
О памятнике природы см. Андома-гора

Большая Уя — река в России, протекает по Прионежскому району Карелии.
Ве́рхняя — река в России, протекает по территории Онежского района Архангельской области.

Кумса — река в России, протекает по Медвежьегорскому району Карелии.
Кяй — река в России, протекает по Прионежскому району Карелии.
Лемай — река в России, протекает по Пряжинскому району Карелии.
Ли́жма — река в России, протекает по Кондопожскому району Республике Карелия.
Мегра́ — река в Вытегорском районе Вологодской области России, впадает в Онежское озеро.
Мужала — река в России, протекает по территории Подпорожского района Ленинградской области, но небольшая часть в районе истока расположена на территории Прионежского района Карелии. Устье реки находится в 23 км от устья Важинки по левому берегу. Длина реки — 44 км, площадь водосборного бассейна — 361 км². Берёт своё начало из озера Малое Мужало, протекает через озеро Большое Мужало.

Не́мина — река в России, в Медвежьегорском районе Карелии.

Остёр — река в России, протекает по Медвежьегорскому району Карелии. Устье реки находится в 14 км по левому берегу реки Кумса. В устье реки на её левом берегу расположен посёлок Падун, а в самой реке — одноимённый порог.

Рагнукса — река в России, протекает по Пудожскому району Карелии.
Робрека — река в Вытегорском районе Вологодской области, течёт по территории Оштинского сельского поселения. Вытекает из Робозера, течёт на север, поворачивает на восток, затем на юг и впадает в Водлицу сразу после её истока из Павшозера. Длина реки составляет 7 км.
Самина — река в России. Исток берёт в Саминском озере на территории Саминского сельского поселения Вытегорского района Вологодской области, большая часть русла расположена на территории того же сельского поселения, небольшой участок в Пудожском районе Республики Карелия, устье — в 18 км по правому берегу реки Андома, на территории Андомского сельского поселения Вытегорского района. Длина реки составляет 79 км.
- В 64 км от устья по правому берегу реки впадает Сахатручей
- В 45 км от устья по левому берегу реки впадает Пертручей
- В 32 км от устья по правому берегу реки впадает река Челма.
- В 34 км от устья по левому берегу реки впадает река Хмелевица.
- В 4 км от устья по левому берегу реки впадает река Пажия.
- В 19 км от устья по левому берегу реки впадает река Куржекса.
- Более мелкие притоки: Матручей, Турнега.
Сарка, Пельдужская Сарка — река в России, левый приток Капши. Протекает по Тихвинскому и Лодейнопольскому районам Ленинградской области.

Семча или Семчь — река в России, протекает в Республике Карелия.
Суккозерка — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Исток — Суккозеро, в которое впадает река Сулос, несущая воды озёр Сулосъярви, Чангас и Таразма. Впадает в озеро Торос — исток Торосозерки. Длина реки составляет 8,6 км, площадь водосборного бассейна — 369 км².

Шалица — река в России, протекает по Пудожскому району Карелии. Устье реки находится в 5 км по правому берегу Водлы, напротив посёлка Шальский. Длина реки составляет 104 км, площадь водосборного бассейна — 992 км².

Южная Ижмукса — река в России, протекает по Медвежьегорскому району Карелии.

Ялега — малая река в Вытегорском районе Вологодской области России. Устье реки находится в 8 км от устья правой протоки Андомы. Высота устья — 33,1 м над уровнем моря. Длина реки составляет 26 км, площадь водосборного бассейна — 114 км².