Францисканский монастырь Святого Креста — бывший женский монастырь ордена францисканцев, располагавшийся в районе Фрайунг баварского города Ландсхут и относившийся к архиепархии Мюнхена и Фрайзинга. Был основан около 1480 года и распущен в 1802 — в результате секуляризации, проходившей в те годы в Баварском курфюршестве.
Монастырь Марии Лорето — бывший монастырь ордена капуцинов, в 1835 году ставший францисканским, располагавшийся на площади Мариенплац в баварском городе Ландсхут и относившийся к архиепархии Мюнхена и Фрайзинга. С 2002 года бывшая монастырская церковь Благовещения используется местным приходом Румынской православной церкви.
Монастырь Фрауенцель — бывшее бенедиктинское аббатство в одноименном районе коммуны Бреннберг в баварском округе Верхний Пфальц, недалеко от Регенсбурга. Около 1312 года два отшельника поселились в лесу около Бреннберга, а в 1317—1320 годах местный граф Реймар IV пожертвовал им землю для строительства церкви и монастыря; епископ Николаус подтвердил основание монастыря в 1324 году.
Монастырь Аухаузен — бывший бенедиктинский монастырь, располагавшийся на территории баварской коммуны Аухаузен и относившийся к епархии Айхштетта. Со времен Средневековья и по сей день данный монастырь регулярно путают с одноимённым монастырем в городе Хербрехтинген. Согласно местным легендам, баварский монастырь на реке Вёрниц был основан в X веке графом Эрнстом фон Трухендингеном и Хартманном из Лобдебурга.
Монастырь Аура — бывший бенедиктинский монастырь, располагавшийся на территории баварской общины Аура-ан-дер-Зале и относившийся к епархии Вюрцбурга. Монастырь был основан в 1108 году епископом Оттоном I с целью укрепления власти Бамберга в регионе и освящён в честь Святых Лаврентия и Георгия. В 1809 году, в ходе секуляризации в Баварии, монастырь был разделен на восемь частей и продан.
Монастырь Клостербойрен — бывший францисканский монастырь, располагавшийся на территории баварской общины Бабенхаузен. Монастырь, впервые упоминавшийся в документах 1273 года, был освящен в честь Святой Крови и до 1500 года являлся августинским. Во время Тридцатилетней войны он был разграблен, а также — пострадал от эпидемии чумы. Был распущен в ходе секуляризации в Баварии, в 1803 году: около 1860 года монастырские постройки были снесены окончательно.
Монастырь Хаузен — бывший монастырь ордена премонстрантов, располагавшийся в одноимённом районе баварской городской общины Бад-Киссинген. Монастырь, освященный в честь Святого Креста, был основан в 1161 году на пожертвование графа Генриха фон Хеннеберга, передавшего землю Вюрцбургской епархии. Возможно, монастырская церковь была построена одновременно с основанием монастыря: при этом первое известное упоминание о церкви датируется 1250 годом. Здание является памятником архитектуры.
Монастырь Святого Зенона — бывший августинский монастырь, располагавшийся на территории баварского города Бад-Райхенхалль. Монастырь — ведший свою историю от одиночной кельи, основанной около 803 года архиепископом Зальцбургским Арно — по легенде был основан императором Карлом Великим. С VIII по IX век считался бенедиктинским монастырем; был восстановлен в 1136 году архиепископом Зальцбургским Конрадом фон Абенсбергом — устав был утверждён 5 апреля.
Монастырь Вехтерсвинкель — бывшее цистерцианское аббатство, располагавшееся на территории баварской общины Бастхайм. Монастырь, относившийся к Вюрцбургской епархии, был основан ранее 1144 года благодаря усилиям епископа Эмбричо, короля Конрада III и ряда неизвестных на сегодняшний день жертвователей. В XVI веке монастырь несколько раз подвергался разграблению.
