Аминокисло́ты, также аминокарбо́новые кисло́ты, АМК — органические соединения, в молекуле которых одновременно содержатся карбоксильные и аминные группы. Основные химические элементы аминокислот — это углерод (C), водород (H), кислород (O) и азот (N), хотя другие элементы также встречаются в радикале определенных аминокислот. Известны около 500 встречающихся в природе аминокислот . Аминокислоты могут рассматриваться как производные карбоновых кислот, в которых один или несколько атомов водорода заменены на аминогруппы.
Пропо́лис, также пчелиный клей или уза — смолистое вещество от коричневого до тёмно-зелёного цвета, используемое пчёлами для замазывания щелей, регулирования проходимости летка, дезинфекции ячеек сот перед засевом яиц маткой, а также изоляции посторонних предметов в улье. Представляет из себя клейкие вещества, которые пчёлы собирают с весенних почек деревьев и модифицируют своими ферментами.
Проли́н — гетероциклическая иминокислота, в которую атом азота входит в составе вторичного, а не первичного, амина. Существует в двух оптически изомерных формах — L и D, а также в виде рацемата.
Эмиль Герман Фи́шер — немецкий химик, лауреат Нобелевской премии по химии 1902 года.
Коллаге́н — гликопротеин, фибриллярный белок, составляющий основу соединительной ткани организма и обеспечивающий её прочность и эластичность. Коллаген обнаружен у животных; отсутствует у растений, бактерий, вирусов, простейших и грибов. Коллаген — основной компонент соединительной ткани и самый распространённый белок у млекопитающих, составляющий от 25 % до 45 % белков во всём теле. Синтез коллагена очень энергозатратен и происходит только у животных, которые используют кислород. Появление коллагена позволило создать скелет, как внешний, так и внутренний, и резко увеличить размеры животных во время кембрийского взрыва.
Преку́рсор — вещество, участвующее в реакции, приводящей к образованию целевого вещества. Например, в биохимии слово применяется в отношении промежуточного участника метаболического пути.
Трансаминирование — биохимическая ферментативная реакция обратимого переноса аминогруппы с аминокислоты на кетокислоту без промежуточного образования аммиака.
Пирролидин (азолидин, тетрагидропиррол, тетраметиленимин) — органическое соединение класса гетероциклов, имеющее брутто формулу C4H9N. Его можно рассматривать как циклический амин с четырьмя атомами углерода в цикле.
Изомеразы (КФ5) — ферменты, катализирующие структурные превращения изомеров. Изомеразы катализируют реакции, подобные следующей: A → B, где B является изомером A.
3-Гидроксипролин — нестандартная аминокислота, отличающаяся от пролина наличием гидроксильной группой у одного из атомов углерода.
RPMI 1640, известная как среда RPMI, представляет собой среду для культивирования клеток, обычно используемую для культивирования клеток млекопитающих. RPMI 1640 была разработан Джорджем Э. Муром, Робертом Э. Гернером и Х. Аддисоном Франклином в 1966 году в Комплексном онкологическом центре Розуэлл-Парк, откуда он и получил свое название. Модификация среды Маккоя 5А. Первоначально она была разработана для поддержки лимфобластоидных клеток в суспензионных культурах, но также может поддерживать широкий спектр прикрепленных клеток.
Аланинаминопептидаза — мембранный белок, фермент, относящийся к классу пептидаз, или протеаз. Используется как маркёр почечных повреждений и играет роль в диагностике определённых болезней почек. Другие названия фермента: аминопептидаза M, микросомальная аминопептидаза, миелоидный гликопротеин плазматической мембраны CD13, gp150.
Интегрин альфа-IIb — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства интегринов, продукт гена ITGA2B. Компонент гликопротеина IIb/IIIa, обеспечивающего агрегацию тромбоцитов.
Интегрин альфа-1 — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства интегринов, продукт гена ITGA1. Основной коллаген-связывающий поверхностный рецептор.
Интегрин альфа-2 — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства интегринов, продукт гена ITGA2, коллаген-связывающий рецептор.
Интегрин альфа-M — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства интегринов, продукт гена ITGAM, альфа-субъединица интегрина αMβ2 (MAC-1).
Дипептидилпептидаза-4 — мембранный фермент, гидролизирующий пептидную связь с N-конца пролина. Продукт гена человека DPP4 также известный как CD26.
Тройная спираль коллагена или спираль типа 2 является основной вторичной структурой различных типов волокнистого коллагена, включая коллаген типа I. Он состоит из тройной спирали, состоящей из повторяющейся аминокислотной последовательности глицин -X-Y, где X и Y часто представляют собой пролин или гидроксипролин. Коллаген, свернутый в тройную спираль, известен как тропоколлаген. Тройные спирали коллагена часто связаны в фибриллы, которые сами образуют более крупные волокна, как в сухожилиях.
Полипролиновая спираль — это тип вторичной структуры белка, который встречается в последовательностях аминокислот, содержащих повторяющиеся остатки пролина. Левозакрученная спираль полипролина II образуется, когда все последовательные аминокислотные остатки принимают двугранные углы основной цепи примерно и имеют транс- изомеры своих пептидных связей. Эта конформация PPII также характерна для белков и полипептидов с другими аминокислотами, кроме пролина. Аналогичным образом, более компактная правозакрученная спираль полипролина I образуется, когда все последовательные остатки принимают двугранные углы основной цепи примерно и имеют цис- изомеры своих пептидных связей. Из двадцати обычных встречающихся в природе аминокислот только пролин, вероятно, принимает цис- изомер пептидной связи, особенно пептидную связь X-Про; стерические и электронные факторы в значительной степени благоприятствуют транс- изомеру в большинстве других пептидных связей. Однако пептидные связи, которые заменяют пролин другой N- замещенной аминокислотой, также могут принимать цис- изомер.
Клеточная стенка может в себе содержать структурные белки (гликопротеины). Они составляют примерно 10% от сухой массы. К основным белкам клеточной стенки относятся белки обогащённые гидроксипролином (HRGPs); белки обогащенные пролином (PRPs) и белки обогащенные глицином (GRPs).
