Госуда́рственный Да́рвиновский музе́й — московский музей, посвящённый дарвинской теории эволюции. Инициатором создания стал биолог Александр Котс, начавший свою преподавательскую карьеру при Московских высших женских курсах в 1907-м. Этот же год считается и датой основания музея — учёный перенёс свою коллекцию редких чучел животных в здание курсов в Мерзляковском переулке. После революции 1917 года Дарвиновский музей стал самостоятельным учреждением. В 1994-м правительство Москвы выделило под нужды музея здание на улице Вавилова. По состоянию на 2018 год его коллекции насчитывают более 400 000 предметов.
Зоологи́ческий музе́й Моско́вского госуда́рственного университе́та — один из крупнейших музеев зоологического направления в России. Официальной датой основания считается 1791 год, когда созданный при Московском университете Натуральный кабинет был преобразован в естественно-научный музей.
Белгородский государственный национальный исследовательский университет — вуз в Белгороде.
Зоологический музей Зоологического института РАН — старейший зоологический музей на территории России.
Зоологи́ческий институ́т — научно-исследовательский институт Российской академии наук, занимающийся проблемами общей и частной зоологии, экологии животных, биоразнообразия, морфологии животных, а также разрабатывающий рекомендации по охране природы. «Alma Mater» отечественной зоологии.
Волого́дский госуда́рственный исто́рико-архитекту́рный и худо́жественный музе́й-запове́дник (ВГИАХМЗ; Вологодский государственный музей-заповедник; ВГМЗ) — музейный центр Вологодской области, научно-исследовательское и научно-просветительское учреждение с несколькими филиалами, хранилище художественных, историко-архитектурных, литературных и других памятников материальной и духовной культуры, а также природы.
Национальный научно-природоведческий музей Национальной академии наук Украины — научно-исследовательское и просветительское учреждение, один из ведущих центров развития природоведческих исследований Украины, действующий в системе Национальной академии наук Украины, самый крупный природоведческий музей Украины и один из крупнейших научно-природоведческих музеев мира. Научные фонды и экспозиция ННПМ относятся к Научным объектам, составляющим национальное достояние. Музей подчинён непосредственно Президии НАН Украины. Отделение общей биологии и наук о земле НАН Украины и Музейный Совет осуществляют научное и научно-методическое руководство соответствующими направлениями деятельности ННПМ НАН Украины.
Дрезденский зоологический музей — один из самых крупных и старых естественно-исторических музеев Европы. С 2009 года входит в состав Senckenberg Naturhistorische Sammlungen Dresden.
Зоологи́ческий музе́й и́мени Дми́трия Никола́евича Фло́рова — один из старейших зоологических музеев Поволжья, расположенный в Самаре. Является структурным подразделением естественно-географического факультета Самарского государственного социально-педагогического университета.
Государственный Музей природы Харьковского национального университета имени В. Н. Каразина — природоведческий музей в Харькове, один из старейших музеев Европы; входит в состав Харьковского национального университета имени В. Н. Каразина, является крупным научно-просветительским и учебным центром Украины.
Зоологический музей Луганского университета — учебное, образовательное и научное подразделение Луганского национального университета им. Т. Шевченко.
Зоологический музей Самаркандского государственного университета имени Алишера Навои — один из крупнейших музеев естественно-исторического направления в Узбекистане. Входит в состав Самаркандского государственного университета имени Алишера Навои, который находится в городе Самарканд. Научные фонды музея в настоящее время включают более 5000 единиц экспонатов хранения. Ежегодно музей посещает несколько тысяч человек. Входит в состав факультета естественных наук и находится при кафедре зоологии.
Натуралис — естественно-научный музей в городе Лейден (Нидерланды).
Национальный музей Республики Тыва или Национальный музей им. Алдан-Маадыр — первый музей в истории Республики Тыва, официально основан в 13 мая 1929 года.
[[Файл:|thumb|]] Музей естественной истории имени Гасан-бека Зардаби — исторический музей основанный в 1930 году. Назван в честь Гасан бека Зардаби азербайджанского журналиста и интеллектуала, просветителя, публициста, педагога, автора ряда научных трудов, посвященных проблемам дарвинизма, возникновения жизни на Земле и экологии.
Музей землеведения БГУ — структурное подразделение факультета географии и геоинформатики, учебный музей по землеведению и геологии для студентов БГУ и иных посетителей. Экспонаты музея охватывают науки географических циклов и геологии. Экспозиция музея раскрывает историю развития Земли и жизни на ней, присутствует коллекция минералов с различными морфологическими и физическими свойствами, их различными химическими классификациями. Имеется петрографический отдел.
Музей исторического факультета БГУ — структурное подразделение Белорусского государственного университета, один из пяти музеев университета. Музей является учебно-вспомогательным подразделением исторического факультета.
Зоологический музей Киевского университета — действующий музей при Киевском национальном университете имени Тараса Шевченко. Расположен в красном корпусе университета. Свою историю музей ведёт с 1834 года. Является одним из крупнейших в Европе университетским зоологическим музеем по объёмам научного фонда.
Зоологический музей ТНУ или Зоологический музей имени М. И. Глобенко — действующий музей при Таврическом национальном университете имени В. И. Вернадского. Расположен в здании университета на проспекте Вернадского в Симферополе. Свою историю музей ведёт с 1965 года.
Зоологический музей им. Бенедикта Дыбовского — научно-учебное подразделение биологического факультета Львовского национального университета имени Ивана Франко. Распространённый акроним для обозначения коллекционных образцов — «ЗМД».