Помацентровые, или рифовые рыбы (лат. Pomacentridae), — семейство ярко окрашенных тропических лучепёрых рыб. Ранее его включали в состав отряда окунеобразных (Perciformes), с 2016 года рассматривают как incertae sedis в составе подсерии Ovalentaria. Насчитывают 387 видов, объединяемых в 29 родов и 4 подсемейства. Распространены преимущественно в Индийском и Тихом океанах, а также в тропических водах Атлантики.
Камбалообра́зные (лат. Pleuronectiformes) — отряд лучепёрых рыб. В состав отряда включают 772 вида, объединяемых в 129 родов; подразделяется на два подотряда, включающие 14 семейств.
Губанообразные (лат. Labriformes) — отряд лучепёрых рыб из надотряда колючепёрых. Насчитывают около 630 видов, объединяемых в три семейства. Распространены в морских прибрежных водах. Для значительной части губанообразных характерен протогинический гермафродитизм — возрастная смена пола с женского на мужской. Многие представители обладают яркой окраской, также изменяющейся в течение жизни.
Гала́ксиевые (лат. Galaxiidae) — семейство лучепёрых рыб, единственное в отряде галаксиеобразных (Galaxiiformes).
Слитножаберникообра́зные, или ложноугреобра́зные (лат. Synbranchiformes), — отряд лучепёрых рыб. В него включают три семейства и около 109 видов в 12 родах. Все они за исключением трёх видов, обитающих в солоноватой воде — пресноводные виды, живущие в тропиках и субтропиках Африки, Азии, Австралии, а также Центральной и Южной Америки.
Собачкообразные (лат. Blenniiformes) — отряд лучепёрых рыб из надотряда колючепёрых. Ранее рассматривался в ранге подотряда собачковидных в отряде окунеобразных. Морские, солоноватоводные и пресноводные рыбы. В отряде собачкообразных выделяют 6 семейств с 150 родами и 918 видами.
Спаровые, или морские караси (лат. Sparidae), — семейство лучепёрых рыб из отряда Spariformes. Ранее относились к отряду окунеобразных. Отличаются своеобразным, сильно специализованным строением зубов: передние зубы в виде резцов, боковые в виде коренных, нёбо, как правило, без зубов. В состав семейства включают 37 родов и 148 видов.
Спиношипообразные (лат. Notacanthiformes) — отряд морских глубоководных лучепёрых рыб. Ранее классифицировался как подотряд спиношиповидных (Notacanthoidei) в отряде альбулообразных.
Хвостоколообразные (лат. Myliobatiformes) — отряд скатов. Результаты морфологического и генетического анализов показали, что данная группа является монофилетической.
Эвселяхии (лат. Euselachii) — подкласс хрящевых рыб, представленный двумя современными группами и близкими им вымершими группами. Некоторые авторы включают в состав таксона также вымершую группу пресноводных рыб, сходных с акулами — ксенакантообразных. Имеют анальный плавник и два спинных плавника с шипом.
Ботовые, или ботусовые, или арноглоссовые, или левосторонние камбалы, или ромбовые (лат. Bothidae) — семейство лучепёрых рыб из отряда камбалообразных.
Соле́евые, или правосторо́нние морски́е языки́, или косоро́тые (лат. Soleidae), — семейство лучепёрых рыб из отряда камбалообразных (Pleuronectiformes).
Гладкоголовообразные (лат. Alepocephaliformes) — отряд лучепёрых рыб. Распространены во всех океанах. Многие виды глубоководные.
Аргентинообразные, или серебрянкообразные (лат. Argentiniformes), — отряд лучепёрых рыб. Распространены во всех океанах. Многие виды глубоководные.
Тратихтиобразные, или большеголовообразные (лат. Trachichthyiformes), — отряд лучепёрых рыб из надотряда колючепёрых. Ранее классифицировался как подотряд в отряде бериксообразных.
Иглообразные (лат. Syngnathiformes) — отряд лучепёрых рыб. Распространены в тропических и тёплых умеренных водах всех океанов.
Макруроновые (лат. Macruronidae) — семейство лучепёрых рыб из отряда трескообразных (Gadiformes). Относится к группе семейств incertae sedis в подотряде Gadoidei. Ранее рассматривалось в ранге подсемейства Macruroninae в семействе мерлузовых (Merlucciidae). Распространены в Атлантическом океане и морях Южного полушария вокруг Южной Африки, Южной Америки, южного побережья Австралии и Южного острова Новой Зеландии. Максимальная длина тела представителей разных видов варьирует от 35 до 130 см. Lyconodes argenteus известен только по одному экземпляру длиной 4,5 см, отловленному в Атлантическом океане у мыса Доброй Надежды (ЮАР) в 1922 году. Некоторые представители семейства имеют важное промысловое значение.
Рыба-тряпка, или тряпичник, — вид лучепёрых рыб из монотипического семейства икостеевых (Icosteidae), которое выделили в монотипический отряд икостеобразных (Icosteiformes). Распространены в умеренных водах северной части Тихого океана. Батипелагические рыбы, обитающие над материковым склоном на глубине до 1420 м. Максимальная длина тела 213 см.
Хирургообразные (лат. Acanthuriformes) — отряд лучепёрых рыб из надотряда колючепёрых, ранее рассматривался в качестве подотряда хирурговидных (Acanthuroidei) в отряде окунеобразных.
Центролофовые (лат. Centrolophidae) — семейство морских лучепёрых рыб из отряда Scombriformes. Семейство включает около 31 вида. Они встречаются в умеренных и тропических водах по всему миру.
