Токийский залив (яп. 東京湾 то:кё:-ван) — бухта на тихоокеанском побережье Японии. У Токийского залива расположена крупнейшая в мире агломерация Большой Токио, в которой живут 38 миллионов человек. Залив простирается с севера на юг на 60 км, а с запада на восток на 40 км. В нём находится также один из крупнейших портов Азии, а именно порт Йокогамы. На востоке залив отделён от открытого океана полуостровом Босо. С одного берега залива на другой можно попасть через Tōkyō-wan-Aqua-Line, уникальную комбинацию из моста и тоннеля.
Тоне или Тонегава (яп. 利根川 тонэ-гава) — река в Японии, протекает по территории региона Канто.
Сасе́бо (яп. 佐世保市 Сасэбо-си) — центральный город в Японии, находящийся в префектуре Нагасаки. Площадь города составляет 426,49 км², население — 255 347 человек, плотность населения — 598,72 чел./км². В Сасебо находился военно-морской арсенал, один из четырёх крупнейших военно-морских арсеналов Императорского флота Японии, ныне — судостроительная верфь компании Sasebo Heavy Industries, база Седьмого флота ВМС США и база Морских сил самообороны Японии.
Тикуго́ (яп. 筑後川 тикугогава) — крупнейшая река на острове Кюсю, Япония. Она протекает по территории префектур Кумамото, Оита, Фукуока и Сага. Впадает в Ариаке — залив Восточно-Китайского моря. Длина реки составляет 143 км, площадь водосборного бассейна — 2860 км². На территории её бассейна проживает около миллиона человек, крупнейшим городом является Курумэ. Согласно японской классификации, она является рекой первого класса.
И́се, Исе-ван (яп. 伊勢湾 исэ-ван, «залив Исе») или И́сеноу́ми (яп. 伊勢海 исэ-но-уми, «море Исэ») — залив Филиппинского моря в Японии, вдается в южное побережье центральной части острова Хонсю. Расположен в прибрежных водах префектур Айти и Миэ. С запада, севера и востока окружён полуостровами Сима, Тита и Ацуми. На севере в залив впадают реки Кисо, Нагара, Иби и Сёнай. На юго-востоке сообщается с заливом Микава через пролив Накаяма.
Сага́ми (яп. 相模湾 Сагамиван, Сагамский залив) — залив в северо-западной части Тихого океана, вдающийся в юго-западное побережье японского острова Хонсю. Залив омывает берега префектуры Канагава.
Хамана — солоноватое лагунное озеро на юге центральной части японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Сидзуока. Относится к бассейну Тихого океана, сообщаясь с ним на юге через пролив шириной 200 м, впадающий в залив (плёс) Энсю-Нада.
Хии (яп. 斐伊川 хиикава, варианты написания: Хиикава, Хии-Гава) — река в Японии на острове Хонсю. Протекает по территории префектур Тоттори и Симане через города Идзумо и Мацуэ и через озёра Синдзи и Накауми, и впадает в Японское море. Хии является крупнейшей рекой на востоке префектуры Симане. Длина реки составляет 153 км, площадь бассейна — 2540 км².
Сиракава (яп. 白川 сиракава, «белая река») — река в Японии на острове Кюсю. Протекает по территории префектуры Кумамото.
Залив Тояма или Бухта Тояма (яп. 富山湾 тояма-ван) — полузакрытый залив на японском побережье Японского моря.
Залив Кодзима (яп. 児島湾 кодзима-ван) — залив на севере Внутреннего Японского моря, расположен в префектуре Окаяма. В залив впадают реки Асахи и Ёсии и канал Хяккэн.
Залив Микава, Бухта Микава (яп. 三河湾 микава-ван) — полузакрытый залив, мелкий эстуарий в Японии на тихоокеанском побережье центральной части острова Хонсю. В залив впадают реки Яхаги и Тоё.
Залив Муцу (яп. 陸奥湾 муцу-ван) — полузакрытый залив или полузакрытое море в Японии на северной оконечности острова Хонсю, в префектуре Аомори. Залив сообщается с проливом Цугару через узкий пролив Тайрадате в своей северной части.
Беппу (яп. 別府湾 бэппу-ван) — залив в Японии в западной части Внутреннего Японского моря, на острове Кюсю, в префектуре Оита. Залив ограничен полуостровом Кунисаки с севера и полуостровом Саганосеки с юга.
Яцусиро (яп. 八代海 яцусиро-кай, «Море Яцусиро») — закрытый залив на западе Кюсю, на японском побережье Восточно-Китайского моря, расположен в префектурах Кагосима и Кумамото.
Сендай (яп. 仙台湾 сэндай-ван) — залив на западе Тихого океана, вдаётся в восточный берег японского острова Хонсю на территории префектур Мияги и Фукусима. Залив имеет полукруглую форму и ограничен на востоке полуостровом Осика, на западе — мысом Уноомисаки. Из залива в берег вдаются залив Исиномаки и мелкая бухта Мацусима, знаменитая своими островами.
Михо или Михо-Ван (яп. 美保湾 михо-ван) — бухта Японского моря на острове Хонсю. Залив простирается от мыса Дзидзо (яп. 地蔵崎) на западе до устья реки Амида (яп. 阿弥陀川) на востоке. Ширина залива составляет около 20 км, длина — около 10 км. Залив отделён песчаной косой (полуостровом) Юмигахама от озера Накауми, с которым он сообщается через пролив Сакаи
Татибана (яп. 橘湾 татибана-ван) — залив в Японии на острове Кюсю, на юго-востоке префектуры Нагасаки. Расположен между полуостровами Нагасаки и Симабара. В Японии называется также заливом Тидзива (яп. 千々石湾).
Осуми (яп. 大隅半島、おおすみはんとう о:суми-ханто:) — полуостров в Японии, на южной оконечности Кюсю, на юго-востоке префектуры Кагосима. На западе омывается водами залива Кагосима, который отделяет его от полуострова Сацума, а на востоке — Тихим океаном. В 1914 году извержение вулкана Сакурадзима, расположенного на одноимённом острове, превратило его в полуостров и соединило с Осуми.
Сибуси (яп. 志布志湾、しぶしわん сибуси-ван), также Ариаке (яп. 有明湾 ариакэ-ван) — полузакрытый залив Тихого океана в Японии на юге острове Кюсю, в префектуре Кагосима. Вдаётся с востока в полуостров Осуми и ограничен мысами Хидзаки (Хиносаки) и Тои-мисаки.