Би́тца — река на юго-западе Москвы и в Московской области, значительный левый приток Пахры, второй по длине и мощности. В верховьях Битцы находятся памятники природы: усадьба «Малое Голубино», «Старый ельник в усадьбе Знаменское-Садки», Знаменский смешанный лес и Знаменская суборь. В долине реки расположены экологические тропы, по которым проходят экскурсии. Купание в реке запрещено.
Ка́менка — река в Северо-Восточном административном округе Москвы, правый приток Яузы. Частично заключена в подземный коллектор. Название Каменка характерно для рек с каменистым руслом. К югу от улицы Академика Комарова по правому берегу реки находился Кашёнкин луг, от которого Каменка получила название Кашенка. Приустьевый участок Каменки является прежним руслом Яузы.
Ка́менка — малая река в районе Крюково города Зеленограда, левый приток Горетовки. Речное русло на некоторых участках заключено в подземный коллектор. Название реки указывает на каменистое русло. На левом берегу находится деревня Каменки, на правом — Кукуевка. Правым притоком реки является ручей Кукуевская балка. В долине Каменки расположены многочисленные родники.
И́чка — река в Москве и Московской области России, левый приток Яузы. Большая часть водосборного бассейна находится на лесной территории национального парка «Лосиный Остров», поэтому Ичка — одна из самых чистых московских рек. Часть речной долины в 1991 году объявили памятником природы. По состоянию на 2018-й она является ландшафтным заказником «Долина реки Ички» общей площадью 81,4 га. На берегах Ички находились пустошь Свитягина и деревня Малые Мытищи. Левыми притоками реки являются ручьи Каменный и Лось.
Жа́бенка — река в Тимирязевском районе Северного административного округа Москвы, правый приток Лихоборки. Своё название получила от слова «жаба». Речное русло частично заключено в подземный коллектор. Вода Жабенки загрязнена нефтепродуктами и солями тяжёлых металлов. Левым притоком реки является Коптевский ручей, правым — Фермерский ручей.
Я́звенка — водоток в Москве и Московской области, правый приток Городни. На территории города протекает по границе районов Бирюлёво Восточное, Орехово-Борисово Южное и Орехово-Борисово Северное Южного административного округа. Речное русло в некоторых местах искусственно трансформировано, река частично заключена в подземный коллектор. По степени техногенной трансформации относится к I классу — сохранилась в открытом течении более чем на 90%.
Ольша́нка — ручей в районах Лианозово и Бибирево Северно-Восточного административного округа Москвы, правый приток Чермянки. Водоток практически на всём протяжении заключён в подземный коллектор. По степени техногенной трансформации река относится к III классу — в открытом течении проходит на 10—49%, русло сильно трансформировано.
Синичка — малая река на территории районов Соколиная Гора, Лефортово и Басманный города Москвы, левый приток Яузы. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — речное русло с 1950 года заключено в подземный коллектор, поверхностный водоток утрачен.
Напру́дная — небольшая река в Мещанском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Неглинной. С 1910 года протекает в подземном коллекторе. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — поверхностный водоток утрачен, русло канализировано более чем на 90 %.
Ра́стань — ручей в районе Нагатино-Садовники Южного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки. Водосборный бассейн застроен, река протекает в подземном коллекторе.
Шмелёвка — малая река в Южном административном округе Москвы, правый приток Городни. Частично заключена в подземный коллектор, по степени техногенной трансформации относится ко II классу — на поверхности находится около 50—90 % водотока, русло умеренно трансформировано. Долина реки в 1991 году была объявлена памятником природы.
Журавенка — река в Москве и Московской области, левый приток Битцы. Исток расположен в районе Бирюлёво Восточное Южного административного округа Москвы, устье — в Ленинском районе Московской области на территории городского поселения Видное. Является самым крупным притоком Битцы, в бассейне Журавенки находится 8 водоёмов. Правыми притоками реки являются овраги Никольский, Суслов и Гузеев.
Грачёвка — река в России, в городском округе Химки Московской области и Москве, правый приток Химки. Частично протекает в открытом русле. Длина около 6 км. Нижние 1,7 км затоплены Химкинским водохранилищем, образуя Бутаковский залив. На территории Москвы 1,3 км.
Алту́фьевский пруд (Самотёчный) — водоём в районе Лианозово Северо-Восточного административного округа города Москвы. Расположен между Абрамцевской улицей, МКАД, Алтуфьевским шоссе и Вологодским проездом.
Котляко́вский ручей — малая река в районе Москворечье-Сабурово Южного административного округа Москвы, левый приток Чертановки. Название происходит от деревни Котляково. По состоянию на начало 2018 года ручей заключён в подземный коллектор, его долина засыпана, местность застроена промышленной зоной.
Лени́вка — бывшая малая река в районе Хамовники Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Получил название благодаря своему медленному, спокойному течению. На берегу ручья располагался Ленивый Торжок, то есть рынок. Гидроним Волхонка, возник от одноимённой улицы.
По состоянию на начало 2018 года заключена в подземный коллектор или полностью засыпана.
Лео́новский ручей — малая река в районах Свиблово и Ростокино Северо-Восточного административного округа Москвы, левый приток Яузы. Длина реки составляет 2,6 км. Первый гидроним произошёл от села и усадьбы Леоново, второй — от урочища Высково. Леоновским ручьём ошибочно называли реку Будайку и слив с Капустянского пруда. По состоянию на начало 2018 года почти целиком заключён в подземный коллектор.
Ма́линский ручей — малая река в районе Крюково города Зеленограда, левый приток Горетовки. Своё название получил от дачного посёлка Малино.
Путя́евский ручей — малая река в районе Сокольники Восточного административного округа Москвы, правый приток Яузы. На реке расположен каскад из шести прудов, который способствует очищению загрязнённой воды ручья. Название антропонимическое.
Троеку́ровский руче́й — малая река в районе Очаково-Матвеевское Западного административного округа Москвы, правый приток Сетуни. Своё название получил от бывшего села Троекурово.