55°42′14″ с. ш. 37°31′19″ в. д.HGЯO

Гербарий Московского университета

Перейти к навигацииПерейти к поиску
Гербарий Московского университета
(Гербарий МГУ)
Зал Гербария Московского университета
Зал Гербария Московского университета
Международное название MW
Основан1765
Директор вакантно
Сотрудников7
Расположение Россия: Москва, Ленинские горы, д. 1, стр. 12, аудитории 401 и 501
Сайтplant.depo.msu.ru
НаградыВики-премия «Свободные знания» (2018)
Логотип Викисклада Медиафайлы на Викискладе

Герба́рий Моско́вского университе́та (также — Гербарий и́мени Сыре́йщикова) — старейший и второй по величине гербарий России. Возник, вероятно, около 1765 года. Является структурным подразделением кафедры геоботаники биологического факультета МГУ.

Объём основных фондов — 1 030 669 образцов (на ноябрь 2017 года)[1], прирост фондов в 2016 году — 22 013 образцов. Имеет международный акроним MW. В основных фондах гербария хранятся образцы, принадлежащие 37 100 видам сосудистых растений и 2223 видам мохообразных[2].

Находится на 62-м месте по объёму фондов среди всех гербариев мира, на 24-м месте среди гербариев вузов.

В гербарии сосредоточены важнейшие коллекции по флоре средней полосы России, важные коллекции по флоре других регионов России, Кавказа, Средней Азии, Казахстана, Монголии, а также по мохообразным России; важные именные коллекции (Георга Гофмана, Фридриха Эрхарта, Карла Триниуса, отца и сына Форстеров, а также коллекции, имеющие отношение к Карлу Линнею).

В конце 2015 года в гербарии работало шестеро сотрудников и до 15 внештатных помощников. В начале XXI века гербарий посещали более 50 посетителей в год[3].

В 2015 — 2017 гг. в рамках проекта Московского университета по созданию национального банка-депозитария живых систем осуществлена полная оцифровка (сканирование, создание базы данных) фондов Гербария. На конец 2017 года отсканированы и опубликованы в интернете сканы 911 тыс. образцов[4].

История

Основная статья: История Гербария Московского университета

Коллекции

Основная статья: Коллекции Гербария Московского университета
Основная статья: Отдел Восточной Европы в Гербарии Московского университета
Основная статья: Отдел Крыма в Гербарии Московского университета
Основная статья: Отдел Кавказа в Гербарии Московского университета
Основная статья: Отдел Сибири и Дальнего Востока в Гербарии Московского университета
Основная статья: Отдел Средней Азии и Казахстана в Гербарии Московского университета
Основная статья: Зарубежные отделы в Гербарии Московского университета
Основная статья: Гербарий мохообразных в Гербарии Московского университета
Основная статья: Herbarium Alchemillarum в Гербарии Московского университета
Основная статья: Немонтированные коллекции в Гербарии Московского университета

Коллекторы

Многие ботаники и естествоиспытатели передавали свои коллекции в Гербарий МГУ. Это прежде всего сотрудники и профессора Московского университета, его выпускники, а также видные учёные, пересылавшие дублеты своих сборов из других учреждений. Важнейшие коллекторы Гербария Московского университета, о которых имеются статьи в Википедии, перечислены ниже в алфавитном порядке:

Научная деятельность

Основная статья: Научная деятельность Гербария Московского университета

Исходя из размеров и научной деятельности того или иного гербария, за ними закрепляется право определенного количества голосов на Номенклатурной секции Международного ботанического конгресса. Цель заседаний Номенклатурной секции — внесение текущих изменений в Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений. На Конгрессе в Шэньчжэне (июль 2017 г.) за российскими Гербариями закреплено 24 голоса из 926, в т.ч. три голоса за Гербарием МГУ [5]. Это на один голос больше, чем в 2011 году.

Оцифровка коллекций

Ранее, в конце 1990-х — начале 2000-х гг. при поддержке РФФИ (грант № 98-07-91048э) было отсканировано и размещено в Интернете (http://herba.msu.ru/pictures/mw_type/index.html) около 600 изображений типов гербария МГУ. Кроме того, 63 образца были изданы на CD «Herbarium Linnaeanum». С тех пор работы по оцифровке не получали специального финансирования и были приостановлены.

