Красная книга Российской Федерации (ККРФ) — основной государственный документ, учреждённый в целях выявления редких и находящихся под угрозой исчезновения диких животных, дикорастущих растений и грибов, а также некоторых подвидов и локальных популяций. Правовую основу формирования и ведения ККРФ и Красных книг субъектов Российской Федерации составляют Закон Российской Федерации «Об охране окружающей природной среды» от 19 декабря 1991 года и Федеральный закон «О животном мире» от 5 мая 1995 года. Ведение и издание Красной книги Российской Федерации выполняет обязательства России по принятой в 1992 году в Рио-де-Жанейро Конвенции о биологическом разнообразии.
Красная книга Чукотского автономного округа — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Чукотского автономного округа. Она была подготовлена специалистами Департамента промышленной и сельскохозяйственной политики Чукотского автономного округа и учёными Института биологических проблем Севера ДВО РАН.
Красная книга Приморского края — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Приморского края. Она была подготовлена учёными Биолого-почвенного института ДВО РАН при содействии администрации Приморья.
Красная книга Хабаровского края — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Хабаровского края. Она была подготовлена специалистами Министерства природных ресурсов Хабаровского края и учёными Института водных и экологических проблем ДВО РАН.
Красная книга Еврейской автономной области — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Еврейской автономной области. Она была подготовлена учёными Института комплексного анализа региональных проблем (Биробиджан) ДВО РАН при поддержке правительства Еврейской автономной области и Управления природных ресурсов и охраны окружающей среды Министерства природных ресурсов России по Еврейской автономной области.
Красная книга Воронежской области — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Воронежской области. Она была подготовлена учёными Воронежского государственного университета и специалистами Управления по экологии и природопользованию Воронежской области при поддержке правительства Воронежской области.
Красная книга Рязанской области — официальный документ, содержащий аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Рязанской области, сведения о их состоянии и распространении, а также необходимых мерах охраны. Учреждена Постановлением главы Администрации Рязанской области № 203 от 16 апреля 2001 года. Первое региональное издание выпущено в 2001 году и 2002 году.
Красная книга Тульской области — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Тульской области. Она была подготовлена специалистами Департамента Тульской области по экологии и природным ресурсам и учёными из других регионов России.
Красная книга Ямало-Ненецкого автономного округа — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Ямало-Ненецкого автономного округа. Она была подготовлена к 80-летию образования Ямало-Ненецкого округа специалистами департамента по охране, воспроизводству и регулированию использования биоресурсов Ямало-Ненецкого автономного округа и учёными Института экологии, растения, животных Уральского отделения РАН.
Красная книга Иркутской области — официальный документ, содержащий аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Иркутской области, сведения о их состоянии и распространении, а также необходимых мерах охраны. Учреждена в 2008 году на основании Закона Иркутской области «О Красной книге Иркутской области».
Красная книга Липецкой области — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Липецкой области. Она была подготовлена коллективом учёных под редакцией В.С. Новикова и В.М. Константинова.
Красная книга Курской области — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Курской области.
Красная книга Орловской области — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Орловской области. Она была подготовлена коллективом учёных под редакцией О. М. Пригоряну и при содействии администрации Орловской области.
Красная книга Брянской области — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Брянской области. Она была подготовлена коллективом учёных под редакцией Ю. П. Федотова.
Красная книга Пензенской области — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Пензенской области. Она была подготовлена коллективом учёных под редакцией А. И. Иванова и В. Ю. Ильина при поддержке Комитета природных ресурсов по Пензенской области.
Красная книга Московской области — официальный документ, содержащий аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Московской области, сведения о их состоянии и распространении, а также необходимых мерах охраны. Учреждена Постановлением Правительства Московской области от 13 февраля 1997 года № 11/4 и впервые опубликована в 1998 году.

Красная книга Кировской области — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Кировской области. Красная книга Кировской области является официальным изданием, предназначенным как для специалистов, так и для широкого круга читателей.
Красная книга Новосибирской области — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Новосибирской области. Она была подготовлена специалистами Департамента природных ресурсов и охраны окружающей среды Новосибирской области.
Красная книга Омской области — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Омской области. Она была подготовлена коллективом учёных Омского государственного педагогического университета при поддержке правительства Омской области.
Красная книга Удмуртской республики — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Удмуртской республики. Она была подготовлена коллективом учёных под редакцией В. В. Туганаева (растения) и Н. Е. Зубцовского (животные).