Окклюдин

Перейти к навигацииПерейти к поиску
Окклюдин
PDBPDB
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1WPA, 1XAW, 3G7C

Идентификаторы
СимволOCLN ; BLCPMG; PPP1R115
Внешние IDOMIM: 602876 MGI: 106183 HomoloGene: 1905 GeneCards: Ген OCLN
номер EC2.1.1.67
Генная онтология
Функция• protein binding

• thiopurine S-methyltransferase activity

• protein domain specific binding
Компонент клетки• cytosol

• plasma membrane
• cell-cell junction
• bicellular tight junction
• integral component of membrane
• apical plasma membrane
• apicolateral plasma membrane
• cell junction
• endocytic vesicle

• cytoplasmic vesicle
Биологический процесс• protein complex assembly

• apoptotic process
• cellular component disassembly involved in execution phase of apoptosis
• programmed cell death
• methylation
• cell-cell junction organization
• S-adenosylhomocysteine metabolic process
• S-adenosylmethionine metabolic process

• bicellular tight junction assembly
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez10050665818260
EnsemblENSG00000197822ENSMUSG00000021638
UniProtQ16625Q61146
RefSeq (мРНК)NM_001205254NM_008756
RefSeq (белок)NP_001192183NP_032782
Локус (UCSC)Chr 5:
69.49 – 69.56 Mb		Chr 13:
100.5 – 100.55 Mb
Поиск в PubMedИскатьИскать

Окклюдин — интегральный белок с молекулярной массой 65 кДа, который расположен в плотных контактах и является их главным компонентом наряду с клаудинами[1]. У человека оклюдин кодируется геном OCLN и представляет собой 522-аминокислотный полипептид[2][3].

Впервые этот белок был описан в 1993 году Сёитиро Цукитой[1].

Локализация гена OCLN

Ген OCLN расположен на длинном (q) плече хромосомы 5 в позиции q13.1. Он начинается с 69492292 пары оснований и простирается до 69558104 пары оснований, имея в длину 65813 пар оснований. В результате альтернативного сплайсинга экспрессируются две изоформы[4].

Структура белка

В структуре человека выделяют 9 доменов, разделенных на две группы. Первая группа объединяет 5 доменов, расположенных внутриклеточно и внеклеточно, а вторая группа объединяет 4 трансмембранных домены. Эти 9 доменов следующие:

  • N-концевой домен (66 аминокислот)
  • трансмембранный домен 1 (23 аминокислот)
  • внеклеточная петля 1 (46 аминокислот)
  • трансмембранный домен 2 (25 аминокислот)
  • внутриклеточная петля (10 аминокислот)
  • трансмембранный домен 3 (25 аминокислот)
  • внеклеточный домен 2 (48 аминокислот)
  • трансмембранный домен 4 (22 аминокислот)
  • C-концевой домен (257 аминокислот).

C-концевой домен необходим для правильного создания плотных контактов. Он также взаимодействует с несколькими цитоплазматическими белками в соединительном диске и сигнальными молекулами, ответственными за выживание клеток, а его N-концевой домен участвует в уплотненные плотных контактов. Внеклеточная петля оклюдину участвует в регуляции парацелюлярнои проницаемости, а внеклеточный домен 2 участвует в локализации по плотного контакта.

Функции

Окклюдин является важным для функционирования плотных контактов. Он определяет плотность плотных контактов и играет важную роль в обеспечении барьерной функции.

Примечания

  1. ↑ 1 2 Furuse M., Hirase T., Itoh M., Nagafuchi A., Yonemura S., Tsukita S., Tsukita S. Occludin: a novel integral membrane protein localizing at tight junctions (неопр.) // Journal of Cell Biology[англ.]. — 1993. — Т. 123, № 6 Pt 2. — С. 1777—1788. — doi:10.1083/jcb.123.6.1777. — PMID 8276896. — PMC 2290891.
  2. ↑ Ando-Akatsuka Y., Saitou M., Hirase T., Kishi M., Sakakibara A., Itoh M., Yonemura S., Furuse M., Tsukita S. Interspecies diversity of the occludin sequence: cDNA cloning of human, mouse, dog, and rat-kangaroo homologues (англ.) // Journal of Cell Biology[англ.] : journal. — 1996. — May (vol. 133, no. 1). — P. 43—47. — doi:10.1083/jcb.133.1.43. — PMID 8601611. — PMC 2120780.
  3. ↑ Entrez Gene: OCLN occludin.
  4. ↑ [https://web.archive.org/web/20160512030946/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/100506658 Архивная копия от 12 мая 2016 на Wayback Machine OCLN occludin [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI]