Чудско́е о́зеро — крупное пресноводное озеро, является северной составляющей Чудско-Псковского озёрного комплекса.
Псковское озеро — крупное пресноводное озеро, является южной составляющей так называемого Чудско-Псковского озёрного комплекса.
Чу́дско-Пско́вское о́зеро, или Пско́вско-Чудско́е о́зеро — крупный озёрный комплекс на границе между Эстонией и Псковской и Ленинградской областями России. Относится к бассейну Балтийского моря Атлантического океана. Площадь водосборного бассейна — 56 100 км².
Га́уя — река в Латвии, частично протекает по границе с Эстонией. Длина — 452 км, площадь водосборного бассейна — 8900 км². Гауя имеет самое длинное русло в пределах Латвии.
Вы́ртсъярв — пресноводное озеро на юге Эстонии, на границе уездов Тартумаа, Вильяндимаа и Валгамаа. Площадь составляет около 269,19 км², это крупнейшее озеро Эстонии после Чудского озера и самый большой внутренний водоём страны.
Су́уръярв — проточное озеро ледникового происхождения на реке Рыуге в юго-восточной Эстонии. Расположено на территории волости Рыуге в центральной части уезда Вырумаа. Входит в группу из семи глубоководных озёр на западной окраине возвышенности Хаанья, возникших в результате воздействия талых вод во время отступления последнего ледника.
И́да-Ви́румаа, или И́да-Ви́руский уе́зд — один из 15 уездов Эстонии, расположенный на северо-востоке страны. Граничит на севере и востоке с Россией. Территория уезда простирается до Финского залива на севере, до реки Нарвы на востоке и до Чудского озера на юге. На западе и юго-западе уезда граница тянется через леса и болота Алутагузе, вдоль территории Ляэне-Вируского и Йыгеваского уездов. Площадь Ида-Вирумаа — 2971,88 км², что составляет 7,4 % от площади всей Эстонии. В середине северной части уезда, в 165 км от Таллина, находится административный центр Ида-Вирумаа — город Йыхви.
Ю́лемисте — озеро в Таллине, расположено на территории микрорайона Юлемистеярве в южной части района Кесклинн. На озере есть один остров площадью 1,1 га.
Йы́гевамаа или Йы́геваский уе́зд — один из 15 уездов Эстонии, расположенный в восточной части страны. Административный центр — город Йыгева. Уезд состоит из трёх волостей.
Пя́рну — залив вдающийся в юго-западный берег Эстонии. Северо-восточная часть более крупного Рижского залива Балтийского моря.
Са́адъярв или Са́дъярв — эвтрофное озеро в волости Тарту на севере уезда Тартумаа в Эстонии. Расположено в 15 км к северу от Тарту около посёлка Табивере, на территории ландшафтного заповедника Вооремаа.
А́лаярв — озеро в Эстонии, расположено в волости Выру уезда Вырумаа, примерно в 5 км к северу от города Выру. Находится на территории поселка Вяймела. Через протоку на северо-западе соединяется с соседним озером Мяэярв.
Э́раствере — долинное сточное эвтрофное озеро, расположенное в юго-восточной Эстонии, в деревне Эраствере волости Канепи. Из озера Эраствере берёт начало река Ахья.
Тёплое озеро — крупное пресноводное озеро. Является срединной составляющей так называемого Чудско-Псковского озёрного комплекса.
Э́рмисту — озеро в юго-западной Эстонии, административно относится к деревне Эрмисту в волости Тыстамаа уезда Пярнумаа.
Ва́гула — озеро в Эстонии. Расположено в уезде Вырумаа на территории волости Выру в 2 км к западу от города Выру. Через озеро протекает река Выханду, соединяющая Вагулу с озером Тамула, располагающимся в 1,5 км восточнее.
Ве́йсъярв — озеро на юге Эстонии, в волости Вильянди уезда Вильяндимаа. Площадь поверхности — 4,807 км².
Ка́руярв — озеро в Эстонии, расположено в западной части острова Сааремаа, в волости Сааремаа. Площадь поверхности — 3,456 км².
У́хтъярв — эвтрофное озеро в южной части Эстонии. Располагается на территории деревни Ухтъярве волости Антсла в уезде Вырумаа. Относится к бассейну Вяйке-Эмайыги.
Тсо́лго-Му́стъярв или Му́стъярв — эвтрофное озеро на юго-востоке Эстонии. Располагается на территории деревни Тсолго волости Выру в уезде Вырумаа. Четвёртое по глубине среди озёр Эстонии. Входит в состав озёрной группы Тсолго. Относится к бассейну Выханду.
