Су́уръярв — проточное озеро ледникового происхождения на реке Рыуге в юго-восточной Эстонии. Расположено на территории волости Рыуге в центральной части уезда Вырумаа. Входит в группу из семи глубоководных озёр на западной окраине возвышенности Хаанья, возникших в результате воздействия талых вод во время отступления последнего ледника.
Ю́лемисте — озеро в Таллине, расположено на территории микрорайона Юлемистеярве в южной части района Кесклинн. На озере есть один остров площадью 1,1 га.
Су́урвяйн, Виртсу или Суур-Вяйн — пролив, в среднем 7-километровой ширины, отделяющий острова Муху и Сааремаа от материковой части Эстонии, является южной частью пролива Вяйнамери и соединяет его с Рижским заливом. Крупнейшие острова в проливе: Кессулайд и Вийрелайд.
Ко́лгакюла — деревня на севере Эстонии. Административно относится к волости Куусалу уезда Харьюмаа.
Пю́хаярв или Пю́хаярве — озеро в юго-восточной части Эстонии, на территории волости Отепя в уезде Валгамаа. Располагается в курортной местности Пюхаярве у города Отепя к юго-западу от Тарту. Считается одним из красивейших озёр страны.
А́херуярв или Ка́нтиярв — пресноводное озеро на юге Эстонии в уезде Валгамаа в волости Тахева. В 3,5 км к западу от озера находится деревня Койккюла. Иногда озеро также называют озером Сууръярв.
А́лаярв — озеро в Эстонии, расположено в волости Выру уезда Вырумаа, примерно в 5 км к северу от города Выру. Находится на территории поселка Вяймела. Через протоку на северо-западе соединяется с соседним озером Мяэярв.
А́алупи — озеро на юго-востоке Эстонии в уезде Пылвамаа, располагается в пределах территории деревни Ребасте на юго-западе волости Канепи.
Ве́йсъярв — озеро на юге Эстонии, в волости Вильянди уезда Вильяндимаа. Площадь поверхности — 4,807 км².
А́лайыги — река на северо-востоке Эстонии, течёт по территории волости Алутагузе в уезде Ида-Вирумаа. Впадает в Чудское озеро.
Ю́ммаргуне или Ю́маръярв — озеро на северо-востоке Эстонии, располагается на территории деревни Онгассааре волости Алутагузе в уезде Ида-Вирумаа. Относится к водосборному бассейну реки Алайыги, впадающей в Чудское озеро (Пейпси).
Ре́йу — река в Эстонии и Латвии, течёт по территории Стайцельской волости Алойского края (Латвия) и муниципалитетов Саарде, Хяэдемеэсте и Пярну в уезде Пярнумаа (Эстония). Левый приток нижнего течения реки Пярну.
Ве́лизе — река на западе материковой части Эстонии, течёт по территории волостей Мярьямаа, Рапла и Кехтна в уезде Рапламаа, а также волости Ляэнеранна в уезде Пярнумаа. Левый приток нижнего течения реки Вигала.
Ва́лгъярв — озеро на юго-востоке материковой части Эстонии, располагается на территории волости Канепи в уезде Пылвамаа. Относится к водосборному бассейну реки Элва, правого притока Эмайыги.
У́льясте или Ульясти — эвтрофное озеро в северо-восточной части Эстонии. Располагается на территории деревни Ульясте волости Люганузе в уезде Ида-Вирумаа; к северной оконечности озера прилегает территория деревни Ульясте волости Винни уезда Ляэне-Вирумаа. Относится к бассейну реки Пада, впадающей в Финский залив. Входит в состав ландшафтного заповедника Ульясте.
У́хтъярв — эвтрофное озеро в южной части Эстонии. Располагается на территории деревни Ухтъярве волости Антсла в уезде Вырумаа. Относится к бассейну Вяйке-Эмайыги.
Пи́йганди — олиготрофное озеро в юго-восточной части Эстонии. Располагается на территории одноимённой деревни волости Канепи в уезде Пылвамаа. Относится к бассейну Пюхайыги.
Вя́йке-Па́лкна или Ма́зайс-Ба́лтиньш — эвтрофное озеро на латвийско-эстонской границе. Латвийская часть акватории располагается на территории Вецлайценской волости Алуксненского края, эстонская — на территории волости Рыуге в уезде Вырумаа. Второе по глубине среди озёр Эстонии. Входит в состав озёрной группы Корнету. Относится к бассейну Гауи.
Тсо́лго-Му́стъярв или Му́стъярв — эвтрофное озеро на юго-востоке Эстонии. Располагается на территории деревни Тсолго волости Выру в уезде Вырумаа. Четвёртое по глубине среди озёр Эстонии. Входит в состав озёрной группы Тсолго. Относится к бассейну Выханду.
Ке́эма — проточное озеро на юго-востоке Эстонии. Располагается на территории деревни Кеэма волости Выру в уезде Вырумаа. Шестое по глубине среди озёр Эстонии. Входит в состав озёрной группы Кеэма, состоящей из семи небольших озёр. Относится к бассейну Мустйыги.
