Больница Святого Духа — бывшая больница, расположенная в северной части района Альтштадт нижнебаварского города Ландсхут. Сегодня здание, которое относилось к архиепархии Мюнхена и Фрайзинга и использовалось как монастырь, является домом престарелых; было построено в 1728 году, расположено напротив позднеготической церкви Святого Духа.
Монастырь Фрауенцель — бывшее бенедиктинское аббатство в одноименном районе коммуны Бреннберг в баварском округе Верхний Пфальц, недалеко от Регенсбурга. Около 1312 года два отшельника поселились в лесу около Бреннберга, а в 1317—1320 годах местный граф Реймар IV пожертвовал им землю для строительства церкви и монастыря; епископ Николаус подтвердил основание монастыря в 1324 году.
Монастырь Пиленхофен — бывший женский цистерцианский монастырь в одноименном муниципалитете коммуны Пиленхофен в баварском округе Верхний Пфальц. Был основан в 1240 году; во время Реформации, в 1542, перешел под светское управление. Был распущен в ходе секуляризации в Баварии, в 1803 году.
Монастырь Аухаузен — бывший бенедиктинский монастырь, располагавшийся на территории баварской коммуны Аухаузен и относившийся к епархии Айхштетта. Со времен Средневековья и по сей день данный монастырь регулярно путают с одноимённым монастырем в городе Хербрехтинген. Согласно местным легендам, баварский монастырь на реке Вёрниц был основан в X веке графом Эрнстом фон Трухендингеном и Хартманном из Лобдебурга.
Монастырь Баумбург — бывший августинский монастырь, располагавшийся на территории верхнебаварского района Траунштайн и распущенный в результате секуляризации 1803 года. Монастырь Святой Маргариты был основан графом Беренгаром I фон Зульцбахом в 1107—1109 годах на территории усадьбы Берхтесгаден.
Монастырь Михельфельд — бывший бенедиктинский монастырь, располагавшийся на территории одноименного района баварского города Ауэрбах-ин-дер-Оберпфальц и относившийся к архиепархии Бамберга. Монастырь был основан 6 мая 1119 года епископом Оттоном I и освящён в честь Святого Михаила и Иоанна Богослова. В ходе Реформации, в 1556 году, монастырь был распущен, но в 1669 его здание было возвращено бенедиктинскому ордену курфюрстом Фердинандом Марией. Новое здание монастыря и его церковь были перестроены между 1680 и 1700 годами по планам архитекторов Иоганна и Вольфганга Динценхоферов.
Монастырь Аура — бывший бенедиктинский монастырь, располагавшийся на территории баварской общины Аура-ан-дер-Зале и относившийся к епархии Вюрцбурга. Монастырь был основан в 1108 году епископом Оттоном I с целью укрепления власти Бамберга в регионе и освящён в честь Святых Лаврентия и Георгия. В 1809 году, в ходе секуляризации в Баварии, монастырь был разделен на восемь частей и продан.
Монастырь Клостербойрен — бывший францисканский монастырь, располагавшийся на территории баварской общины Бабенхаузен. Монастырь, впервые упоминавшийся в документах 1273 года, был освящен в честь Святой Крови и до 1500 года являлся августинским. Во время Тридцатилетней войны он был разграблен, а также — пострадал от эпидемии чумы. Был распущен в ходе секуляризации в Баварии, в 1803 году: около 1860 года монастырские постройки были снесены окончательно.
Монастырь Фолькерсберг — бывший францисканский монастырь, располагавшийся на территории баварской городской общины Бад-Брюккенау. Монастырь, впервые упоминавшийся в документе 1160 года, пострадал от уменьшения числа паломников во время Тридцатилетней войны. В 1707—1710 годах храм и монастырь были расширены: в начале XVIII века в нём проживали 60 монахов-францисканцев. Секуляризация в Баварии не затронула монастырь, поскольку он был классифицирован как «слишком бедный». Сегодня в стенах бывшего монастыря располагаются центр молодёжного образования Фолькерсберг и одноимённая католическая народная школа — обе организации известны под общим названием «Дом Фолькерсберг».
Коллегиальная церковь в Бад-Грёненбахе — бывшая коллегиальная церковь, располагавшаяся на территории баварской общины Бад-Грёненбах. Была создана в 1479 году на пожертвование Людвига фон Ротенштайна и первоначально включала в себя двенадцать секулярных каноников; была распущена 14 мая 1804 года в ходе секуляризации в Баварии. Здание бывшей церкви является памятником архитектуры.
