Каспаза 1

Перейти к навигацииПерейти к поиску
Каспаза 1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1BMQ, 1IBC, 1ICE, 1RWK, 1RWM, 1RWN, 1RWO, 1RWP, 1RWV, 1RWW, 1RWX, 1SC1, 1SC3, 1SC4, 2FQQ, 2H48, 2H4W, 2H4Y, 2H51, 2H54, 2HBQ, 2HBR, 2HBY, 2HBZ, 3D6F, 3D6H, 3D6M, 3E4C, 3NS7, 5FNA

Идентификаторы
ПсевдонимыCASP1, ICE, IL1BC, P45, caspase 1
Внешние IDOMIM: 147678 MGI: 96544 HomoloGene: 133272 GeneCards: CASP1
Шифр КФ3.4.22.36
Расположение гена (человек)
11-я хромосома человека
Хр.11-я хромосома человека[1]
11-я хромосома человека
Расположение в геноме CASP1
Расположение в геноме CASP1
Локус11q22.3Начало105,025,397 bp[1]
Конец105,035,250 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
9-я хромосома мыши
Хр.9-я хромосома мыши[2]
9-я хромосома мыши
Расположение в геноме CASP1
Расположение в геноме CASP1
Локус9 A1|9 2.46 cMНачало5,298,508 bp[2]
Конец5,307,290 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

834

12362

Ensembl

ENSG00000137752

ENSMUSG00000025888

UniProt

P29466

P29452

RefSeq (мРНК)
NM_001223
NM_001257118
NM_001257119
NM_033292
NM_033293

NM_033294
NM_033295

NM_009807

RefSeq (белок)
NP_001214
NP_001244047
NP_001244048
NP_150634
NP_150635

NP_150636
NP_150637

NP_033937

Локус (UCSC)Chr 11: 105.03 – 105.04 MbChr 9: 5.3 – 5.31 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)
Зимоген каспазы 1.

Каспаза 1 (англ. Caspase-1, сокр. CASP1), также интерлейкин-1 превращающий фермент (сокр. ICE от англ. Interleukin-1 converting enzyme) — протеолитический фермент (КФ 3.4.22.36), является первым идентифицированным ферментом крупного семейства цистеиновых протеаз (класс гидролазы), представляет собой эволюционно консервативный фермент, который путём протеолиза расщепляет другие белки, такие как предшественники воспалительных цитокинов — интерлейкина 1β и интерлейкина 18, а также является индуктором пироптоза, сопровождаемого протеолизом гасдермина D (GSDMD) с образованием активных зрелых пептидов[5][6][7].

Каспаза 1 играет центральную роль в клеточном иммунитете в качестве инициатора воспалительного ответа. После активации посредством образования комплекса воспаления она инициирует провоспалительный ответ через расщепление и, таким образом, активацию двух воспалительных цитокинов, интерлейкина 1β (IL-1β) и интерлейкина 18 (IL-18), а также пироптоза, запрограммированного литического пути смерти клетки, посредством расщепления молекул гасдермина D. Два воспалительных цитокина, активированных каспазой 1, выводятся из клетки, чтобы дополнительно индуцировать воспалительный ответ в соседних клетках[8].

Каспаза 1 у человека кодируется геном — CASP1, который локализован на длинном плече (q-плече) 11-й хромосомы[9]. Фермент состоит из последовательности 404 аминокислотных остатков и имеет молекулярную массу равную 45 159 Да[10].

Клетки, экспрессирующие каспазу 1

Каспаза 1, благодаря эволюционной консервативности сохраняется у многих эукариот царства животных. Благодаря своей роли в воспалительном иммунном ответе она высоко экспрессируется в тканях и органах, участвующих в иммунной защите, таких как печень, почка, селезёнка и кровь (нейтрофилы)[11][12]. После инфицирования воспалительный ответ увеличивает экспрессию СASP1 с помощью механизма положительной обратной связи, который усиливает реакцию[12].