Монастырь Кёнигсхофен-ан-дер-Хайде — бывший августинский монастырь, располагавшийся на территории баварской общины Беххофен (Франкония). Монастырь, посвященный Богородице, был основан в 1422 году, но уже к 1495 году он был распущен; его церковь, называемая Мариенмюнстер, сегодня является храмом местного евангелическо-лютеранского прихода.
Монастырь Бирклинген — бывший августинский монастырь, располагавшийся на территории одноимённого района баварской городской общины Ипхофен и относившийся к архиепархии Бамберга; был основан в 1459 году по инициативе епископа Иоганна фон Грумбаха — распущен в 1546.
Монастырь Бильдхаузен — бывшее цистерцианское аббатство, располагавшееся недалеко от баварского города Мюннерштадт и относившееся к Вюрцбургской епархии; был расположен в лесисто-холмистой местности на восточной окраине горного массива Рён; основан в 1156 году и распущен в ходе секуляризации в Баварии — в 1803 году.
Монастырь Астхайм — бывший мужской монастырь, располагавшийся в одноимённом районе баварского города Фольках и первоначально являвшийся чертозой картезианских монахов недалеко от реки Майн; обитель была основана лордами Зайнсхайма в 1409 году и распущена в ходе секуляризации в Баварии — в 1803 году. Сегодня в бывших монастырский зданиях, являющихся памятниками архитектуры, размещается музей.
Монастырь Химмелькрон — бывший женский цистерцианский монастырь, располагавшийся на территории баварской коммуны Химмелькрон и относившийся к Бамбергской архиепархии; обитель была основана в XIII веке и распущена в XVI — после этого комплекс зданий вплоть до XIX века служил летней резиденцией и охотничьим домом для князей Байрейта.
Монастырь Хоф — бывший мужской францисканский и женский клариссинкский монастыри, располагавшиеся непосредственно рядом друг с другом на территории баварской коммуны Хоф-ан-дер-Заале ; обитель была основана в конце XIII века и распущена в годы Реформации; сегодня часть комплекса монастырских зданий используется гимназией «Jean-Paul-Gymnasium» и благотворительной организацией «Diakonisches Werk».
Монастырь Хайденфельд — бывший мужской августинский монастырь, располагавшийся на территории баварской деревни Хайденфельд недалеко от Швайнфурта ; обитель была основана в XI веке и распущена в период секуляризации в Баварии — в 1803 году; сегодня его барочные здания занимают монахини из Конгрегации Дочерей Спасителя.
Монастырь Химмельталь — бывший женский цистерцианский монастырь, располагавшийся в районе Рюк баварской ярмарочной общины Эльзенфельд и относившийся к епархии Вюрцбурга; обитель была основана в 1232 году по инициативе графа Людвига II фон Риенека и распущена в годы Реформации — в 1568.
Францисканский монастырь Энгельберг — мужской францисканский монастырь, располагающийся недалеко от баварской ярмарочной общины Гросхойбах и относящийся к епархии Вюрцбурга; история обители началась около 1300 года, когда на холме — на месте языческого святилища — была построена деревянная часовня. Является местом паломничества и туристической достопримечательностью региона; известен также статуей Св. Михаила над церковным порталом.
Монастырь Эбрах — бывший мужской цистерцианский монастырь, располагавшийся в баварской ярмарочной общине Эбрах и относившийся к архиепархии Бамберга; монастырь был основан в 1127 году при содействии короля Конрада III — как вспомогательная обитель при аббатстве Моримон; был распущен в ходе секуляризации 1803 года, а с 1851 в монастырских постройках размещается администрация местной тюрьмы.
Монастырь Зоннефельд — бывший женский цистерианский монастырь, располагавшийся на территории баварской общины Зоннефельд и относившийся к епархии Вюрцбурга; обитель была основана в 1260 году Генрихом II фон Зоннеберг и его женой Кунигунде; был распущен в 1525 году. Сегодня здание бывшей монастырской церкви используется местным евангелическо-лютеранским приходом.