Монастырь Хаузен — бывший монастырь ордена премонстрантов, располагавшийся в одноимённом районе баварской городской общины Бад-Киссинген. Монастырь, освященный в честь Святого Креста, был основан в 1161 году на пожертвование графа Генриха фон Хеннеберга, передавшего землю Вюрцбургской епархии. Возможно, монастырская церковь была построена одновременно с основанием монастыря: при этом первое известное упоминание о церкви датируется 1250 годом. Здание является памятником архитектуры.
Монастырь Святого Зенона — бывший августинский монастырь, располагавшийся на территории баварского города Бад-Райхенхалль. Монастырь — ведший свою историю от одиночной кельи, основанной около 803 года архиепископом Зальцбургским Арно — по легенде был основан императором Карлом Великим. С VIII по IX век считался бенедиктинским монастырем; был восстановлен в 1136 году архиепископом Зальцбургским Конрадом фон Абенсбергом — устав был утверждён 5 апреля.
Монастырь Вехтерсвинкель — бывшее цистерцианское аббатство, располагавшееся на территории баварской общины Бастхайм. Монастырь, относившийся к Вюрцбургской епархии, был основан ранее 1144 года благодаря усилиям епископа Эмбричо, короля Конрада III и ряда неизвестных на сегодняшний день жертвователей. В XVI веке монастырь несколько раз подвергался разграблению.
Монастырь Бенедиктбойерн — бывший бенедиктинский монастырь, располагавшийся на территории баварской общины Бенедиктбойерн и относившийся к Аугсбургской епархии. Был основан около 739/740 года и посвящён Святым Иакову и Бенедикту; в ходе Тридцатилетней войны монастырская школа была распущена, однако уже в 1689 году она была восстановлена и расширена. Сам монастырь был окончательно распущен в 1803 году.
Монастырь Бильдхаузен — бывшее цистерцианское аббатство, располагавшееся недалеко от баварского города Мюннерштадт и относившееся к Вюрцбургской епархии; был расположен в лесисто-холмистой местности на восточной окраине горного массива Рён; основан в 1156 году и распущен в ходе секуляризации в Баварии — в 1803 году.
Монастырь Ау-ам-Инн — бывший мужской августинский монастырь, располагавшийся в одноимённом районе баварской коммуны Гарс-ам-Инн и относившееся к архиепархии Мюнхена и Фрайзинга; обитель регулярных каноников — посвященная Марии, Фелицате и Виталию — была основана архиепископом зальцбургским Конрадом I в 1122 году; распущен в ходе секуляризации в Баварии — в 1803 году; в 1853 году комплекс зданий снова стал монастырем — его заселили монахини-францисканки.
Монастырь Херренкимзе — бывший августинский монастырь, располагавшийся на одноимённом острове на озере Кимзе — на территории коммуны Прин-ам-Кимзе ; был основан по инициативе Юстасия —настоятеля бургундского монастыря Люксёй — между 620 и 629 годами; после секуляризации 1803 года часть комплекса монастырских зданий была преобразована в одноимённый дворец.
Монастырь Хайденфельд — бывший мужской августинский монастырь, располагавшийся на территории баварской деревни Хайденфельд недалеко от Швайнфурта ; обитель была основана в XI веке и распущена в период секуляризации в Баварии — в 1803 году; сегодня его барочные здания занимают монахини из Конгрегации Дочерей Спасителя.
Монастырь Зелигенпортен — бывший монастырь, располагавшийся на территории баварской ярмарочной общины Пирбаум и относившийся к епархии Айхштетта; поочерёдно принадлежал орденам цистерцианок, визитанток и цистерцианцев; женская обитель, посвящённая Деве Марии, была основана в 1242 году Готфридом Старшим и его женой Адельхайд фон Хоэнфельс; был окончательно распущен в 1967 году. В 1976—1979 годах бывшая монастырская церковь была реконструирована; в 2003 году была реконструирована и монастырская пивоварня.
Монастырь Вальдербах — бывшее мужское цистерцианское аббатство, располагавшееся на территории баварской общины Вальдербах и относившееся к епархии Регенсбурга; был основан около 1140 года; являлся филиалом монастыря Альдерсбах; был окончательно распущен в 1803 году — в ходе секуляризации в Баварии. Сегодня в его стенах располагается Окружной музей Вальдербах.