В рамках комплексной программы «Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем» (грант РНФ № 14-50-00029) по направлению «Растения» Гербарий МГУ получил финансирование на оцифровку коллекций. Коллектив гербария задался целью за три года перевести в цифровой вид и представить в Интернете около 1 млн образцов из фондов гербария МГУ. Согласно приоритетам РНФ (Арктика, Дальний Восток), в качестве пилотных объектов по оцифровке фондов в 2015 г. были выбраны отделы Сибири — Дальнего Востока и Восточной Европы. В 2005 г. сотрудниками были подведены итоги инвентаризации фондов Гербария, занявшей более 10 лет. В последующие годы табличная база данных ежегодно актуализировалась, в ней учитывались новые включения и переопределения. Перед началом работ по оцифровке была выполнена работа по верификации содержательной части базы по сосудистым растениям[6].

Каждый из образцов до сканирования проходил через несколько процедур, необходимых для получения информативных изображений. На каждый лист был наклеен штрихкод международного стандарта с уникальным идентификатором образца. Далее у каждого образца открывалась этикетка (если она была закрыта растением или сложена), важные отломанные фрагменты растений прикреплялись к образцу, проверялось наличие ярлыков с переопределениями и порядок расположения фондового материала. В редких случаях приходилось заменять ветхие обложки, исправлять указатели, размещать образцы мелкого формата на стандартных листах монтировочной бумаги, повторно проверять номенклатуру. Всего в этой работе (вместе с помощниками) принимало участие 65 человек.

Сканирование коллекции велось силами компании-партнера. Этот процесс осуществлялся согласно техническому заданию со следующими основными параметрами изображений. Основное изображение: формат TIFF, 300 dpi; размер файла до 60 MB; массив свыше 30TB. Копия: формат JPG, 300 dpi; сжатие 80 %; размер файла до 2,5 MB; массив около 1,5 TB. Этапы машинной обработки включали: разворот на 90 градусов, обрезку чёрного поля, доворот до прямого угла, распознавание штрихкода, создание JPG-копии[7].

Научной группой осуществлялась выдача материала на сканирование, обратное вкладывание образцов в обложки, проверка комплектности, возврат в места постоянного хранения. Кроме того, при необходимости выполнялась внеплановая работа: проверка качества изображений после калибровки сканеров; поиск и выдача образцов, отсканированных с физическим браком; поиск образцов с пропущенными штрихкодами; поиск пропущенных образцов; проверка списков папок, отсутствовавших в БД; проверка дублированных файлов.

Созданная в 2015 г. коллекция изображений отсканированных гербарных образцов из фондов гербария МГУ насчитывала сканы 502 тыс. образцов, из которых 156 тыс. из отдела Сибири — Дальнего Востока и 346 тыс. из отдела Восточной Европы[8].

В 2016 году отсканированы отделы Кавказа, Крыма, Монголии, Зарубежной Азии, Herbarium Alchemillarum и типовые образцы (около 215 000 образцов), а также этикетки с конвертов гербария мхов (73 тыс. образцов)[9].

В 2017 году отсканированы отделы Средней Азии и Казахстана (96 000 образцов), Америки (12 000 образцов), а также этикетки с конвертов гербария печеночников (4 тыс. образцов) и новые включения[10].

В 2018 году отсканированы отделы Западной Европы (40 000 образцов), Австралии и Океании (3 300 образцов), а также новые включения. В начале ноября 2018 года работы по оцифровке коллекции полностью завершены[11].

Цифровой гербарий МГУ

Станислав Козловский вручает Алексею Серёгину премию «Свободные знания» за проект «Цифровой гербарий МГУ»

В результате оцифровки фондов в 2015—2017 гг. объём Цифрового гербария МГУ на 1 января 2018 года составил 911 тысяч образцов[12]. По результатам трёх лет проекта Гербарий МГУ занимает восьмое место в мире по объёмам оцифрованных и опубликованных в интернете фондов (уступает гербариям P, L, NY, PE, US, BR, MEXU)[13]. Он обладает крупнейшими оцифрованными коллекциями по флоре России, Украины, Белоруссии, Молдавии, Казахстана, Латвии, государств Закавказья (кроме Армении), Монголии, Казахстана и четырёх республик Средней Азии[14]. Кроме того, это вторая по величине точка доступа к оцифрованным гербарным образцам из Армении, Литвы, КНДР, Мали и третья для Кипра и Вьетнама.