Структура

Каспаза 1 синтезируется в виде зимогена (прокаспаза 1), который затем может быть расщеплён на субъединицы 20 кДа (р20) и 10 кДа (р10), в дальнейшем которые становятся частью активного фермента. Активная каспаза 1 содержит два гетеродимера p20 и p10. Каспаза включает в себя каталитический домен с активным сайтом, который охватывает как p20, так и p10 субъединицы[13], а также некаталитический домен активации каспазы и рекрутирования (CARD). Она взаимодействует с другими белками, содержащими CARD-домены, такими, как апоптоз-ассоциированный Speck-подобный белок, содержащий CARD (ASC) и Nod-подобный рецептор (NLR) NLRC4, посредством взаимодействий доменов CARD-CARD, обуславливая воспалительные реакции многих заболеваний[7][14].

Выполняемые функции

Протеолитическое расщепление

Активированная каспаза 1 протеолитически расщепляет про-IL-1β и про-IL-18 в их активные формы — IL-1β и IL-18. Активные цитокины приводят к воспалительному ответу, происходящему далее. Каспаза 1 также расщепляет гасдермин D в его активную форму, которая приводит к пироптозу[14].

Воспалительный ответ

После созревания цитокины инициируют последующие события сигнализации, чтобы вызвать провоспалительный ответ, а также активировать экспрессию антивирусных генов. Скорость, специфичность и типы ответа зависят от получённого сигнала, а также от белка датчика, который его получил. Сигналы, которые могут принимать инфламмасомы, включают вирусную двухцепочечную РНК, мочевину, свободные радикалы и другие сигналы, связанные с клеточной угрозой, даже побочные продукты других путей иммунного ответа[15].

Сами зрелые цитокины не содержат необходимых последовательностей сортировки для входа в секреторный путь ER-Golgi и, таким образом, не выводятся из клетки обычными методами. Однако теоретически предполагается, что высвобождение этих провоспалительных цитокинов не зависит от клеточного разрыва посредством пироптоза и фактически является активным процессом. Существуют доказательства как за, так и против этой гипотезы. Тот факт, что для многих типов клеток цитокины секретируются, несмотря на то, что они не показывают абсолютно никаких признаков пироптоза, поддерживает эту гипотезу[16][17]. Однако некоторые эксперименты показывают, что нефункциональные мутанты гасдермина D по-прежнему имеют нормальное расщепление цитокинов, но не обладают способностью их секретировать, это указывает на то, что пироптоз действительно может быть необходим для секреции каким-либо образом[18].

Пироптоз

После воспалительного ответа активированная каспаза 1 может индуцировать пироптоз, литическую форму гибели клеток, в зависимости от получённого сигнала, а также от специфического домена белка инфламмасомы, который его получил. Хотя пироптоз может потребоваться или не потребоваться для полного воспалительного ответа, воспалительный ответ полностью необходим до возникновения пироптоза. Чтобы вызвать пироптоз, каспаза 1 расщепляет гасдермин D, который либо непосредственно, либо через некоторый сигнальный каскад приводит к пироптозу[16]. Точный механизм пироптоза неизвестен[16].

Другие функции

Было также показано, что каспаза 1 вызывает некроз и может также функционировать на различных стадиях развития. Исследования аналогичного белка у мышей указывают на роль в патогенезе болезни Хантингтона. Альтернативный сплайсинг гена приводит к пяти вариантам транскрипции, кодирующим различные изоформы[19]. Недавние исследования показали участие каспазы 1 в промоции смерти CD4 Т-клеток от инфицирования ВИЧ, двух знаковых событий, которые способствуют прогрессии ВИЧ и приводят к СПИДу[20][21].

Регуляция

Ингибированная каспаза 1 с выделенными субъединицами 10 кДа (синяя) и 20 кДа (зелёная) соответственно.
Пример структуры инфламмасомы. Центром структуры является каталитический домен, внешние домены — сенсорные области.

Активация

Взаимодействие CARD-CARD опосредованное кольцом.

