Помацентровые, или рифовые рыбы (лат. Pomacentridae), — семейство ярко окрашенных тропических лучепёрых рыб. Ранее его включали в состав отряда окунеобразных (Perciformes), с 2016 года рассматривают как incertae sedis в составе подсерии Ovalentaria. Насчитывают 387 видов, объединяемых в 29 родов и 4 подсемейства. Распространены преимущественно в Индийском и Тихом океанах, а также в тропических водах Атлантики.
Плезиопсовые, или плезиоповые (лат. Plesiopidae), — семейство лучепёрых рыб. Ранее его включали в состав отряда окунеобразных (Perciformes), с 2016 года рассматривают как incertae sedis в составе подсерии Ovalentaria. Обитают в Индийском и Тихом океанах.
Галаксиины (лат. Galaxiinae) — подсемейство лучепёрых рыб семейства галаксиевых (Galaxiidae), в состав включают 5 родов с 47 видами.
Галаксии — род лучепёрых рыб семейства галаксиевых (Galaxiidae).
Харацинообразные, или хараксообразные (лат. Characiformes), — отряд пресноводных лучепёрых рыб. Характерная черта — наличие жирового плавника, который также характерен для отрядов сомообразных и лососеобразных. В основном — некрупные стайные пресноводные рыбы.
Собачкообразные (лат. Blenniiformes) — отряд лучепёрых рыб из надотряда колючепёрых. Ранее рассматривался в ранге подотряда собачковидных в отряде окунеобразных. Морские, солоноватоводные и пресноводные рыбы. В отряде собачкообразных выделяют 6 семейств с 150 родами и 918 видами.
Бельдюговые — семейство лучепёрых рыб из отряда скорпенообразных.
Луциановые (лат. Lutjanidae) — семейство лучепёрых рыб отряда окунеобразных. Представители семейства живут в прибрежных тропических и субтропических морях Атлантического океана и Индо-Тихоокеанской области, редко в солоноватой воде и эстуариях. Многие виды являются ценными промысловыми рыбами.
Перкопсообразные, или лососеокунеобразные (лат. Percopsiformes), — очень маленький отряд лучепёрых рыб из надотряда Paracanthopterygii. В состав отряда входит всего 11 видов.
Солнечникообразные (лат. Zeiformes) — отряд морских лучепёрых рыб, включающий в себя 33 вида, в основном глубоководных, из шести семейств. Распространены во всех океанах.
Эвселяхии (лат. Euselachii) — подкласс хрящевых рыб, представленный двумя современными группами и близкими им вымершими группами. Некоторые авторы включают в состав таксона также вымершую группу пресноводных рыб, сходных с акулами — ксенакантообразных. Имеют анальный плавник и два спинных плавника с шипом.
Салама́ндровая лепидогала́ксия — вид пресноводных лучепёрых рыб, единственный представитель рода Lepidogalaxias, семейства лепидогалаксиевых (Lepidogalaxiidae) и отряда лепидогалаксиеобразных (Lepidogalaxiiformes). Эндемик юго-западной Австралии.
Волосохвостые, или рыбы-сабли (лат. Trichiuridae) — семейство морских лучепёрых рыб отряда скумбриеобразных (Scombriformes).
Голоцентровые, или рыбы-белки, или рыбы-солдаты (лат. Holocentridae), — семейство лучепёрых рыб, единственное в отряде голоцентрообразных (Holocentriformes). Ранее последний классифицировался как подотряд голоцентровидных (Holocentroidei) в отряде бериксообразных. Распространены циркумглобально в морских тропических водах.
Пятнистая галаксия — вид лучепёрых рыб из семейства галаксиевых (Galaxiidae). Распространены в Южном полушарии. Амфидромные рыбы. Большую часть жизни проводят в пресной воде, нерестятся в устьях рек и эстуариях. Личинки и молодь в течение 6 месяцев нагуливаются в море, а затем возвращаются в родную реку.
Зенархоптеровые (лат. Zenarchopteridae) — семейство лучепёрых рыб из отряда сарганообразных. Ранее рассматривалось в ранге подсемейства в семействе полурыловых (Hemiramphidae). В 2004 году статус повысили до уровня семейства. Пресноводные и эстуарные рыбы. Распространены в Индо-Тихоокеанской области.
Саргановые (лат. Belonidae) — семейство лучепёрых рыб отряда сарганообразных (Beloniformes). Морские, солоноватоводные и пресноводные рыбы. Представители семейства распространены в умеренных, субтропических и тропических водах всех океанов. Несколько пресноводных видов встречаются в водоёмах Южной, Юго-Восточной Азии, Северной и Южной Америки. Размеры представителей семейства варьируют от 4,8 см у Belonion dibranchodon, до 153 см у Tylosurus acus. Питаются в основном мелкими рыбами, в состав рациона также входят ракообразные и мелкие головоногие.
Пристигастеровые (лат. Pristigasteridae) — семейство лучепёрых рыб из отряда сельдеобразных (Clupeiformes). Преимущественно морские рыбы, распространены в тропических и субтропических водах всех океанов. Несколько пресноводных видов из Южной Америки и Юго-Восточной Азии.
Хирургообразные (лат. Acanthuriformes) — отряд лучепёрых рыб из надотряда колючепёрых, ранее рассматривался в качестве подотряда хирурговидных (Acanthuroidei) в отряде окунеобразных.
Бутовые (лат. Butidae) — семейство лучепёрых рыб из отряда бычкообразных (Gobiiformes). Ранее в ранге подсемейства включали в состав семейства элеотровых (Eleotridae), а с 2016 года рассматривают в качестве отдельного семейства. Прибрежные и пресноводные рыбы. Распространены в Индо-Тихоокеанской области и западной Африке. Максимальная длина тела 65 см.