Публикация отсканированных образцов ведется через двуязычный портал Национального банка-депозитария живых систем (доступны как публичная[15], так и операционная[4] версии). На 1 января 2018 года на портале содержались отсканированные изображения 910 820 гербарных образцов, принадлежащих к 35 615 видам сосудистых растений и мхов[4].

Идет работа по наполнению Цифрового гербария МГУ полными метаданными отсканированных образцов, которые включают текст оригинальных этикеток и географические координаты мест сбора каждого образца. Эта работа осуществляется с привлечением волонтёров[16]. На 7 ноября 2018 года географические привязки доступны для 288 751 образцов, для 122 906 образцов в базу данных внесён полный текст этикеток, а ещё для 339 396 образцов отдельные элементы этикеток распознаны автоматически с помощью OCR[4]. С октября 2017 года геопривязка образцов осуществляется с использованием разработанной системы «ИСТРА» (Интеллектуальная Система Топонимического Распознавания и Атрибутирования), которая автоматически привязывает образцы растений к географической точке[17].

Цифровой гербарий МГУ — крупнейший донор информации о биоразнообразии России для Global Biodiversity Information Facility, международной платформы-агрегатора пространственных биологических данных. Информация о гербарных образцах из Московского университета составляет 65 % от общего объёма электронных данных, опубликованных на GBIF российскими учреждениями, и 23 % от всех имеющихся на GBIF данных о биоразнообразии России[18][19].

Атлас флоры России

Основная статья: Флора России (интернет-проект)

На платформе iNaturalist сотрудниками Гербария МГУ организован сбор данных по флоре России на основе принципов «гражданской науки»[20]. Это проект «Флора России». Любой пользователь может загрузить фотографию растения и отметить точку съёмки на карте. После проверки определения данные получают «исследовательский уровень» и также экспортируются в GBIF. Проект был запущен в середине января 2019 года как соревнование между региональными командами[21]. За первый месяц он привлёк более тысячи участников, а число загруженных наблюдений превысило 30 тысяч[22].

В конце октября 2019 года на «Флоре России» было уже более 200 тысяч изображений, выложенных 3670 участниками[23].

Примерно пятая часть изображений на «Флоре России» остается под несвободной лицензией. По состоянию на декабрь 2019 года под свободной лицензией были 225 885 изображений от 3832 человек, а под несвободными лицензиями оставались 45 722 изображений (20,2 % от общего числа загруженных) от 2258 пользователей[24].

В платформу встроено автоматическое распознавание растений на основе нейросети. Каждая загруженная фотография после проверки определения экспертами используется для обучения системы, что вкупе с пространственными данными о распространении растений позволяет совершенствовать алгоритмы машинного определения[25].

Информация для посетителей

Гербарий Московского университета открыт для профессиональных ботаников, ведущих научные исследования, с понедельника по пятницу с 9 до 17 часов без предварительного уведомления. Гербарий расположен в биолого-почвенном корпусе МГУ в аудиториях 401 и 501. Сотрудники Гербария, по предварительному согласованию, устраивают ознакомительные экскурсии для непрофессиональных посетителей[1].

Заведующий Гербарием в 2017 году — член-корреспондент РАН, заслуженный профессор МГУ, доктор биологических наук Вадим Николаевич Павлов[1].

Гербарий постоянно привлекает к работе волонтёров, имеющих начальные познания в ботанике[26][27].

С лета 2017 года в Гербарии МГУ открыта конкурсная программа трёх-шестимесячных стажировок для аспирантов российских организаций. Осенью 2017 года открыта программа бесплатных стажировок по программе менторства для студентов естественных факультетов московских вузов[28].