Каспаза-1, обычно в своей физиологически неактивной форме зимогена, активируется, когда происходит её сборка в филаментный воспалительный комплекс (инфламмасому) путём аутопротеолиза в субъединицы p10 и p20[22][23]. Инфламмасома представляет собой кольцевой комплекс, состоящий из тримеров, специфических к сигналам типа белок-белок, таких рецепторы семейства NLR, и рецепторы AIM-1 (отсутствующие в меланоме), адаптерные белки, такой как ASC, и каспазы, в данном случае каспазы 1. В некоторых случаях, когда сигнальные белки содержат свои собственные CARD-домены, например, в NLRP1 и NLRC4, взаимодействие CARD-CARD является прямым, то есть в комплексе нет адапторного белка. Существуют различные сенсорные и адапторные белки, различные комбинации которых дают ответы на воспалительные реакции, активируемых определёнными сигналами. Это позволяет клетке иметь различную концентрацию инфламмасом в зависимости от тяжести полученного сигнала[16][24].

Ингибирование

Только CARD-домен содержащие белки (COP), как следует из их названия, представляют собой белки, которые содержат только некаталитические домены CARD. Из-за важности взаимодействий CARD-CARD в образовании воспаления, многие COP являются известными ингибиторами активации каспаз. Для каспазы-1 гены, отвечающие за специфическое взаимодействие комплексов COP-ICEBERG, COP1(ICE /псевдо-ICE) и INCA (Ингибирующая CARD) — все обнаружены вблизи локуса и, как полагают, возникли из событий дублирования генов и последующих делеций каталитических доменов. Хотя все они взаимодействуют с инфламмасомой путём взаимодействия CARD-CARD, однако, отличаются тем, как они выполняют свои ингибирующие функции, а также в их эффективности ингибирования[23][25][26].

Например, ICEBERG зарождает образование филаментов каспазы 1 и, таким образом, внедряется в филаменты, но не обладает способностью ингибировать активацию воспалительных заболеваний. Вместо этого считается, что он ингибирует активацию каспазы 1, препятствуя взаимодействию её с другими важными белками, содержащими CARD-домен[23][25][26].

INCA, с другой стороны, непосредственно блокирует сборку инфламмасомы посредством ассоциации (укрупнения) олигомеров CARD-доменов каспазы, и тем самым блокируется дальнейшая полимеризация филаментов инфламмасомы[14][25][26][27].

Аналогично, действуют POP-белки (белки, содержащие только пирин), регулируя активацию каспазы 1 путём ингибирования активации воспалительного процесса действуя на механизм связывания и блокирования PYD-взаимодействий, которые также играют роль в образовании воспалительных заболеваний, хотя точные механизмы до сих пор точно не установлены[26][28].

