Дезоксирибонуклеаза I

Перейти к навигацииПерейти к поиску
Дезоксирибонуклеаза I
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

4AWN

Идентификаторы
ПсевдонимыDNASE1, DNL1, DRNI, deoxyribonuclease I, deoxyribonuclease 1
Внешние IDOMIM: 125505 MGI: 103157 HomoloGene: 3826 GeneCards: DNASE1
Расположение гена (человек)
16-я хромосома человека
Хр.16-я хромосома человека[1]
16-я хромосома человека
Расположение в геноме DNASE1
Расположение в геноме DNASE1
Локус16p13.3Начало3,611,728 bp[1]
Конец3,680,143 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
16-я хромосома мыши
Хр.16-я хромосома мыши[2]
16-я хромосома мыши
Расположение в геноме DNASE1
Расположение в геноме DNASE1
Локус16 A1|16 2.37 cMНачало3,854,806 bp[2]
Конец3,857,888 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

1773

13419

Ensembl

ENSG00000213918

ENSMUSG00000005980

UniProt

P24855

P49183

RefSeq (мРНК)
NM_005223
NM_001351825
NM_001387135
NM_001387139
NM_001387140

NM_001387141

NM_010061
NM_001357143

RefSeq (белок)

NP_005214
NP_001338754

NP_034191
NP_001344072

Локус (UCSC)Chr 16: 3.61 – 3.68 MbChr 16: 3.85 – 3.86 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Дезоксирибонуклеаза I (ДНКаза I) — эндонуклеаза, закодированная геном DNASE1 в геноме человека[5]. Синтезируется в основном в тканях пищеварительного тракта. Высокий уровень в моче, также присутствует в семенной жидкости и слюне.

ДНКаза I — нуклеаза, расщепляющая фосфодиэфирные связи в ДНК вблизи пиримидиновых нуклеотидов, образуя при этом полинуклеотиды с концевым-5'-фосфатом и свободной гидроксильной группой на 3'-конце. Обычно расщепление идет до тетрануклеотидов. Субстратами ДНКазы I являются: одноцепочечная ДНК, двуцепочечная ДНК, хроматин. ДНКаза I является эндонуклеазой, расщепляющей чужеродные и ненужные молекулы ДНК, также показана роль этого фермента во фрагментации ДНК при апоптозе[6].

Известно, что ДНКаза I связывает мономеры белка цитоскелета актина с высоким сродством (константа диссоциации ~ нМ) и полимеры актина с более низким сродством.

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000213918 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000005980 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Entrez Gene: DNASE1 deoxyribonuclease I. Дата обращения: 3 октября 2017. Архивировано 8 марта 2010 года.
  6. ↑ Samejima1, K and Earnshaw, W.C. Trashing the genome: the role of nucleases during apoptosis (англ.) // Nat Rev Mol Cell Biol : journal. — 2005. — Vol. 6. — P. 677—688. — doi:10.1038/nrm1715.

