому берегу. Длина реки составляет 11 км.
Пюрика — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Салма — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 1,5 км по левому берегу реки Нолы. Длина реки составляет 12 км, площадь водосборного бассейна — 177 км².
Сикапуро — река в России, протекает по Суоярвскому району Карелии. Впадает в Койтайоки с левого берега, длина реки составляет 13 км.
Термант — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Длина реки составляет 10 км, площадь водосборного бассейна — 46,2 км².
Шаверка — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 25 км от устья Хаапайоки по левому берегу. Длина реки составляет 17 км, площадь водосборного бассейна — 290 км².
Шаори — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Впадает в озеро Войдома — исток реки Войдомы. Длина реки составляет 13 км.
Сула — река в России, протекает в Муезерском районе Карелии Берёт своё начало из Лексозера, протекает через Каргиозеро. На берегу этого озера расположен единственный населённый пункт вблизи реки — Кимоваара. Сула впадает в одноимённое озеро. Длина Сулы составляет 21 км, площадь водосборного бассейна 3760 км².
Тула, Лужма или Туулийоки — река в России и Финляндии, российская часть реки протекает по территории Муезерского района Карелии. Длина Тулы составляет 16 км, площадь водосборного бассейна — 899 км².
Салмиозеро — озеро на территории Пенингского сельского поселения Муезерского района Республики Карелия.
Аймоозеро — озеро на территории Лендерского сельского поселения Муезерского района Республики Карелия.
Пюрика — озеро на территории Лендерского сельского поселения Муезерского района Республики Карелия.