См. также

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137752 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000025888 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Thornberry N. A., Bull H. G., Calaycay J. R., Chapman K. T., Howard A. D., Kostura M. J., Miller D. K., Molineaux S. M., Weidner J. R., Aunins J. A novel heterodimeric cysteine protease is required for interleukin-1 beta processing in monocytes (англ.) // Nature : journal. — 1992. — April (vol. 356, no. 6372). — P. 768—774. — doi:10.1038/356768a0. — PMID 1574116.
  6. ↑ Cerretti D. P., Kozlosky C. J., Mosley B., Nelson N., Van Ness K., Greenstreet T. A., March C. J., Kronheim S. R., Druck T., Cannizzaro L. A. Molecular cloning of the interleukin-1 beta converting enzyme (англ.) // Science : journal. — 1992. — April (vol. 256, no. 5053). — P. 97—100. — doi:10.1126/science.1373520. — PMID 1373520.
  7. ↑ 1 2 Mariathasan S., Newton K., Monack D. M., Vucic D., French D. M., Lee W. P., Roose-Girma M., Erickson S., Dixit V. M. Differential activation of the inflammasome by caspase-1 adaptors ASC and Ipaf (англ.) // Nature : journal. — 2004. — July (vol. 430, no. 6996). — P. 213—218. — doi:10.1038/nature02664. — PMID 15190255.
  8. ↑ Jorgensen I., Miao E. A. Pyroptotic cell death defends against intracellular pathogens (англ.) // Immunological Reviews : journal. — 2015. — May (vol. 265, no. 1). — P. 130—142. — doi:10.1111/imr.12287. — PMID 25879289. — PMC 4400865.
  9. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1499 (англ.). Дата обращения: 22 сентября 2017. Архивировано 22 сентября 2017 года.
  10. ↑ UniProt, P29466 (англ.). Дата обращения: 13 сентября 2017. Архивировано 21 сентября 2017 года.
  11. ↑ Bakele M., Joos M., Burdi S., Allgaier N., Pöschel S., Fehrenbacher B., Schaller M., Marcos V., Kümmerle-Deschner J., Rieber N., Borregaard N., Yazdi A., Hector A., Hartl D. Localization and functionality of the inflammasome in neutrophils (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2014. — February (vol. 289, no. 8). — P. 5320—5329. — doi:10.1074/jbc.M113.505636. — PMID 24398679. — PMC 3931087.
  12. ↑ 1 2 Kumaresan V., Ravichandran G., Nizam F., Dhayanithi N. B., Arasu M. V., Al-Dhabi N. A., Harikrishnan R., Arockiaraj J. Multifunctional murrel caspase 1, 2, 3, 8 and 9: Conservation, uniqueness and their pathogen-induced expression pattern (англ.) // Fish & Shellfish Immunology : journal. — 2016. — February (vol. 49). — P. 493—504. — doi:10.1016/j.fsi.2016.01.008. — PMID 26777895.
  13. ↑ Wilson K. P., Black J. A., Thomson J. A., Kim E. E., Griffith J. P., Navia M. A., Murcko M. A., Chambers S. P., Aldape R. A., Raybuck S. A. Structure and mechanism of interleukin-1 beta converting enzyme (англ.) // Nature : journal. — 1994. — July (vol. 370, no. 6487). — P. 270—275. — doi:10.1038/370270a0. — PMID 8035875.
  14. ↑ 1 2 3 Lu A., Li Y., Schmidt F. I., Yin Q., Chen S., Fu T. M., Tong A. B., Ploegh H. L., Mao Y., Wu H. Molecular basis of caspase-1 polymerization and its inhibition by a new capping mechanism (англ.) // Nature Structural & Molecular Biology : journal. — 2016. — May (vol. 23, no. 5). — P. 416—425. — doi:10.1038/nsmb.3199. — PMID 27043298. — PMC 4856535.
  15. ↑ Vezzani A., Maroso M., Balosso S., Sanchez M. A., Bartfai T. IL-1 receptor/Toll-like receptor signaling in infection, inflammation, stress and neurodegeneration couples hyperexcitability and seizures (англ.) // Brain, Behavior, and Immunity[англ.] : journal. — 2011. — October (vol. 25, no. 7). — P. 1281—1289. — doi:10.1016/j.bbi.2011.03.018. — PMID 21473909.
  16. ↑ 1 2 3 4 Vince J. E., Silke J. The intersection of cell death and inflammasome activation (англ.) // Cellular and Molecular Life Sciences: CMLS : journal. — 2016. — Vol. 73, no. 11—12. — P. 2349—2367. — doi:10.1007/s00018-016-2205-2. — PMID 27066895.