См. также

Ссылки

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 Herbarium Details: Moscow State University (англ.). Index Herbariorum. International Plant Science Center; The New York Botanical Garden (декабрь 2010). Дата обращения: 15 октября 2014. Архивировано 23 марта 2012 года.
  2. ↑ Ох ты, ну не хрена ж себе | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.
  3. ↑ Коллекции. depo.msu.ru. Дата обращения: 8 февраля 2018. Архивировано 8 февраля 2018 года.
  4. ↑ 1 2 3 4 Депозитарий живых систем. plant.depo.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 1 мая 2023 года.
  5. ↑ Архивированная копия. Дата обращения: 15 марта 2020. Архивировано из оригинала 2 февраля 2017 года.
  6. ↑ А. П. Серёгин, Т. П. Баландина, Н. С. Гамова, К. В. Дудова, Н. К. Шведчикова. Гербарий Московского университета (MW) в 2015 году: первый год новой эры. — 2016. — С. 94–97. Архивировано 2 мая 2023 года.
  7. ↑ Alexey Seregin, T.P. Balandina, N.S. Gamova, K.V. Dudova, N.K.Shvedchikova. Гербарий Московского университета (MW) в 2015 году: первый год новой эры. — 2016. — doi:10.13140/RG.2.1.2119.0004.
  8. ↑ Alexey P. Seregin. Making the Russian Flora Visible: Fast Digitisation of the Moscow University Herbarium (MW) in 2015 (англ.) // Taxon. — 2016-03-08. — Vol. 65, iss. 1. — P. 205–207. — doi:10.12705/651.29.
  9. ↑ Новости проекта | depozitariy. depository.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 9 декабря 2022 года.
  10. ↑ Alexey P Seregin. Moscow Digital Herbarium and the National Depository Bank of Live Systems Initiative (Russia). — 2017. — doi:10.13140/RG.2.2.14641.68961.
  11. ↑ В цифровой коллекции Гербарии МГУ — более миллиона образцов. www.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 19 мая 2022 года.
  12. ↑ Депозитарий живых систем. plant.depo.msu.ru. Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 1 марта 2023 года.
  13. ↑ Alexey P. Seregin. THE LARGEST DIGITAL HERBARIUM IN RUSSIA IS NOW AVAILABLE ONLINE! (англ.) // TAXON. — 2018-04. — Vol. 67, iss. 2. — P. 465–467. — ISSN 1996-8175 0040-0262, 1996-8175. — doi:10.12705/672.34. Архивировано 1 марта 2023 года.
  14. ↑ Alexey Seregin. Moscow University Herbarium (MW) (англ.) // Lomonosov Moscow State University. — 2023. — doi:10.15468/cpnhcc. Архивировано 29 декабря 2017 года.
  15. ↑ Все направления. plant.depo.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 13 января 2023 года.
  16. ↑ Alexey Seregin. Мы сделали первый шаг по очень длинному пути.. ВКонтакте (27 июня 2017). Дата обращения: 1 марта 2023.
  17. ↑ В Цифровом гербарии МГУ заработала система автоматической геопривязки ИСТРА. www.msu.ru. МГУ (30 октября 2017). Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 25 марта 2022 года.
  18. ↑ Russian Federation (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 13 января 2023 года.
  19. ↑ А П Серегин. «Атлас флоры России» на платформе Цифрового гербария МГУ. — 2018. — doi:10.13140/RG.2.2.19798.50241.
  20. ↑ Флора России и Крыма | Flora of Russia and the Crimea. iNaturalist. Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 1 марта 2023 года.
  21. ↑ Фотоохота на растения России объявляется открытой. Цифровой гербарий МГУ Вконтакте. ВКонтакте (12 января 2019). Дата обращения: 1 марта 2023.
  22. ↑ Alexey P. Seregin. Большой рубеж: 30 000 наблюдений !!! iNaturalist (23 февраля 2019). Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 24 февраля 2019 года.
  23. ↑ Наука и жизнь. — 2019. — № 12. — С. 22.
  24. ↑ Alexey P. Seregin. Россия vs. Мексика на iNaturalist.org: остался последний рывок! iNaturalist (1 января 2020). Дата обращения: 1 марта 2023.
  25. ↑ Может ли машинный интеллект опознавать растения? Цифровой гербарий МГУ ВКонтакте. ВКонтакте (1 февраля 2019). Дата обращения: 1 марта 2023.
  26. ↑ Субботник для волонтеров в Гербарии МГУ: добро.. | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.
  27. ↑ Мы сделали первый шаг по очень длинному пути.. | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.
  28. ↑ Алло, мы ищем таланты! В рамках.. | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.