Лихобо́рка — река в Северном и Северо-Восточном административных округах города Москвы, правый приток реки Яузы.
Се́тунь — река на западе Москвы и в Московской области, правый приток реки Москвы. Общая длина — 38 км. Площадь водосборного бассейна — 190 км². Расход воды — 1,33 м³/с. Отличительной особенностью от многих других московских рек является протекание преимущественно в открытом русле и по сохранившейся долине.
Би́тца — река на юго-западе Москвы и в Московской области, значительный левый приток Пахры, второй по длине и мощности. В верховьях Битцы находятся памятники природы: усадьба «Малое Голубино», «Старый ельник в усадьбе Знаменское-Садки», Знаменский смешанный лес и Знаменская суборь. В долине реки расположены экологические тропы, по которым проходят экскурсии. Купание в реке запрещено.
В пределах МКАД находятся около 150 малых рек и ручьёв, а также около 240 открытых водоёмов. Большинство малых рек в черте города заключены в коллекторы.
Ка́менка — река в Северо-Восточном административном округе Москвы, правый приток Яузы. Частично заключена в подземный коллектор. Название Каменка характерно для рек с каменистым руслом. К югу от улицы Академика Комарова по правому берегу реки находился Кашёнкин луг, от которого Каменка получила название Кашенка. Приустьевый участок Каменки является прежним руслом Яузы.
И́чка — река в Москве и Московской области России, левый приток Яузы. Большая часть водосборного бассейна находится на лесной территории национального парка «Лосиный Остров», поэтому Ичка — одна из самых чистых московских рек. Часть речной долины в 1991 году объявили памятником природы. По состоянию на 2018-й она является ландшафтным заказником «Долина реки Ички» общей площадью 81,4 га. На берегах Ички находились пустошь Свитягина и деревня Малые Мытищи. Левыми притоками реки являются ручьи Каменный и Лось.
Жа́бенка — река в Тимирязевском районе Северного административного округа Москвы, правый приток Лихоборки. Своё название получила от слова «жаба». Речное русло частично заключено в подземный коллектор. Вода Жабенки загрязнена нефтепродуктами и солями тяжёлых металлов. Левым притоком реки является Коптевский ручей, правым — Фермерский ручей.
Нато́шенка — река на западе Москвы, правый приток реки Сетуни.
Со́сенка — река в Москве, правый и основной исток (приток) Хапиловки. Длина — 8,8 километра. Сейчас основная часть русла Сосенки заключена в коллектор. Площадь бассейна около 30 км².
Бары́шиха — река на северо-западе города Москвы и в Московской области, в том числе на территории Митино, СЗАО города Москвы; левый приток Москвы-реки. Длина 3 км, постоянное течение на протяжении 1,6 км.
Черепишка — река на юге Москвы, в районе Бирюлёво Восточное. Левый приток Язвенки.
Со́сенка — река в России, протекает на новых территориях города Москвы, до 1 июля 2012 года — в Ленинском районе Московской области. Впадает в реку Десну в 24 км от её устья по левому берегу. Длина реки составляет 20 км, площадь водосборного бассейна — 107 км².
Крыла́тский руче́й — водоток в районе Крылатское Западного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки на территории ландшафтного заказника «Крылатские холмы». По степени техногенной трансформации относится к III классу — в открытом течении проходит на 10—49 %, речное русло сильно трансформировано. Река протекает в овраге Каменная Клетва, который является самой длинной и крупной по площади овражно-балочной системой «Крылатских холмов».
Спирков вра́жек — небольшая река в Северном административном округе Москвы, левый приток Лихоборки. Протекает по территории Западного Дегунино, Дмитровского и Головинского районов. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — речное русло заключено в подземный коллектор, поверхностный водоток утрачен.
Лиано́зовский ручей — ручей в районе Лианозово города Москвы, правый приток Алтуфьевской речки (Самотёки), частично сохранился в открытом русле.
Оле́ний руче́й — ручей в парке «Сокольники» города Москвы, правый приток Яузы, частично заключён в коллектор.
Богаты́рский ручей — ручей в Москве, на территории национального парка Лосиный Остров, левый приток Яузы. Протекает в основном в открытом русле.
Беску́дниковский ручей (Ржа́вец) — малая река в районе Бескудниково Северного административного округа города Москвы, левый приток Лихоборки. Длина ручья составляет около 3,3 км. Своё название ручей получил от славянского слова «ржавец», обозначающего стоячее болото с застойной и ржавой водой; ручей из такого болота; ржавую, окисленную железом, красно-бурую воду. Второй гидроним ручья произошёл от деревни Бескудниково.
Миха́йловский овраг — малая река в Москве и Московской области, левый приток Битцы. Верховья реки засыпаны, речное русло южнее МКАД трансформировано и заключено в подземный коллектор. На территории Аннинского лесопарка сохранился в открытом течении на протяжении 350 метров. Название антропонимическое.
Петря́ев овраг — малая река в Москве и Московской области, левый приток Битцы. На территории города заключена в подземный коллектор. Своё название получила от фамилии Петряев или от личного имени Петряй.
— исток, 
— устье