  17. ↑ Ainscough J. S., Gerberick G. F., Kimber I., Dearman R. J. Interleukin-1β Processing Is Dependent on a Calcium-mediated Interaction with Calmodulin (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2015. — December (vol. 290, no. 52). — P. 31151—31161. — doi:10.1074/jbc.M115.680694. — PMID 26559977. — PMC 4692238.
  18. ↑ He W. T., Wan H., Hu L., Chen P., Wang X., Huang Z., Yang Z. H., Zhong C. Q., Han J. Gasdermin D is an executor of pyroptosis and required for interleukin-1β secretion (англ.) // Cell Research[англ.] : journal. — 2015. — December (vol. 25, no. 12). — P. 1285—1298. — doi:10.1038/cr.2015.139. — PMID 26611636. — PMC 4670995.
  19. ↑ Entrez Gene: CASP1 caspase 1, apoptosis-related cysteine peptidase (interleukin 1, beta, convertase).
  20. ↑ Doitsh G., Galloway N. L., Geng X., Yang Z., Monroe K. M., Zepeda O., Hunt P. W., Hatano H., Sowinski S., Muñoz-Arias I., Greene W. C. Cell death by pyroptosis drives CD4 T-cell depletion in HIV-1 infection (англ.) // Nature : journal. — 2014. — January (vol. 505, no. 7484). — P. 509—514. — doi:10.1038/nature12940. — PMID 24356306. — PMC 4047036.
  21. ↑ Monroe K. M., Yang Z., Johnson J. R., Geng X., Doitsh G., Krogan N. J., Greene W. C. IFI16 DNA sensor is required for death of lymphoid CD4 T cells abortively infected with HIV (англ.) // Science : journal. — 2014. — January (vol. 343, no. 6169). — P. 428—432. — doi:10.1126/science.1243640. — PMID 24356113. — PMC 3976200.
  22. ↑ Elliott J. M., Rouge L., Wiesmann C., Scheer J. M. Crystal structure of procaspase-1 zymogen domain reveals insight into inflammatory caspase autoactivation (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2009. — March (vol. 284, no. 10). — P. 6546—6553. — doi:10.1074/jbc.M806121200. — PMID 19117953. — PMC 2649088.
  23. ↑ 1 2 3 Humke E. W., Shriver S. K., Starovasnik M. A., Fairbrother W. J., Dixit V. M. ICEBERG: a novel inhibitor of interleukin-1beta generation (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2000. — Vol. 103, no. 1. — P. 99—111. — doi:10.1016/S0092-8674(00)00108-2. — PMID 11051551.
  24. ↑ Samarani S., Allam O., Sagala P., Aldabah Z., Jenabian M. A., Mehraj V., Tremblay C., Routy J. P., Amre D., Ahmad A. Imbalanced production of IL-18 and its antagonist in human diseases, and its implications for HIV-1 infection (англ.) // Cytokine[англ.] : journal. — Elsevier, 2016. — June (vol. Cytokines in inflammation, aging, cancer and obesity). — P. 38—51. — doi:10.1016/j.cyto.2016.01.006. — PMID 26898120.
  25. ↑ 1 2 3 Druilhe A., Srinivasula S. M., Razmara M., Ahmad M., Alnemri E. S. Regulation of IL-1beta generation by Pseudo-ICE and ICEBERG, two dominant negative caspase recruitment domain proteins (англ.) // Cell Death and Differentiation : journal. — 2001. — June (vol. 8, no. 6). — P. 649—657. — doi:10.1038/sj.cdd.4400881. — PMID 11536016.
  26. ↑ 1 2 3 4 Le H. T., Harton J. A. Pyrin- and CARD-only Proteins as Regulators of NLR Functions (англ.) // Frontiers in Immunology : journal. — 2013. — 1 January (vol. 4). — P. 275. — doi:10.3389/fimmu.2013.00275. — PMID 24062743. — PMC 3775265.
  27. ↑ Lamkanfi M., Denecker G., Kalai M., D'hondt K., Meeus A., Declercq W., Saelens X., Vandenabeele P. INCA, a novel human caspase recruitment domain protein that inhibits interleukin-1beta generation (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2004. — December (vol. 279, no. 50). — P. 51729—51738. — doi:10.1074/jbc.M407891200. — PMID 15383541.
  28. ↑ Dorfleutner A., Talbott S. J., Bryan N. B., Funya K. N., Rellick S. L., Reed J. C., Shi X., Rojanasakul Y., Flynn D. C., Stehlik C. A Shope Fibroma virus PYRIN-only protein modulates the host immune response (англ.) // Virus Genes : journal. — 2007. — December (vol. 35, no. 3). — P. 685—694. — doi:10.1007/s11262-007-0141-9. — PMID 17676277. — PMC 4257706.