Сундоба — река в России, впадает в волжское Горьковское водохранилище слева, протекает в Рыбинском районе Ярославской области.
Вожерка — река в России, протекает по Ярославской области. Исток реки находится менее чем в 1 км к западу от деревни Устимово, течёт на север, затем северо-восток через деревни Чудимово, Демидково, Ворошилки, Колотово, Стряпково. Устье реки находится в 72 км от устья Ухр по левому берегу. Длина реки составляет 27 км. Площадь водосборного бассейна — 139 км².
Воля — река в России, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Исток реки находится к югу от деревни Кузнецово, река течёт на север, а после деревни Кузнецово поворачивает на северо-запад, протеккает через Большое Погорелово, вблизи Милюшино и около деревни Костино впадает в водохранилище. Устье реки находится по левому берегу Рыбинского водохранилища, ниже (южнее) устья реки Ухра и выше (севернее) устья ручья Татьянка. Длина реки составляет 12 км.
Ега — река в России, протекает по Пошехонскому району Ярославской области. Длина реки составляет 17 км. Площадь водосборного бассейна — 55,4 км².
Керома — река в России, протекает по Пошехонскому району Ярославской области.
Ке́штома — река в Ярославской области России, впадает в Рыбинское водохранилище, протекает по территории Пошехонского района. Длина реки составляет 48 км, площадь водосборного бассейна — 201 км².
Кибрик — река в России, протекает в Грязовецком районе Вологодской области и Первомайском районе Ярославской области. Устье реки находится в 14 км по левому берегу реки Кема. Длина реки составляет 11 км.
Конглас — река в России, протекает по Ярославской области. Исток реки находится около деревни Малые Ночевки. Река течёт в основном на юг, отклоняясь сначала к западу, а затем к востоку. Населённые пункты по пути реки: Соловьево, Сергеевское, Ивахово, Бобылино, Федякино. Устье реки находится в 60 км по правому берегу реки Ухра, между деревнями Ладейки и Слобода. Длина реки составляет 21 км.
Нахта — река в России, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Исток реки находится в сети мелиоративных канав к северо-востоку от деревни Большие Мхи. Река течёт на северо-запад по лесной ненаселённой местности, через урочище Ладыгино, около 9 км. Первый населённый пункт на реке по правому берегу — деревня Косково. Река меняет направление на западное, в деревне Огарково, центре сельского поселения, она пересекает дорогу Р104 на участке Рыбинск-Пошехонье. Далее около 4 км она течёт по лесной местности и впадает в Рыбинское водохранилище, примерно в 2 км южнее (ниже) реки Демидовская и в 5 км севернее реки Вонготня. Длина реки составляет 17 км.
Пурновка — река в России, протекает в Череповецком районе Вологодской области. Исток реки находится в болотце к западу от деревни Гурлево. Течёт, в основном, на север по лесной ненаселённой местности. Устье реки находится в 61 км по левому берегу реки Большой Юг в урочище Пурново. Длина реки составляет 12 км. Левый приток речка Талица, длиной около 2 км, также протекает в лесной ненаселённой местности.
Сёбла (Себла) — река в Ярославской и Тверской областях. Впадает в Рыбинское водохранилище.
Угла — река в России протекает по территории Шекснинского района Вологодской области, впадает по левому берегу в Шекснинский русловый участок Рыбинского водохранилища. Длина реки составляет 62 км. Площадь водосборного бассейна — 512 км².
Ухто́ма — река Вологодской и Ярославской областях России, левый приток Согожи, впадает на 29 км от устья. Длина реки составляет 92 км. Площадь водосборного бассейна — 994 км². Река образуется слиянием Полыгалки и Рыбинки на территории Грязовецкого района Вологодской области. Среднее течение проходит по Первомайскому району Ярославской области, перед устьем река втекает на территорию Пошехонского района. Высота истока — 154 м над уровнем моря.
Шарма — река в России, протекает по Череповецкому району Вологодской области. Исток реки находится в ненаселённом елово-берёзовом лесу. Река течёт, в основном, на юго запад. В среднем и нижнем течении на берегах реки ряд деревень: Конятино, Нянькино, Кодино, Фролово, Григорьевское, около устья — Павлоково, здесь реку пересекает автодорога Р104 Пошехонье-Череповец. Устье реки находится в Рыбинском водохранилище. Длина реки составляет 22 км.
Шелекша — река в России, протекает в Первомайском районе Ярославской области. Устье реки находится в 37 км по левому берегу реки Ухтома. Длина реки составляет 38 км.
Шипинка — река в России, протекает по Брейтовскому району Ярославской области. Длина реки — 21 км, площадь водосборного бассейна — 76 км².
Кема — река в России, протекает по Первомайскому району Ярославской области. Длина реки составляет 22 км. Площадь водосборного бассейна — 134 км².
Тресна — река в России, протекает по Вологодской и Тверской областях. Левый приток Званы. Длина — 21 км, площадь водосборного бассейна — 144 км².
Чёбсара — река в России, протекает в Вологодском и Шекснинском районах Вологодской области. Устье реки находится в 20 км по правому берегу реки Угла. Длина реки составляет 21 км.
Лапка — река в России, протекает в Пошехонском районе Ярославской области, правый приток реки Ухра. Устье реки находится на 44 км по правому берегу реки Ухра. Длина реки составляет 10 км.