
Ра́менка — река в Юго-Западном административном округе Москвы, крупнейший правый приток Сетуни. Частично заключена в подземный коллектор. Часть долины реки от Парка 50-летия Октября до улицы Раменки и от Мичуринского проспекта до устья в 1991 году получила статус особо охраняемой природной территории и была объявлена памятником природы. На берегах реки находились деревни Раменки, Матвеевское, Гладышево и Каменная Плотина, село Воронцово, сельцо Шатилово, а также группы курганов вятичей. Вода Раменки загрязнена хлоридами и нефтепродуктами.

Чёрный ручей — малая река в районе Ивановское Восточного административного округа города Москвы, левый приток Серебрянки. Водоток трансформирован и частично убран в подземный коллектор. Название ручья связано с характером воды — грязной, тёмной от торфа.

Кра́сный руче́й — водоток на территории природно-исторического парка «Измайлово» в Восточном административном округе Москвы, левый приток Серебрянки. Питание ручья происходит в основном за счёт воды искусственного происхождения. Своё название получил от Красного пруда, вероятно, гидроним указывает на красно-бурый цвет воды.
Тепляко́вский овра́г — ручей на юге Москвы, в районе Чертаново Южное Южного административного округа, правый приток Городни. Частично протекает в подземном коллекторе. Поверхностный водоток сохранился в приустьевом участке на протяжении 500 метров, в верхнем и среднем течении засыпан.
Румя́нцевский ручей — малая река в районе Солнцево Западного административного округа города Москвы, правый приток Сетуни.
Нижний Богоро́дский ручей — малая река в районе Богородское Восточного административного округа города Москвы, левый приток реки Яузы. По состоянию на начало 2018 года заключена в подземный коллектор. Длина реки с временным водотоком в верховьях составляет 1,7 км, площадь водосборного бассейна — 1,5 км².
Буты́рский ручей — малая река в Северо-Восточном административном округе Москвы, верхний правый приток реки Неглинной. Своё название получил от одноимённой территории. Длина ручья составляла не более одного километра. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор, его верховья полностью засыпаны.
Большой Носков ручей (Носко́вка) — малая река в районе Капотня Юго-Восточного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Его длина составляет 2 км, в открытом русле — 0,4 км. Площадь водосборного бассейна — 2 км². По состоянию на начало 2018 года заключен в подземный коллектор, верховья засыпаны. Название реки происходит от фамилии Носков.
Воро́нинский овраг (Воронинский ручей) — малая река в районе Тёплый Стан Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Очаковки. Своё название получил от близлежащей деревни Воронино.
Е́льницкий руче́й — ручей в Восточном административном округе Москвы, правый приток реки Сосенки. Своё название получил в конце XX века по бывшей Ельницкой пустоши. По состоянию на начало 2018 года нижняя часть русла заключена в подземный коллектор.
Ко́птевский ручей — малая река в районах Коптево и Тимирязевский Северного административного округа Москвы, левый приток Жабенки. Устье расположено в Петровско-Разумовском заказнике. Название происходит от деревни Коптево. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор, низовья сохранились в виде залива Большого Садового пруда.
Лео́новский ручей — малая река в районах Свиблово и Ростокино Северо-Восточного административного округа Москвы, левый приток Яузы. Длина реки составляет 2,6 км. Первый гидроним произошёл от села и усадьбы Леоново, второй — от урочища Высково. Леоновским ручьём ошибочно называли реку Будайку и слив с Капустянского пруда. По состоянию на начало 2018 года почти целиком заключён в подземный коллектор.
Куми́нский Овраг — бывшая малая река в Северо-Западном административном округе Москвы, нижний правый приток реки Таракановки. Своё название получил от фамилии «Кумин». Длина ручья составляла 700 метров. Водоток проходил недалеко от Хорошевского шоссе.
Малый Носков ручей — малая река в районе Капотня Юго-Восточного административного округа Москвы, левый приток Большого Носкова ручья. Своё название получил от гидронима принимающей реки. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор.
Сре́дний ручей — малая река в районе Капотня Юго-Восточного административного округа Москвы, верхний левый приток Плинтовки. По состоянию на начало 2018 года заключена в подземный коллектор. Название отражает положение реки по отношению к Лесному ручью — второму притоку Плинтовки.
Плинто́вка — малая река в районе Капотня Юго-Восточного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Своё название получила от географического термина «плинтовка», который означает «участок пахотной земли на болоте». Речное русло заключено в подземный коллектор. По сообщению диггеров, вода Плинтовки сильно загрязнена нефтепродуктами. Питание реки осуществляется за счёт её притоков — Лесного и Среднего ручьёв.
Путя́евский ручей — малая река в районе Сокольники Восточного административного округа Москвы, правый приток Яузы. На реке расположен каскад из шести прудов, который способствует очищению загрязнённой воды ручья. Название антропонимическое.
Тро́ице-Лы́ковский руче́й — малая река в районе Строгино Северо-Западного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки. Верховья засыпаны, речное русло трансформировано и заключено в подземный коллектор. Название получил от бывшего села Троице-Лыково.
Хохло́вка — малая река в Нижегородском районе Юго-Восточного административного округа Москвы, правый приток Нищенки. Своё название получила от деревни Хохловки и исторической местности Калитники. По состоянию на начало 2018 года речное русло убрано в подземный коллектор.
Студене́ц — малая река в Алексеевском районе Северо-Восточного административного округа Москвы, правый приток Копытовки. Водоток на всём протяжении заключён в подземный коллектор. Название происходит от географического термина «студенец», который означает «источник, родник, колодец, дающий холодную воду».