Происхождение рептилий — один из важных вопросов в теории эволюции, процесс, в результате которого появились первые животные, относящиеся к классу Пресмыкающиеся.
Брюхоногие, или гастроподы, или улитки (лат. Gastropoda, от др.-греч. γαστήρ — брюхо и πούς — нога), — самый многочисленный класс в составе типа моллюсков (Mollusca), который включает около 110 тыс. видов, в России — 1620 видов. Основным признаком брюхоногих моллюсков является торсия, то есть поворот внутренностного мешка на 180°. Кроме того, для большинства гастропод характерно наличие турбоспиральной раковины.
Маммализа́ция териодо́нтов — процесс постепенного накопления в ветвях синапсид, терапсид и териодонтов признаков, характерных для млекопитающих. Концепцию с таким названием выдвинул в 1976 году Л. П. Татаринов, обративший внимание на параллельное и независимое появление отдельных признаков млекопитающих в различных группах териодонтов.
Терапси́ды (лат. Therapsida) — клада продвинутых синапсид, объединяющая млекопитающих и их вымерших родственников. Согласно филогенетическому определению Т. Б. Роу (2020), терапсиды — наименьшая клада, включающая тринаксодона Thrinaxodon liorhinus Seeley, 1894 (Cynodontia) и биармозуха Biarmosuchus tener Chudinov, 1960 (Biarmosuchia).
Сина́псиды (лат. Synapsida) — клада амниот, включающая млекопитающих и всех вымерших животных, более близких к млекопитающим, чем к завропсидам. Синапсиды легко отличаются от других амниот по височному отверстию, отверстию в нижней части черепной крыши за каждым глазом, образующим под ними костные дуги, что объясняет их название. Возникли в среднем или раннем карбоне, около 310—330 млн лет назад.
Дицинодо́нты (лат. Dicynodontia) — клада растительноядных синапсид из подотряда аномодонтов, которой придают ранг от семейства до отряда. Жили в пермском — начале юрского периода по всему миру.
Пеликоза́вры(лат. Pelycosauria) — группа наиболее древних примитивных синапсид, которой сторонники эволюционной таксономии присваивают ранг отряда. Сохраняли типично рептильную физиологию и внешний облик. Являются парафилетической группой; поэтому сторонники кладистической классификации не считают эту группу таксоном, а название её берут в кавычки: «пеликозавры».
Варанопсеиды, или варанопиды — семейство хищных пеликозавров, известных из отложений с позднего карбона до средней перми. Последние из пеликозавров и единственная группа примитивных синапсид, обнаруженная в Южной Африке.
Казеиды (лат. Caseidae) — семейство растительноядных пеликозавров, существовавших в течение всего пермского периода. Появились в конце нижнепермской эпохи, дожили до середины перми.
Биармозух — примитивный терапсид среднепермской эпохи. Обнаружен в отложениях Очёрского комплекса и Краснощельской формации.
Темноспонди́льные, или расчленённопозвонковые (лат. Temnospondyli, от др.-греч. τέμνειν — резать и σπόνδυλος — позвонок) — в высшей степени разнообразная группа вымерших животных, включающая от маленьких до гигантских примитивных земноводных. Название группы отсылает к тому, что каждый позвонок темноспондильных разделён на несколько частей.
Тероцефалы (лат. Therocephalia) — клада терапсид, традиционно рассматриваемая в ранге подотряда или отряда. Очень примитивные териодонты, возможно, родственные горгонопсам с одной стороны и цинодонтам — с другой. Вместе с цинодонтами образуют группу эутериодонтов (Eutheriodontia).
Эотиридиды — семейство крайне примитивных синапсид нижнепермской эпохи. Близки к казеидам, могут быть их предками. Вместе с казеидами образуют подотряд Caseasauria. М. Ф. Ивахненко отрицает принадлежность казеид, эотиридид, офиакодонтов и варанопсеид к синапсидной ветви амниот. Для этих животных им предложен подкласс Ophiacomorpha. Это связано с особенностями строения височной области этих групп, отличной от таковой настоящих синапсид — тероморфов.
Никказавр — представитель примитивных терапсид из средней перми России.
Диссорофиды — семейство темноспондилов позднего карбона — перми. Наиболее наземные из всех темноспондилов. Скелет массивный, тело короткое, конечности длинные, сильные. Голова огромная относительно размеров тела. Череп высокий и широкий, огромные глазницы, крупное теменное отверстие. Огромные ушные вырезки, судя по строению окружающей кости, содержали барабанную перепонку. Затылочный мыщелок парный. Челюстное сочленение на уровне затылочного. Скульптура черепа гребнистая. Края орбит и теменного отверстия окружены костными валиками, что предполагает толстую кожу. У большинства известен дермальный панцирь на спине из парных рядов костных пластин, приросших к остистым отросткам позвонков, у какопса пластины лежали в два слоя. Кожа, по-видимому, мягкая, следов чешуи не выявлено. Хвост короткий. Вероятно, прибрежные амфибиотические и полуназемные хищники. Есть свидетельства, что крупные диссорофиды могли питаться и падалью.
Капториниды (лат. Captorhinida) — парафилетическая группа ранних рептилий, традиционно рассматриваемая в ранге отряда и включавшая четыре подотряда:
- Капториноморфы (Captorhinomorpha) ;
- Проколофоны (Procolophonia) ;
- Pareiasauroidea ;
- Millerosauroidea.
Офиакодонты — группа примитивных хищных пеликозавров. Древнейшие из пеликозавров, фрагментарные остатки известны уже с середины каменноугольного периода. Единственное семейство — Ophiacodontidae. Отличаются длинным, у многих — относительно высоким черепом, у поздних форм череп очень крупный относительно размеров тела. Зубы многочисленные, некрупные, «клыки» выражены слабо. Отогнутой пластинки угловой кости нет. Плечевой пояс массивный, кости запястья и плюсны слабо окостеневшие, у поздних представителей когти могли отсутствовать. Некоторые виды, вероятно, были рыбоядными водными хищниками, более примитивные представители могли охотиться на суше на крупных насекомых и мелких позвоночных.
Мезенозавр — вид синапсид из клады Eupelycosauria, единственный в роде Mesenosaurus, представитель семейства варанопид. Его ископаемые остатки найдены в отложениях средней перми Восточной Европы (Россия) экспедицией палеонтолога Ефремова в 1938 году. По меркам пеликозавров считается мелким животным.
Caseasauria (лат.) — клада базальных синапсид, живших с позднего карбона по среднюю пермь. Включает два морфологически различных семейства: мелких насекомоядных или плотоядных эотиридид (Eothyrididae) и крупных растительноядных казеид (Caseidae). Эти две группы разделяют ряд общих признаков, связанных с морфологией морды и внешних ноздрей.
Eupelycosauria (лат.) — крупная клада животных, характеризующихся уникальной формой черепа, охватывает всех млекопитающих и их ближайших вымерших родственников. Eupelycosauria появились 308 миллионов лет назад, в раннем пенсильвании, ранние представители — Echinerpeton и, возможно, ещё более древний Protoclepsydrops — представляют один из многочисленных этапов в эволюции млекопитающих, отличающийся от предковых амниот.