Нью-Йоркский метрополитен представляет собой сеть линий с большим количеством развилок и рельсовых соединений. Движение поездов организовано по маршрутам, в связи с чем понятие «линии» — «классическое» следование поезда строго по одному отрезку пути в одном направлении до смены направления движения — в Нью-Йоркском метрополитене как таковое отсутствует — линией является отрезок пути со станциями. По каждой линии может проходить несколько разных маршрутов, которые, в свою очередь, могут переходить с одной линии на другую и менять свой режим — с локального на экспресс.
Линия Брайтон, Би-эм-ти — линия дивизионов BMT и IND метрополитена Нью-Йорка. Следует из центрального Бруклина на юг к району Брайтон-Бич и далее на запад к району Кони-Айленд. Обслуживается маршрутами: B, D (ночью) и Q (круглосуточно).
A Eighth Avenue Express — один из маршрутов Нью-Йоркского метрополитена. Пролегает по трём районам города: Манхэттену, Бруклину и Куинсу. Это самый длинный маршрут в метрополитене: свыше 31 мили, следуя от станции Инвуд — 207-я улица в Манхэттене до Фар-Рокавей — Мотт-авеню в Куинсе. Маршрут проходит по линиям Восьмой авеню, Ай-эн-ди, Фултон-стрит, Ай-эн-ди, и Рокавей, Ай-эн-ди. На картах, станциях, вагонах и т. д. он обозначается синим цветом, поскольку проходит по линии Восьмой авеню.
E Eighth Avenue Local — маршрут Нью-Йоркского метрополитена, проходящий в Куинсе и Манхэттене. Является одним из самых загруженных во всей системе. Маршрут проходит по линиям Куинс-бульвара, Ай-эн-ди, Арчер-авеню, Ай-эн-ди, и Восьмой авеню, Ай-эн-ди. На картах, станциях, вагонах и т. д. он обозначается синим цветом, поскольку проходит по линии Восьмой авеню.
G Brooklyn—Queens Crosstown Local — маршрут Нью-Йоркского метрополитена, проходящий в Куинсе и Бруклине. Маршрут проходит по линиям Кросстаун, Ай-эн-ди, и Калвер, Ай-эн-ди. На картах, станциях, вагонах и т. д. он обозначается салатовым цветом, поскольку проходит по линии Кросстаун. Это единственный нечелночный маршрут в Нью-Йоркском метро, который не проходит через Манхэттен.
R — один из маршрутов Нью-Йоркского метрополитена. Маршрут проходит по линиям Куинс-бульвара, Ай-эн-ди, Бродвея, Би-эм-ти, и Четвёртой авеню, Би-эм-ти. На картах, станциях, вагонах и т. д. он обозначается жёлтым цветом, поскольку проходит по линии Бродвея.
«Хойт-стрит — Скермерхорн-стрит» — станция Нью-Йоркского метрополитена, расположенная на линиях Фултон-стрит, Ай-эн-ди, и Кросстаун, Ай-эн-ди. Находится в Бруклине, на пересечении Хойт-стрит и Скермерхорн-стрит. Станция имеет шесть путей и четыре островных платформы. На станции останавливаются маршруты: A (круглосуточно), C и G (круглосуточно). По двум центральным путям станции проходят поезда маршрута G, а по двум следующим — маршрутов A и C.
Франклин-авеню — пересадочный узел Нью-Йоркского метро. Этот пересадочный узел расположен в Бруклине, в районе Бедфорд — Стайвесант, на пересечении Франклин-авеню и Фултон-стрит. Он был открыт 18 октября 1999 года — намного позже, чем составляющие его станции.
«Ютика-авеню» — станция Нью-Йоркского метрополитена, расположенная на линии Фултон-стрит, Ай-эн-ди. Станция находится в Бруклине, в районе Бедфорд-Стайвесант, на пересечении Ютика-авеню и Фултон-стрит. На станции останавливаются маршруты A (круглосуточно) и C. Экспресс-пути используются маршрутом A. Локальные пути используются маршрутами A (ночью) и C.
IND Fulton Street Line — одна из многочисленных линий Нью-Йоркского метро. Линия начинается на Джей-стрит — Метротек около Ист-ривер в Бруклине и заканчивается на Озон-парк — Леффертс-бульвар в Куинсе, следуя в основном через центральный Бруклин. От линии в восточной её части ответвляется Линия Рокавей, Ай-эн-ди. На большей своей части линия четырёхпутная, обслуживается экспрессами и локальными поездами. Подземная часть линии располагается в Бруклине, эстакадная — в Куинсе. Имеются также трёх- и двухпутные участки. Двухпутный участок очень короткий — от Юклид-авеню до выхода линии на поверхность. Трёхпутный участок — вся эстакадная часть линии, причем средний экспресс-путь для движения поездов не используется.
