Лендерка — река в России и Финляндии, протекает по территории Муезерского района Республики Карелия.
Войдома — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Впадает в озеро Лендерское на реке Лендерке. Длина реки составляет 15 км, площадь водосборного бассейна 590 км².
- В 5,6 км от устья, по правому берегу реки впадает река Пюрика.
- В 0,3 км от устья, по левому берегу реки впадает река Мануноя.
Ермакйоки — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Килькон — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Мельничья, Колвас или Килвас — река в России, протекает по территории Муезерского района Карелии, впадает в Лексозеро. Длина реки — 14 км, площадь водосборного бассейна — 524 км². Берёт своё начало из озера Колвас, протекает через озёра: Ченус, Руогосельга, Лавансельга, Талвизлакши, плюс имеет приток, вытекающий из озера Струналампи.
Короппи — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Впадает в губу Неунаш озера Тулос. Длина реки составляет 4,6 км, площадь водосборного бассейна — 325 км².
Кюно — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Река берёт начало из озера Редъярви, протекает через озеро Кюно и впадает в озеро Киви, которое через озеро Вожъярви связано с Лексозером. Длина реки составляет 17 км, площадь водосборного бассейна — 220 км².
Лабийоки — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Лузингилакши или Лузингийоки — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Марья — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Мечелоут — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 6 км по левому берегу реки Сулы. Длина реки составляет 10 км, площадь водосборного бассейна 104 км². В реку впадает правобережный приток — река Можоки.
Мурдойоки — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Впадает в озеро Минсъярви, соединяющегося с озером Ровкульским, связанного протокой с Большим Ровкульским). Длина реки составляет 41 км, площадь водосборного бассейна 349 км².
- В 12 км от устья, по правому берегу реки впадает река Редунийоки.
- В 1,4 км от устья, по правому берегу реки впадает река Немийоки.
Ожма — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии, менее чем в 5 км от государственной границы.
Пе́нинга — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Рихилампи — река в России, протекает по Суоярвскому району Карелии. Впадает в озеро Кюляярви. Длина реки составляет 20 км, площадь водосборного бассейна — 90,1 км².
Термант — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Длина реки составляет 10 км, площадь водосборного бассейна — 46,2 км².
Толвайоки — река в России, протекает по территории Суоярвского района Карелии. Впадает в озеро Виксинселькя, в 1 км к северо-западу от нежилой деревни Меласельки. Длина реки составляет 25 км, площадь водосборного бассейна 479 км².
Хирвийоки — река в России, протекает по Суоярвскому району Карелии. Впадает в озеро Юля-Виексъярви. Длина реки составляет 16 км.
Юдало — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Сула — река в России, протекает в Муезерском районе Карелии Берёт своё начало из Лексозера, протекает через Каргиозеро. На берегу этого озера расположен единственный населённый пункт вблизи реки — Кимоваара. Сула впадает в одноимённое озеро. Длина Сулы составляет 21 км, площадь водосборного бассейна 3760 км².