Лендерка — река в России и Финляндии, протекает по территории Муезерского района Республики Карелия.
Аймо — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Килькон — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Мельничья, Колвас или Килвас — река в России, протекает по территории Муезерского района Карелии, впадает в Лексозеро. Длина реки — 14 км, площадь водосборного бассейна — 524 км². Берёт своё начало из озера Колвас, протекает через озёра: Ченус, Руогосельга, Лавансельга, Талвизлакши, плюс имеет приток, вытекающий из озера Струналампи.
Конди — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Короппи — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Впадает в губу Неунаш озера Тулос. Длина реки составляет 4,6 км, площадь водосборного бассейна — 325 км².
Кюно — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Река берёт начало из озера Редъярви, протекает через озеро Кюно и впадает в озеро Киви, которое через озеро Вожъярви связано с Лексозером. Длина реки составляет 17 км, площадь водосборного бассейна — 220 км².
Мануноя — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 300 м по левому берегу реки Войдомы. Длина реки составляет 14 км.
Марья — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Мечелоут — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 6 км по левому берегу реки Сулы. Длина реки составляет 10 км, площадь водосборного бассейна 104 км². В реку впадает правобережный приток — река Можоки.
Ожма — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии, менее чем в 5 км от государственной границы.
Омельянйоки — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Пай — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 8 км от устья реки Термант по правому берегу. Длина реки составляет 11 км.
Пе́нинга — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Рихилампи — река в России, протекает по Суоярвскому району Карелии. Впадает в озеро Кюляярви. Длина реки составляет 20 км, площадь водосборного бассейна — 90,1 км².
Салма — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 1,5 км по левому берегу реки Нолы. Длина реки составляет 12 км, площадь водосборного бассейна — 177 км².
Хауге, в верхнем течении Келарви, — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Шаверка — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 25 км от устья Хаапайоки по левому берегу. Длина реки составляет 17 км, площадь водосборного бассейна — 290 км².
Шаори — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Впадает в озеро Войдома — исток реки Войдомы. Длина реки составляет 13 км.
Сула — река в России, протекает в Муезерском районе Карелии Берёт своё начало из Лексозера, протекает через Каргиозеро. На берегу этого озера расположен единственный населённый пункт вблизи реки — Кимоваара. Сула впадает в одноимённое озеро. Длина Сулы составляет 21 км, площадь водосборного бассейна 3760 км².