См. также

Литература

  • Lachmann P.J. Lupus and desoxyribonuclease (неопр.) // Lupus. — 2003. — Т. 12, № 3. — С. 202—206. — doi:10.1191/0961203303lu357xx. — PMID 12708782.
  • Yasuda T., Awazu S., Sato W., et al. Human genetically polymorphic deoxyribonuclease: purification, characterization, and multiplicity of urine deoxyribonuclease I (англ.) // J. Biochem.[англ.] : journal. — 1991. — Vol. 108, no. 3. — P. 393—398. — PMID 2277032.
  • Kishi K., Yasuda T., Ikehara Y., et al. Human serum deoxyribonuclease I (DNase I) polymorphism: pattern similarities among isozymes from serum, urine, kidney, liver, and pancreas (англ.) // Am. J. Hum. Genet.[англ.] : journal. — 1990. — Vol. 47, no. 1. — P. 121—126. — PMID 2349940. — PMC 1683738.
  • Kabsch W., Mannherz H.G., Suck D., et al. Atomic structure of the actin:DNase I complex (англ.) // Nature. — 1990. — Vol. 347, no. 6288. — P. 37—44. — doi:10.1038/347037a0. — PMID 2395459.
  • Kishi K., Yasuda T., Awazu S., Mizuta K. Genetic polymorphism of human urine deoxyribonuclease I (англ.) // Hum. Genet. : journal. — 1989. — Vol. 81, no. 3. — P. 295—297. — doi:10.1007/BF00279009. — PMID 2921043.
  • Rosenstreich D.L., Tu J.H., Kinkade P.R., et al. A human urine-derived interleukin 1 inhibitor. Homology with deoxyribonuclease I (англ.) // Journal of Experimental Medicine[англ.] : journal. — Rockefeller University Press[англ.], 1988. — Vol. 168, no. 5. — P. 1767—1779. — doi:10.1084/jem.168.5.1767. — PMID 3263467. — PMC 2189114.
  • Yasuda T., Nadano D., Takeshita H., et al. Molecular analysis of the third allele of human deoxyribonuclease I polymorphism (англ.) // Ann. Hum. Genet.[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 59, no. Pt 2. — P. 139—147. — doi:10.1111/j.1469-1809.1995.tb00737.x. — PMID 7625762.
  • Yasuda T., Kishi K., Yanagawa Y., Yoshida A. Structure of the human deoxyribonuclease I (DNase I) gene: identification of the nucleotide substitution that generates its classical genetic polymorphism (англ.) // Ann. Hum. Genet.[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 59, no. Pt 1. — P. 1—15. — doi:10.1111/j.1469-1809.1995.tb01601.x. — PMID 7762978.
  • Yasuda T., Nadano D., Iida R., et al. Chromosomal assignment of the human deoxyribonuclease I gene, DNASE 1 (DNL1), to band 16p13.3 using the polymerase chain reaction (англ.) // Cytogenetic and Genome Research[англ.] : journal. — Karger Publishers[англ.], 1995. — Vol. 70, no. 3—4. — P. 221—223. — doi:10.1159/000134038. — PMID 7789176.
  • Yasuda T., Nadano D., Takeshita H., et al. The molecular basis for genetic polymorphism of human deoxyribonuclease I: identification of the nucleotide substitution that generates the fourth allele (англ.) // FEBS Lett.[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 359, no. 2—3. — P. 211—214. — doi:10.1016/0014-5793(95)00037-A. — PMID 7867802.
  • Yasuda T., Nadano D., Tenjo E., et al. Genotyping of human deoxyribonuclease I polymorphism by the polymerase chain reaction (англ.) // Electrophoresis : journal. — 1996. — Vol. 16, no. 10. — P. 1889—1893. — doi:10.1002/elps.11501601310. — PMID 8586059.
  • Iida R., Yasuda T., Takeshita H., et al. Identification of the nucleotide substitution that generates the fourth polymorphic site in human deoxyribonuclease I (DNase I) (англ.) // Hum. Genet. : journal. — 1996. — Vol. 98, no. 4. — P. 415—418. — doi:10.1007/s004390050231. — PMID 8792814.
  • Iida R., Yasuda T., Aoyama M., et al. The fifth allele of the human deoxyribonuclease I (DNase I) polymorphism (англ.) // Electrophoresis : journal. — 1998. — Vol. 18, no. 11. — P. 1936—1939. — doi:10.1002/elps.1150181108. — PMID 9420147.
  • Yasuda T., Takeshita H., Iida R., et al. A new allele, DNASE1*6, of human deoxyribonuclease I polymorphism encodes an Arg to Cys substitution responsible for its instability (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 260, no. 1. — P. 280—283. — doi:10.1006/bbrc.1999.0900. — PMID 10381379.
  • Oliveri M., Daga A., Cantoni C., et al. DNase I mediates internucleosomal DNA degradation in human cells undergoing drug-induced apoptosis (англ.) // Eur. J. Immunol.[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 31, no. 3. — P. 743—751. — doi:10.1002/1521-4141(200103)31:3<743::AID-IMMU743>3.0.CO;2-9. — PMID 11241278.
  • Otterbein L.R., Graceffa P., Dominguez R. The crystal structure of uncomplexed actin in the ADP state (англ.) // Science : journal. — 2001. — Vol. 293, no. 5530. — P. 708—711. — doi:10.1126/science.1059700. — PMID 11474115.
  • Yasutomo K., Horiuchi T., Kagami S., et al. Mutation of DNASE1 in people with systemic lupus erythematosus (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2001. — Vol. 28, no. 4. — P. 313—314. — doi:10.1038/91070. — PMID 11479590.
  • Ballweber E., Galla M., Aktories K., et al. Interaction of ADP-ribosylated actin with actin binding proteins (англ.) // FEBS Lett.[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 508, no. 1. — P. 131—135. — doi:10.1016/S0014-5793(01)03040-X. — PMID 11707283.
  • Tsutsumi S., Kaneko Y., Asao T., et al. DNase I is present in the chief cells of human and rat stomachs (англ.) // Histochem. J. : journal. — 2002. — Vol. 33, no. 9—10. — P. 531—535. — doi:10.1023/A:1014999624430. — PMID 12005024.