Би́тца — река на юго-западе Москвы и в Московской области, значительный левый приток Пахры, второй по длине и мощности. В верховьях Битцы находятся памятники природы: усадьба «Малое Голубино», «Старый ельник в усадьбе Знаменское-Садки», Знаменский смешанный лес и Знаменская суборь. В долине реки расположены экологические тропы, по которым проходят экскурсии. Купание в реке запрещено.
Серебря́нка — река в Восточном административном округе Москвы, левый исток Хапиловки. В прошлом считалась левым и самый крупным притоком Сосенки. По степени техногенной трансформации Серебрянка относится ко II классу — на поверхности находится около 50—90 % водотока, русло умеренно трансформировано.
Ка́менка — река в Северо-Восточном административном округе Москвы, правый приток Яузы. Частично заключена в подземный коллектор. Название Каменка характерно для рек с каменистым руслом. К югу от улицы Академика Комарова по правому берегу реки находился Кашёнкин луг, от которого Каменка получила название Кашенка. Приустьевый участок Каменки является прежним руслом Яузы.
Хи́мка — река в Москве и Московской области, левый приток Москвы-реки. По степени техногенной трансформации относится к I классу — сохранилась в открытом русле более чем на 90 %. По величине Химка является четвёртым левым притоком Москвы в черте города, уступая Яузе, Сходне и Нищенке.
Ольша́нка — ручей в районах Лианозово и Бибирево Северно-Восточного административного округа Москвы, правый приток Чермянки. Водоток практически на всём протяжении заключён в подземный коллектор. По степени техногенной трансформации река относится к III классу — в открытом течении проходит на 10—49%, русло сильно трансформировано.
Ра́менка — река в Юго-Западном административном округе Москвы, крупнейший правый приток Сетуни. Частично заключена в подземный коллектор. Часть долины реки от Парка 50-летия Октября до улицы Раменки и от Мичуринского проспекта до устья в 1991 году получила статус особо охраняемой природной территории и была объявлена памятником природы. На берегах реки находились деревни Раменки, Матвеевское, Гладышево и Каменная Плотина, село Воронцово, сельцо Шатилово, а также группы курганов вятичей. Вода Раменки загрязнена хлоридами и нефтепродуктами.
Саморо́динка — малая река в районах Проспект Вернадского и Тропарёво-Никулино Западного административного округа, Обручевский Юго-Западного административного округа Москвы, правый приток Очаковки. Частично заключена в подземный коллектор, русло сильно трансформировано. В истоках Самородинки, у станции метро «Беляево», находилась деревня Беляево, на правом берегу возле устья — деревня Никольское. Долина Самородинки в 1991 году была объявлена памятником природы.
Напру́дная — небольшая река в Мещанском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Неглинной. С 1910 года протекает в подземном коллекторе. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — поверхностный водоток утрачен, русло канализировано более чем на 90 %.
Золото́й Рожо́к — малая река в районе Лефортово Юго-Восточного административного округа города Москвы, левый приток Яузы. С 1935 года протекает в подземном коллекторе. На правом берегу ручья расположена усадьба Строгановых. От гидронима ручья произошли названия: Золоторожская набережная, Золоторожская улица, Золоторожский Вал, Верхний Золоторожский переулок, Средний Золоторожский переулок и Золоторожский проезд.
Ка́пля (Ка́пелька) — ручей в Мещанском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Напрудной. Водоток проходит в подземном коллекторе.
Ра́стань — ручей в районе Нагатино-Садовники Южного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки. Водосборный бассейн застроен, река протекает в подземном коллекторе.
Алту́фьевская речка (Самотёка) — водоток в северной части Москвы, правый приток реки Чермянки. Длина примерно 5 км. Берёт начало из пруда рядом с селом Алтуфьево, проходит практически сразу же под Алтуфьевским шоссе и вдоль Алтуфьевского кладбища, затем вдоль северной границы Алтуфьевского лесопарка, ниже Мелиховской улицы заключена в бетонную конструкцию.
Грачёвка — река в России, в городском округе Химки Московской области и Москве, правый приток Химки. Частично протекает в открытом русле. Длина около 6 км. Нижние 1,7 км затоплены Химкинским водохранилищем, образуя Бутаковский залив. На территории Москвы 1,3 км.
Воро́нинский овраг (Воронинский ручей) — малая река в районе Тёплый Стан Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Очаковки. Своё название получил от близлежащей деревни Воронино.
Дани́ловский ручей (Дани́ловка, Худе́ница) — малая река Южного административного округа Москвы в бывшей Даниловской слободе, правый приток Москвы-реки. Своё название получил от Данилова монастыря, вдоль которого проходил водоток. Гидроним «Худеница» возник по урочищу, которое располагалось на этой территории. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор.
Горбута́нский овраг — малая река в районе Орехово-Борисово Южное Южного административного округа Москвы, левый приток Кузнецовки в Зябликовском лесопарке. Точное происхождение названия неизвестно, вероятно гидроним связан с географическим термином «горб» в значении «холм, бугор, гора».
Завья́ловский ручей — малая река Южного административного округа Москвы, левый приток Битцы. Внутри МКАД заключён в подземный коллектор. Ниже кольцевой автодороги проходит в открытом русле к востоку от Курской железной дороги. Название ручья происходит от фамилии Завьялов.
Заха́рковский овраг — бывшая малая река в районе Южное Тушино Северо-Западного административного округа Москвы, правый приток Химки на южной границе Захарковского сада. По состоянию на начало 2018 года ручей сохранился в виде небольшого залива Химкинского водохранилища напротив Северного речного вокзала. Вдоль Химкинского бульвара заключён в подземный коллектор. Своё название получил от деревни Захарково.
Соровский овраг — малая река в районе Орехово-Борисово Южное Южного административного округа Москвы, нижний правый приток Шмелёвки. Возможно, своё первое название река получила от антропонима. Точное происхождение гидронима «Змеёвка» неизвестно. В книге Юрия Андреевича Насимовича «Реки, озёра и пруды Москвы» указывается, что так обычно называют петляющие реки, что не соответствует прямому руслу Соровского оврага. Вероятно, это наименование обозначает возможное обитание змей вдоль реки.
Садко́вский овраг — малая река в районе Орехово-Борисово Южное Южного административного округа Москвы, верхний левый приток Шмелёвки. Точное происхождение названия не известно. Возможно, своё наименование овраг получил от фамилии Садков. Также гидроним может происходить от слова «садки», которым называли пруды для разведения рыбы или населённые пункты у таких водоёмов.