Душанбе́ — столица Таджикистана, город республиканского значения, самый крупный научно-культурный, политический, экономический, промышленный и административный центр страны. В Душанбе расположены высшие органы государственной власти страны.
Искандерку́ль — горное озеро в Таджикистане на северных склонах Гиссарского хребта в Фанских горах.
Караку́ль — бессточное озеро, расположенное в северной части Памира, к югу от Заалайского хребта. Крупнейшее озеро на территории Таджикистана. Озеро находится в плоской горной котловине на высоте 3914 м, окружено пустынными скалистыми хребтами, на западе подходящими к озеру, на востоке — отстоящими от него на несколько километров. Наибольшая длина озера — 33 км, ширина — 24 км. Площадь поверхности — 380 км². Объём по данным 1978 года, составлял 26,6 км³.
Варзо́б — река на юго-западе Таджикистана, правый приток реки Кафирниган. Длина — 71 км, бассейн — 1740 км².
Булунку́ль — озеро тектонического происхождения, расположенное в Мургабском районе Горно-Бадахшанской автономной области Таджикистана на высоте 3737,4 метра над уровнем моря. Основное питание обеспечивается за счёт реки Койтезак и в малой степени многочисленными родниками на берегах. В озеро впадает река Иссыкбулок, образующая заболоченную дельту. На южном берегу находится родник Суок. Булункуль соединён протокой с соседним озером Яшилькуль.
Шорку́ль — озеро, расположенное в южных отрогах Сарыкольского хребта в Горно-Бадахшанской автономной области Таджикистана. Узким протоком Узюкдарья, длиною в 9 км, соединяется с озером Рангкуль.
Сасыккуль — бессточное озеро с горько-солёной водой в бассейне реки Аличур, расположенное в Мургабском районе Горно-Бадахшанской автономной области Таджикистана на высоте 3820 метров над уровнем моря. В озеро впадает река Чакраборон (Тамды).
Маргузо́р — озеро завального происхождения, расположенное в Пенджикентском районе Согдийской области Таджикистана на высоте 2139,2 метров над уровнем моря. Длина — 2,65 км, средняя ширина — 0,423 км. Наибольшая глубина — 46,7 м. Общая площадь акватории озера 1,16 км². Площадь водосбора — 178 км².
Нежегон, Нежигок, Нежигон или Мижгон — озеро завального происхождения, расположенное в Пенджикентском районе Согдийской области Таджикистана на высоте 1640 метров над уровнем моря.
Соя или Сая — озеро завального происхождения, расположенное в Пенджикентском районе Согдийской области Таджикистана на высоте 1701 метр над уровнем моря. Ширина — 100 м.
Нофин — озеро завального происхождения, расположенное в Пенджикентском районе Согдийской области Таджикистана на высоте 1778,7 метров над уровнем моря.
Азорчашма, Хазорчашма́ — озеро, расположенное в Пенджикентском районе Согдийской области Таджикистана на высоте 2400 метров над уровнем моря.
Изшор, Гушор или Хушьёр — озеро завального происхождения, расположенное в Пенджикентском районе Согдийской области Таджикистана на высоте 1771 метров над уровнем моря.
Большой Гиссарский канал — водный объект, построенный в 1940—1942 годах с целью улучшения гидрологических, почвенных и агроклиматических условий, а также повышения эффективности использования земельных и водных ресурсов для получения высоких и устойчивых урожаев сельскохозяйственных культур ряда районов республиканского подчинения Таджикистана и Сурхандарьинской области Узбекистана, расположенных в Гиссарской долине. Соединяет реку Варзоб с рекой Каратаг.
Карата́г — трансграничная река протекающая по территории районов республиканского подчинения Таджикистана и Сурхандарьинской области Узбекистана. Одна из составляющих Сурхандарьи. Основные притоки — Ширкент, Дехкондара и Пайрон, а также Большой Гиссарский канал.
Ханака — река, правый приток Кафирнигана, протекающая по территории районов республиканского подчинения Таджикистана. Начало берёт на южных склонах Гиссарского хребта.
Турумтайкуль — сточное озеро расположенное на территории Рошткалинского района Горно-Бадахшанской автономной области Таджикистана.
Тимурдара — проточное озеро, расположенное в низовье реки Казнок на территории Шахринавского района Районов республиканского подчинения Таджикистана.
Кульджуазак — проточное озеро в Шахринавском районе районов республиканского подчинения Таджикистана.
Шинг — река, протекающая по территории Пенджикентского района Согдийской области Таджикистана. Правый и самый крупный приток реки Могиендарья впадающий в него в 22 км от устья. На реке расположены семь озёр, шесть из которых считаются завальными и входят в систему Маргузорских озёр. В Зеравшанской долине река Шинг считается одним из экологически чистых источников воды.