«Брайарвуд» (англ. Briarwood) — станция Нью-Йоркского метрополитена, расположенная на линии Куинс-бульвара, Ай-эн-ди. Станция находится в Куинсе, в округе Брайарвуд, на пересечении 84-й драйв и бульвара Ван-Уайк. На станции останавливаются маршруты: E, F (круглосуточно) и <F>. Станцию проходит без остановки маршрут E.
«Куинс-Плаза» — станция Нью-Йоркского метрополитена, расположенная на линии Куинс-бульвара, Ай-эн-ди. Станция находится в Куинсе, в округе Лонг-Айленд-Сити, на пересечении Северного бульвара с Джексон-авеню. На станции останавливаются маршруты: E (круглосуточно), M и R.
«Сатфин-бульвар» — станция Нью-Йоркского метрополитена, расположенная на линии Куинс-бульвара, Ай-эн-ди. Станция находится в Куинсе, в округе Джамейка, на пересечении Сатфин-бульвара с Хилсайд-авеню. На станции останавливаются маршруты F (круглосуточно) и <F>. Станцию проходит без остановки маршрут E.
IND Queens Boulevard Line — одна из линий дивизиона B Нью-Йоркского метрополитена. Линия проходит два района Нью-Йорка — Манхэттен и Куинс, работая в Манхэттене под 53-я улица (Манхэттен). На всем своем участке линия не выходит на поверхность. Манхэттенская часть линии также известна под названием 53rd Street Line.
«Бродвей» (англ. Broadway) — станция Нью-Йоркского метрополитена, расположенная на линии Кросстаун, Ай-эн-ди. Станция находится на пересечении Бродвея и Юнион-авеню в округе Уильямсберг, Бруклин. На станции останавливается маршрут G (круглосуточно).
«Бедфорд-авеню — Ностранд-авеню» — станция Нью-Йоркского метрополитена, расположенная на линии Кросстаун, Ай-эн-ди. Находится на Лафайет-авеню между Ностранд-авеню и Бедфорд-авеню в округе Бедфорд — Стайвесант, Бруклин. На станции останавливается маршрут G (круглосуточно).
«Фултон-стрит» — станция Нью-Йоркского метрополитена, расположенная на линии Кросстаун, Ай-эн-ди. Станция находится на Лафайет-авеню между Фултон-стрит и Саут Портланд-авеню в округе Форт-Грин, Бруклин. На станции останавливается маршрут G (круглосуточно).
Линия Фултон-стрит, Би-эм-ти — бывшая линия Нью-Йоркского метро, эксплуатировавшаяся «Транспортной корпорацией Бруклина и Манхэттена» и с 1940 по 1956 год входившая в состав Дивизиона B. Обслуживала районы Куинс и Бруклин. Линия шла над Фултон-стрит, от станции Фултон-Ферри в одноимённом округе Центрального Бруклина на восток, в округ Ист-Нью-Йорк, затем поворачивала на юг и шла над Ван-Синдерен-авеню и Снедикер-авеню, затем линия опять поворачивала на восток и шла над Питкин-авеню, поворачивала на север и шла над Юклид-авеню и, наконец, в последний раз поворачивала на восток и шла над Либерти-авеню до своей восточной конечной станции Леффертс-авеню — 111-я улица в округе Озон-Парк в Куинсе.
Корт-стрит — бывшая станция Нью-Йоркского метро, расположенная в Бруклине на неиспользуемой ветке линии Фултон-стрит. Станция была построена как конечная для локальных поездов и открыта 9 апреля 1936 года вместе с большим участком линии. Она имеет одну островную платформу и два пути, заканчивающихся тупиками. Закрыта в 1946 году, открыта заново в 1976 как Транспортный музей Нью-Йорка. Является одной из всего двух станций компании Ай-эн-ди, которые были закрыты, и единственной из них сохранившейся до наших дней.
Линия Всемирной выставки — линия Нью-Йоркского метрополитена в боро Куинс, построенная к Всемирной выставке 1939 года, состоявшая из одной станции и просуществовавшая полтора года. Является единственной линией, относившейся к сети Ай-эн-ди и не сохранившейся до наших дней.
Станция 
