Пресмыка́ющиеся, или репти́лии (лат. Reptilia), — традиционно выделяемый класс преимущественно наземных позвоночных животных из клады амниот, включающий современных черепах, крокодилов, клювоголовых и чешуйчатых. Пресмыкающиеся являются парафилетической группой, так как дали начало птицам, но не включают их самих. В качестве монофилетической альтернативы класса выделяется клада завропсид, или рептилий в пересмотренном составе, в которую включают представителей традиционного класса пресмыкающихся и птиц.
Четвероно́гие, или тетрапо́ды (лат. Tetrapoda), — надкласс челюстноротых из группы костных позвоночных. Характерный признак четвероногих — наличие четырёх конечностей, обычно служащих для передвижения по суше. В некоторых группах конечности существенно видоизменились для полёта, плавания или редуцировались.
Кистепёрые рыбы (лат. Crossopterygii) — ранее выделявшаяся группа лопастепёрых рыб, которой присваивают ранг от надотряда до подкласса. Объединяет всех представителей лопастепёрых, не относящихся к двоякодышащим и четвероногим. В XXI веке таксон не используется.
Амниоты — клада четвероногих, характеризующаяся наличием зародышевых оболочек. Первые амниоты возникли в каменноугольном периоде, около 320 млн лет назад. Группа входит в состав надкласса четвероногих (Tetrapoda) и подразделяется на две дочерние клады: завропсиды и синапсиды.
Котилоза́вры (лат. Cotylosauria) — группа четвероногих позвоночных, в которую в разное время включались такие вымершие группы примитивных рептилий, как диадектоморфы, сеймуриаморфы, проколофониды, парейазавриды и капториноморфы. В разных классификациях ей присваивался ранг отряда, надотряда или подкласса. В современной систематике определённая в таком составе группа считается сборной, поэтому отдельный таксон «древних» котилозавров обычно больше не выделяется. Однако этим термином в ряде классификаций обозначается клада, включающая в числе прочего базальных амниот, то есть общих предков ныне живущих рептилий и млекопитающих. В таком случае, согласно правилам кладистики, все амниоты считаются котилозаврами.
Пеликоза́вры(лат. Pelycosauria) — группа наиболее древних примитивных синапсид, которой сторонники эволюционной таксономии присваивают ранг отряда. Сохраняли типично рептильную физиологию и внешний облик. Являются парафилетической группой; поэтому сторонники кладистической классификации не считают эту группу таксоном, а название её берут в кавычки: «пеликозавры».
Котла́ссии — род вымерших рептилиоморф из семейства Kotlassiidae отряда сеймуриаморф, живших во времена пермского периода на территории европейской части современной России. Включает единственный типовой вид Kotlassia prima.
Темноспонди́льные, или расчленённопозвонковые (лат. Temnospondyli, от др.-греч. τέμνειν — резать и σπόνδυλος — позвонок) — в высшей степени разнообразная группа вымерших животных, включающая от маленьких до гигантских примитивных земноводных. Название группы отсылает к тому, что каждый позвонок темноспондильных разделён на несколько частей.
Лантанозухи — род вымерших четвероногих из семейства лантанозухид (Lanthanosuchidae). Жили во времена пермского периода на территории современного Татарстана (Россия).
Сеймурии — род вымерших рептилиоморф из семейства Seymouriidae отряда сеймуриаморф, живших во времена раннепермской эпохи на территории современных Германии и США.
Сеймуриаморфы (лат. Seymouriamorpha) — клада примитивных четвероногих из верхнего палеозоя, которой придают ранг от надсемейства до отряда. Потомки антракозавров, первоначально считались примитивными рептилиями, потом — амфибиями. Иногда включаются в обширную сборную группу (подкласс) парарептилий, но чаще относят к кладе рептилиоморф. По морфологии промежуточны между амфибиями и рептилиями.
Аделоспондилы (лат. Adelospondyli) — отряд примитивных четвероногих («земноводных») раннего карбона. Систематическое положение неясно, вероятно, относятся к лепоспондилам, сближаются с аистоподами. Иногда включаются в состав микрозавров.
Рыбозме́и (лат. Ichthyophiidae) — семейство безногих земноводных, обитающих в Азии.
Синаптоза́вры (лат. Synaptosauria, от др.-греч. συν- — приставка со значением совместности действия, соучастия и σαῦρος — ящер) — ранее выделявшийся подкласс вымерших пресмыкающихся. Синонимичный термин — эвриапсиды.
Эмболомеры (лат. Embolomeri) — отряд или подотряд примитивных четвероногих, живших во времена верхнего карбона — нижней перми. Современные систематики относят его к кладе антракозавров-рептилиоморф, ранее рассматривали как подотряд темноспондильных амфибий.
Рептилиоморфы (лат. Reptiliomorpha) — в кладистике — клада, включающая амниот и всех вымерших четвероногих, более близких к ним, чем к земноводным. В ФилоКоде, предложенном в качестве альтернативного номенклатурного кодекса, также известны под названием Pan-Amniota.
Лепидоза́вры — надотряд пресмыкающихся из подкласса диапсид. Включает в себя два современных отряда: чешуйчатые и клювоголовые. Вымершие лепидозавры включают семейство мозазавров и другие группы.
Лабиринтодонты или лабиринтозубые (лат. Labyrinthodontia, от др.-греч. λαβύρινθος — «лабиринт», ὀδούς — «зуб»), — группа вымерших амфибий, обитавших на Земле в палеозойскую и мезозойскую эры. Традиционно имела ранг подкласса; в современной литературе часто рассматривается как безранговое и неформальное объединение в связи с парафилетичностью. Тем не менее выделение этой группы оказалось удобным и её продолжают использовать.
Диадектоморфы (лат. Diadectomorpha) — отряд крупных рептилиоморф из карбона и нижней перми Еврамерики и верхней перми Азии, очень близкий к родоначальникам амниот. Включают крупные плотоядные и еще более крупные травоядные формы, некоторые — полуводные, другие — полностью наземные. Диадектоморфы, видимо, возникли в верхнем миссисипии, но широкое распространение получили после коллапса каменноугольных лесов и процветали во времена верхнего пенсильвания и нижней перми. Несмотря на широкое распространение и видовое разнообразие диадектоморфы не были доминантами. Часто их описывают по фрагментарным останкам. В Еврамерике полностью вымирают на границе нижней и средней перми, из средней перми Татарстана известен один образец, который, возможно, относится к диадектам. Позднейший из найденных образцов Alveusdectes fenestratus происходит из верхней перми Цзиюань (Китай).
Ихтиостегалии (лат. Ichthyostegalia) — отряд ископаемых тетрапод, живших в девоне и являющихся примером переходной формы между лопастепёрыми рыбами и наземными позвоночными. Одни из первых хордовых, развивших конечности. Отряд рассматривается в составе амфибий, однако ихтиостегалии не являются прямыми предками современных земноводных, предки которых — лепоспондилы (Lepospondyli) — появились в каменноугольном периоде.