Институт математических проблем биологии РАН
Институт математических проблем биологии РАН (ИМПБ РАН) | |
---|---|
Международное название | The Institute of Mathematical Problems of Biology RAS (IMPB RAS) |
Основан | 1972 |
Материнская организация | Отдел математических наук[вд] и ИПМ РАН[1] |
Директор | В. Д. Лахно |
Расположение | Россия, Пущино |
Юридический адрес | 142290, Московская область, г. Пущино, ул. проф. Виткевича, д.1 |
Сайт | impb.ru |
Институт математических проблем биологии РАН — филиал Федерального государственного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт прикладной математики им. М. В. Келдыша Российской академии наук» (сокращенно: ИМПБ РАН — филиал ИПМ им. М. В. Келдыша РАН), так стало выглядеть официальное название института по итогам реорганизации 2015—2016 гг.[2]
Предназначение института состоит в разработке математических и вычислительных методов для биологических исследований, а также непосредственном решении задач вычислительной биологии с использованием таких методов.
Институт издаёт научный журнал «Математическая биология и биоинформатика».[3]
Структура института
В состав института входят[4]:
- Лаборатория кристаллографии макромолекул
- Лаборатория квантово-механических систем
- Лаборатория молекулярной динамики
- Лаборатория нейронных сетей
- Лаборатория прикладной математики
- Лаборатория вычислительной экологии
- Отдел перспективных информационных технологий
- Лаборатория обработки данных
- Лаборатория биоинформатики
- Отдел вычислительных и информационных ресурсов
Научная деятельность
Научные направления
- Теоретические разработки;
- теоретические основы нанобиоэлектроники;
- развитие спектрально-аналитических методов обработки данных биологических экспериментов;
- развитие численно-аналитических методов обработки данных биологических экспериментов;
- аналитические решения интегро-дифференциальных уравнений;
- методы анализа динамических систем.
- Анализ данных
- анализ активности головного мозга человека;
- развитие методов оценки биоразнообразия растительного покрова;
- разработка алгоритмов и программ для изучения геномных последовательностей: распознавание кодирующих областей и участков однородности;
- развитие компьютерные методов исследования первичных структур биополимеров;
- разработка новых методов сравнения биополимеров и их применение к распознаванию типа пространственной структуры белков;
- создание новых методов расшифровки структуры комплексов биологических макромолекул на основе данных по рассеянию рентгеновских лучей и нейтронов;
- разработка методов получения, обработки и анализа цифровых изображений в биологии и медицине.
- Вычислительная биология
- имитационное моделирование динамики биомолекулярных систем;
- нейросетевые модели обработки информации в структурах мозга;
- растущие случайные графы и их приложение в математической нейробиологии;
- исследование моделей потенциал-зависимых ионных каналов возбудимых биомембран;
- программное обеспечение для изучения метаболизма клетки;
- математические модели в биомеханике;
- численное решение задач кардиофизики.
- Синергетика (включая такие разделы как: Динамическая система, Теория хаоса, Неравновесная термодинамика, Системная биология)
- исследование нелинейных моделей автолокализованных состояний в конденсированных средах;
- асимптотические методы и численное моделирование в исследовании волн возбуждения;
- бифуркации в дифференциальных уравнениях, описывающих системы с симметриями;
- бифуркации в функциональных дифференциальных уравнениях и феномены бифуркационной памяти.
- Биоинформатика
- Параллельные вычисления
- развитие высокопроизводительного вычислительного кластера;
- технологии CUDA.
Специализированные научные проекты
- проект «Математическая клетка»[5];
- проект «Обобщённый спектрально-аналитический метод» (ОСАМ)[6][7][8].
Преподавательская и общественная деятельность
Сотрудники института читали курсы лекций в Пущинском государственном университете[9] (ПущГУ); А. М. Молчанов являлся организатором Учебного центра математической биологии ПущГУ и его деканом с 1994 по 2005 гг, а также руководителем магистерской программы «Моделирование биологических систем» ПущГУ (1994—2011).
Начиная с 2006 г., раз в каждые два года институт проводит конференцию «Математическая биология и биоинформатика».
История
Институт был образован 17 февраля 1972 года в Пущино, директором назначен А. М. Молчанов. До 1992 г. носил название Научно-исследовательский вычислительный центр (НИВЦ) АН СССР; до февраля 2016 г. именовался как Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт математических проблем биологии Российской академии наук (Институт математических проблем биологии, ИМПБ РАН).
Вехи
- 17 февраля 1972 — организован Научно-исследовательский вычислительный центр (НИВЦ) АН СССР;
- 1972 — создан отдел вычислительной техники (заведующий — В. Г. Ерохин);
- 1983 — создан отдел информатики (заведующий — В. В. Корнилов); позднее преобразован в сектор информационно-поисковых систем (заведующий — В. В. Васильчиков), работавший до 1989 года;
- 1984 — группа сопровождения задач отдела вычислительной техники преобразована в отдел организации вычислительных работ (заведующий — В. А. Королев);
- 1986 — создан Сектора проблем компьютерного обучения (заведующий Р. М. Борисюк);
- 1990 — организован сектор математических проблем биомеханики
- 1992 — НИВЦ АН СССР переименован в Институт математических проблем биологии (ИМПБ) РАН; расформированы отделы вычислительной техники и организации вычислительных работ;
- 1998 — новым директором института избран д. ф-м. н. В. Д. Лахно
- 2000 — создан Межинститутский отдел вычислительных и информационных ресурсов (МОВИР)
- 2004 — создана лаборатория биоинформатики
- 2015 — решением ФАНО институт присоединён к Институту прикладной математики[2]
Руководители
- Молчанов, Альберт Макарьевич (1972—1998, директор)
- Лахно, Виктор Дмитриевич (1998—2016, директор)
- Лахно, Виктор Дмитриевич (с 2016 г., руководитель филиала)
Известные сотрудники
- Дедус, Флоренц Фёдорович
- Молчанов, Альберт Макарьевич
- Шноль, Эммануил Эльевич
Ссылки
- Официальный сайт Архивная копия от 28 февраля 2008 на Wayback Machine
- Краткая история института Архивная копия от 2 марта 2009 на Wayback Machine
Примечания
- ↑ Единый Государственный Реестр Юридических Лиц, ЕГРЮЛ
- ↑ 1 2 Приказ об присоединении ИМПБ к ИПМ . Дата обращения: 1 марта 2016. Архивировано 6 марта 2016 года.
- ↑ Официальный веб-сайт журнала . Дата обращения: 10 октября 2017. Архивировано 11 октября 2017 года.
- ↑ Лаборатории ИМПБ РАН . Дата обращения: 3 апреля 2022. Архивировано 2 марта 2009 года.
- ↑ Официальный веб-сайт проекта «Математическая клетка» . Дата обращения: 30 июня 2016. Архивировано 11 января 2016 года.
- ↑ Proc. SPIE. Vol.2363. 1995. P.109-112 . Дата обращения: 30 июня 2016. Архивировано 18 августа 2016 года.
- ↑ Proc. SPIE. Vol.2363. 1995. P.113-118 . Дата обращения: 30 июня 2016. Архивировано 18 августа 2016 года.
- ↑ S.B.A.R.S — Spectral-Based Approach for Repeats Search . Дата обращения: 26 сентября 2017. Архивировано 26 сентября 2017 года.
- ↑ Официальный веб-сайт Пущинского университета (недоступная ссылка)