Станция Токио (яп. 東京駅 То:кё: эки) — железнодорожный вокзал, расположенный в бизнес-квартале Маруноути района Тиёда, недалеко от Гиндзы и Императорского Дворца.
Синагава (яп. 品川駅 синагава эки) — железнодорожная станция в Японии, первая главная станция к югу от станции Токио и главный пересадочный пункт для поездов, используемых JR East, JR Central и Кэйкю. Токайдо-синкансэн и поезда на полуостров Миура, полуостров Идзу и регион Токай острова Хонсю проходят через станцию. Несмотря на название, станция находится не в районе Синагава, а в районе Минато. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Синдзюку (яп. 新宿駅 Синдзюку-эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальных районах Синдзюку и Сибуя японской столицы Токио.
Станция Итигая (яп. 市ヶ谷駅 итигая эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Тиёда, Токио.
Станция Аясэ (яп. 綾瀬駅 аясэ эки) — железнодорожная станция на линиях Тиёда и Дзёбан, расположенная в специальном районе Адати, Токио. Станция была открыта 1 апреля 1943 года. Линия Тиёда начала ходить до данной станции 20 апреля 1971 года. 20 декабря 1979 года открылась ветка Кита-Аясэ. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Кита-Сэндзю (яп. 北千住駅 кита сэндзю эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Адати, Токио. Станция была открыта 25 декабря 1896 года. Кита-Сэндзю является второй по загруженности станцией в сетях железных дорог Tobu Railway и Tokyo Metro. Также является 11-й по загруженности станцией JR East. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Иидабаси (яп. 飯田橋駅 иидабаси эки) — крупная железнодорожная станция на линиях Тюо-Собу, Оэдо, Тодзай, Юракутё и Намбоку, расположенная на границе специальных районов Синдзюку, Тиёда и Бункё в Токио. Станция обозначена номером E-05 на линии Оэдо, N-10 на линии Намбоку, T-06 на линии Тодзай и Y-13 на линии Юракутё. На станции установлены автоматические платформенные ворота. На станции установлены платформенные раздвижные двери.
Станция Готанда (яп. 五反田駅 готанда эки) — железнодорожная станция на линиях Яманотэ, Икэгами и Асакуса, расположенная в специальном районе Синагава в Токио. Станция обозначена номером A-05 на линии Асакуса. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Симбаси (яп. 新橋駅 симбаси эки) — крупная железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Минато, Токио. Станция обозначена номером A-10 на линии Асакуса, G-07 на линии Гиндза и U-01 на линии Юрикамомэ. На платформе станции линии Юрикамомэ установлены платформенные раздвижные двери. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Сугамо (яп. 巣鴨駅 сугамо эки) — железнодорожная станция на линиях Яманотэ и Мита, расположенная в специальном районе Тосима, Токио. Станция обозначена номером I-15 на линии Мита. Станция была открыта 1 апреля 1903 года. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Мэгуро (яп. 目黒駅 мэгуро эки) — железнодорожная станция на линиях Яманотэ, Мэгуро, Намбоку и Мита, расположенная в специальном районе Синагава в Токио. Станция обозначена номером I-01 на линии Мита и N-01 на линии Намбоку. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Канда (яп. 神田駅 канда эки) — железнодорожная станция на линиях Яманотэ, Кэйхин-Тохоку, Тюо (Скорая) и Гиндза, расположенная в специальном районе Тюо, Токио. Станция обозначена номером G-13 на линии Гиндза. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Уэно (яп. 上野駅 уэно эки) — крупная железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Тайто, Токио. В окрестностях станции находится Парк Уэно, на территории которого в свою очередь находятся Токийский национальный музей, Национальный музей западного искусства, Зоопарк Уэно, Токийский национальный университет изящных искусств и музыки. Станция также является одним из основных транспортных узлов в Токио. Неподалёку расположена станция Кэйсэй-Уэно, конечная станция линии Кэйсэй.
Станция Ниси-Ниппори (яп. 西日暮里駅 ниси ниппори эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Аракава в Токио. Станция обозначена номером C-16 на линии Тиёда и 02 на линии Ниппори-Тонэри Лайнер. На платформе станции линии Ниппори-Тонэри Лайнер установлены платформенные раздвижные двери. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Эбису (яп. 恵比寿駅 эбису эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Сибуя, Токио. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Минами-Сэндзю (яп. 南千住駅 минами сэндзю эки) — железнодорожная станция расположенная в специальном районе Аракава, Токио. Станция обозначена номером H-21 на линии Хибия и номером 04 на линии Tsukuba Express. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Юракутё (яп. 有楽町駅 ю:ракутё: эки) — железнодорожная станция на линиях Яманотэ, Кэйхин-Тохоку и Юракутё, расположенная в специальном районе Тиёда, Токио. Станция обозначена номером Y-18 на линии Юракутё. Секция JR East была открыта 25 июня 1910 года, секция Tokyo Metro 30 октября 1974 года. Станция соединена подземным переходом с находящейся неподалёку станцией Хибия. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Осаки (яп. 大崎駅 о:саки эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Синагава, Токио. Одна из станций, с которых составы линии Яманотэ начинают своё движение. Для этого предусмотрено 4 пути на, чтобы составы начинающие движение на данной станции не мешали остальным составам проходить её. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Ниппори (яп. 日暮里駅 ниппори эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Аракава в Токио. Станция обозначена номером 01 на линии Ниппори-Тонэри Лайнер. Станция JR East была открыта 1 апреля 1905 года, станция Кэйсэй — 19 декабря 1931 года. На станции установлены платформенные раздвижные двери. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Линия Уэно-Токио (яп. 上野東京ライン уэно то:кё: райн), ранее известная как Сквозная линия Тохоку (яп. 東北縦貫線 то:хоку дзю:кан сэн) — железнодорожная линия японского железнодорожного оператора East Japan Railway Company, соединяющая станции Уэно и Токио, служащая связным звеном между линиями Уцуномия, Такасаки и Дзёбан с одной стороны и линией Токайдо с другой. Реализация проекта начата 30 мая 2008 года. Линия была открыта 14 марта 2015 года, в то время как общая стоимость проекта составила около 40 миллиардов йен.