Сту́пинский райо́н — административно-территориальная единица (район) и одноимённое муниципальное образование, существовавшие до июня-июля 2017 года в Московской области России.
Ма́лино — посёлок городского типа в Ступинском районе Московской области России; крупнейший населённый пункт муниципального образования «Городское поселение Малино».
Суково — село в Ступинском районе Московской области.
Батайки — село в Ступинском районе Московской области.
Ситне-Щелканово — село в Ступинском районе Московской области России; в составе городского поселения Ступино.
Мартыновское — село в городском округе Ступино Московской области России. До 2017 года входило в состав сельского поселения Аксиньинское, до 2006 года — в состав Большеалексеевского сельского округа).
Мещерино — село в Ступинском районе Московской области. В 2006—2017 годах входило в состав Аксиньинского сельского поселения, а до 2006 года — в Мещеринский сельский округ. Мещерино связано автобусным сообщением с Москвой и соседними населёнными пунктами. В Мещерино на 2015 год 14 улиц и 4 садовых товарищества. Также к селу относится расположенная в 2,5 км юго-западнее территория Мещерино-1 — военный городок бывшей в/ч 86646.
Покровское — село в Ступинском районе Московской области в составе Аксиньинского сельского поселения. По имеющимся сведениям, село, как Сухотино, Свербеево тож, известно с 1577 года, с 1627 года — Покровское. Покровское на 2015 год фактически крупный дачный посёлок: при 7 жителях в селе 3 улицы и 3 садовых товарищества. В селе действует Церковь Покрова Пресвятой Богородицы постройки конца XVI — начала XVII века, редкий образец вотчинной архитектуры, памятник архитектуры федерального значения.
Авдулово-1 — село в Ступинском районе Московской области в составе Леонтьевского сельского поселения. В Авдулово-1 на 2015 год одна улица Осенняя. В Авдулово в XVII веке находилась усадьба старинного дворянского рода Юреневых, от которой сохранилась только Церковь Покрова Пресвятой Богородицы 1762 года постройки, памятник архитектуры федерального значения.
Верховлянь — село в Ступинском районе Московской области в составе Леонтьевского сельского поселения. В Верховляни на 2015 год одна улица и 2 переулка. В Верховляни находится полуразрушенная Церковь Рождества Пресвятой Богородицы конца XIX века постройки.
Семёновское — село в Ступинском районе Московской области центр Семёновского сельского поселения. На 2015 год в Семёновском 16 улиц, тупик, 2 ГСК и 3 садовых товарищества. В Семёновском находится усадьба графов Орловых Отрада-Семёновское, памятник архитектуры федерального значения. Также действует Никольская церковь, 1778—1781 годов постройки, памятник архитектуры федерального значения и мавзолей-усыпальница Орловых (она же Церковь Успения Пресвятой Богородицы в Семеновском-Отраде, также федеральный памятник. Село связана автобусным сообщением с соседними населёнными пунктами и Серпуховом.
Хатунь — село в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения.
Старая Ситня — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Ступино. На 2016 год в Старой Ситне 14 улиц, 2 переулка и 7 садовых товариществ. Впервые в исторических документах упоминается в 1577 году, как половинка села Старого на речке Ситне, в 1627 году — как полсела Старого Ситны. В селе в середине XVIII века ротмистром Я. А. Татищевым была основана усадьба, от которой сохранились остатки регулярного парка, от которой сохранилась церковь Рождества Богородицы, в стиле елизаветинского барокко, построенная в 1767 году, памятник архитектуры федерального значения.
Старое — деревня в Ступинском районе Московской области России в составе городского поселения Ступино. На 2016 год в Старом одна улица — Богородицкая и садоводческое товарищество. Впервые упоминается в писцовых книгах 1575 года, как Комаревского стана сельцо Старое в вотчине дьяка А. Шерефетдинова. Деревня связана автобусным сообщением с соседними населёнными пунктами. В 1775 году в Старом была построена деревянная церковь Рождества Богородицы, на месте которой, в 1896 году возвели кирпичную, в русском стиле, ныне — памятник архитектуры федерального значения.
Алешково — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Ступино. На 2016 год в Алешково 2 улицы — Луговая и Успенская.
Кондрево — село в Ступинском районе Московской области России в составе городского поселения Ступино. На 2016 год в Кондреве две улицы и два переулка. Село связано автобусным сообщением с соседними населёнными пунктами. Впервые в исторических документах упоминается в 1577 году как Кондырева. В селе в конце XVIII века была построена церковь Воскресения Словущего с Тихвинским и Корсунским приделами, уничтоженная в середине XX века.
Лужники — село в Ступинском районе Московской области в составе городского поселения Ступино. На 2016 год в Лужниках 13 улиц, 3 гск и 1 садовое товарищество. Село связано автобусным сообщением с городами Ступино и Кашира. Впервые в исторических документах упоминается в 1559 году, как пожалованная Белопесоцкому монастырю. В селе, со 2-й половины XVI века, действовала деревянная Троицкая церковь, сгоревшая в 1812 году и отстроенная в камне в 1813—1847 годах, памятник архитектуры федерального значения.
Вихорна — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Ступино. На 2016 год в Вихорне 1 улица — Речная. Впервые в исторических документах упоминается в 1401 году. В Вихорне действует церковь Рождества Пресвятой Богородицы 1860-х — 1870-х годов постройки.
Иван-Теремец — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Жилёво. На 2016 год в Иван-Теремец 4 улицы.
Кишкино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Михнево. На 2016 год Кишкино, фактически, дачный посёлок: при 1 жителе в деревне 5 улиц, 8 переулков и 7 садовых товариществ.