Языки Индонезии отличаются большим разнообразием. В общей сложности, жители Индонезии говорят более чем на 700 языках. И по количеству языков, и по количеству их носителей доминирует австронезийская семья. Также распространены папуасские языки. Официальным языком является индонезийский, представляющий собой модифицированную версию малайского, используемый в качестве языка межнационального общения, в дело- и судопроизводстве, официальных документах, торговле и т. д. В то же время значительная часть индонезийцев продолжает пользоваться своими родными языками и наречиями, самый большой из которых по числу носителей — яванский. Ряд индонезийцев, проживающих в городах, изучают в школах английский язык в качестве иностранного.
Кендаян — один из австронезийских языков, распространён на острове Калимантан — в провинции Западный Калимантан (Индонезия) и Саравак (Малайзия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 321 тыс. чел. в 2007 году.
Мбалох — один из австронезийских языков, распространён на острове Калимантан — в провинции Западный Калимантан (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 10 тыс. чел. в 1991 году.
Малимпунг — один из австронезийских языков, распространён на острове Сулавеси — в о́круге Пинранг провинции Южный Сулавеси (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 5 тыс. чел. в 1989 году.
Энреканг — один из австронезийских языков, распространён на острове Сулавеси — в округах Пинранг и Энреканг провинции Южный Сулавеси (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 50 тыс. чел. в 1986 году.
Улуманда — один из австронезийских языков, распространён на острове Сулавеси — в округах Полевали-Мандар (Полмас), Маджене и Мамуджу в провинции Западный Сулавеси (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 30 тыс. чел. в 1986 году.
Аралле-табулахан — один из австронезийских языков, распространён на острове Сулавеси — в районе Мамби округа Мамаса провинции Западный Сулавеси (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 12 тыс. чел. в 1984 году.
Калумпанг — один из австронезийских языков, распространён на острове Сулавеси — в районе Калумпанг округа Мамуджу, провинция Западный Сулавеси (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 20 тыс. чел. в 2012 году.
Дусун-дея — один из австронезийских языков, распространён на острове Калимантан — в о́круге Табалонг провинции Южный Калимантан (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 20 тыс. чел. в 1981 году.
Дусун-маланг — один из австронезийских языков, распространён на острове Калимантан — в о́круге Северный Барито провинции Центральный Калимантан (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 4,5 тыс. чел. в 2003 году.
Дусун-виту — один из австронезийских языков, распространён на острове Калимантан — в о́круге Южный Барито провинции Центральный Калимантан (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 5 тыс. чел. в 2003 году.
Паку — один из австронезийских языков, распространён на острове Калимантан — в о́круге Восточный Барито провинции Центральный Калимантан (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 3,5 тыс. чел. в 2003 году.
Секо — группа близкородственных австронезийских языков, распространённых на острове Сулавеси — в провинциях Южный и Западный Сулавеси (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данной группы языков составляло примерно 8 тыс. чел. во второй половине 1980-х годов.
Панасуан — один из австронезийских языков, распространён на острове Сулавеси — в о́круге Мамуджу провинции Западный Сулавеси (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данной группы языков составляло примерно 800 чел. в 2004 году.
Секо-паданг — один из австронезийских языков, распространён на острове Сулавеси — в о́круге Северный Луву провинции Южный Сулавеси (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данной группы языков составляло 5 тыс. чел. в 1985 году.
Будонг-будонг — один из австронезийских языков, распространён на острове Сулавеси — в районе Будонг-Будонг округа Мамуджу, провинция Западный Сулавеси (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данной группы языков составляло 2 тыс. чел. в 2002 году, хотя в 1989 году насчитывалось всего 70 человек, владеющих этим языком.
Балантак — один из австронезийских языков, распространён на острове Сулавеси — в о́круге Бангай провинции Центральный Сулавеси (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 30 тыс. чел. в 2000 году.
Салуанский язык — один из австронезийских языков, распространён на острове Сулавеси — на востоке провинции Центральный Сулавеси (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 76 тыс. чел. в 1978 году.
Бахау — один из австронезийских языков, распространён на острове Калимантан — в нескольких районах округа Западный Кутаи провинции Восточный Калимантан (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 19 тыс. чел. в 2007 году.
Моданг — один из австронезийских языков, распространён на острове Калимантан — в пяти анклавах на территории провинции Западный Калимантан (Индонезия). По данным Ethnologue, количество носителей данного языка составляло 15,3 тыс. чел. в 1981 году.