Пикорнавирусы
Пикорнавирусы | |
---|---|
| |
Научная классификация | |
Группа: Вирусы[1] Реалм: Царство: Тип: Класс: Pisoniviricetes Порядок: Picornavirales Семейство: Пикорнавирусы | |
Международное научное название | |
Picornaviridae | |
Роды | |
см. текст | |
Группа по Балтимору | |
IV: (+)оцРНК-вирусы | |
Пикорнави́русы[2] (лат. Picornaviridae, от pico — маленький и rna — РНК) — семейство, объединяющее маленькие икосаэдрические вирусы высших позвоночных, содержащих одноцепочечную геномную РНК положительной полярности (то есть той же полярности, что и мРНК). Размер капсида составляет около 27—30 нм, размер генома — около 7—8 тысяч оснований. Размножение пикорнавирусов происходит в цитоплазме заражённой клетки. К пикорнавирусам относятся возбудители таких заболеваний, как полиомиелит, ринит, ящур, гепатит A и др. В мире вирусов пикорнавирусы выделяются очень высокой скоростью мутирования, что обуславливает высокую вероятность появления вредоносных для человека их вариантов[3].
Строение генома
Геномная РНК пикорнавирусов содержит в большинстве случаев одну открытую рамку считывания под контролем IRES — участка внутренней посадки рибосомы. Трансляция вирусной РНК приводит к образованию гигантского белка-предшественника, который ещё до завершения синтеза нарезается вирусными протеазами, с образованием зрелых вирусных белков. К 5'-концу вирусной РНК ковалентно прикреплён маленький белок — VPg (от англ. viral protein genome linked, вирусный белок, соединённый с геномом). 3'-конец полиаденилирован (содержит несколько десятков остатков аденина, подобно клеточным мРНК). На 5'- и 3'-концах вирусной РНК располагаются так называемые цис-репликативные элементы (OriL и OriR, соответственно — от англ. origin — «начало», left — «левый», right — «правый») — последовательности, необходимые для репликации генома.
Белки пикорнавирусов
Геном пикорнавирусов кодирует около десятка белков, обеспечивающих репликацию вирусной РНК, перепрограммирование клетки, сборку зрелых вирионов. Кодирующую область генома довольно условно делят на три участка: P1 — кодирует структурные белки VP1, VP2, VP3, VP4, из которых строится вирусная частица. P2 и P3 — кодируют белки, необходимые для перепрограммирования клетки и репликации:
- 2А — негомологичен у представителей разных родов пикорнавирусов. Например, у афто- и кардиовирусов — это пептид, который вызывает ко-трансляционный разрыв в синтезируемой белковой цепи полипротеина, а у энтеро- и риновирусов — сериновая протеаза.
- 2B и 3A — небольшие гидрофобные белки, принимающие участие в вызываемом пикорнавирусами изменении мембран клетки.
- 2С — этот белок имеет гомологию с хеликазами, входит в состав пикорнавирусного репликативного комплекса.
- 3B — это VPg, белок прикрепляющийся к 5'-концу вирусной РНК.
- 3С — цистеиновая протеаза, разрезающая полипротеин[4].
- 3D — РНК-полимераза, белок синтезирующий вирусную РНК.
- L — лидерный белок также негомологичен у представителей разных родов, у ряда пикорнавирусов отсутствует. У афтовирусов он является протеазой, отщепляющей себя от полипротеина, у кардиовирусов[англ.] и Teschovirus[англ.] лишён энзиматической активности.
Классификация
По данным Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV), на май 2024 г. в семейство включают 68 родов[5]:
Род | Вид (представитель) |
Ailurivirus | Ailurivirus agiapa |
Aphthovirus | Aphthovirus reedi |
Bopivirus | Bopivirus abovi |
Cardiovirus | Cardiovirus saffoldi |
Cosavirus | Cosavirus depakis |
Erbovirus | Erbovirus aequirhi |
Hunnivirus | Hunnivirus amagyari |
Malagasivirus | Malagasivirus alphalesa |
Marsupivirus | Marsupivirus aburpengari |
Mischivirus | Mischivirus acombewi |
Mosavirus | Mosavirus betibeti |
Mupivirus | Mupivirus arati |
Senecavirus | Senecavirus cetus |
Teschovirus | Teschovirus asilesi |
Torchivirus | Torchivirus atorpi |
Tottorivirus | Tottorivirus asuscro |
Anativirus | Anativirus aductai |
Boosepivirus | Boosepivirus atauri |
Diresapivirus | Diresapivirus arhiferi |
Enterovirus | Enterovirus deconjuncti |
Felipivirus | Felipivirus acati |
Parabovirus | Parabovirus chiwhibe |
Rabovirus | Rabovirus dehomo |
Sapelovirus | Sapelovirus anglia |
Caecilivirus | Caecilivirus banna |
Crahelivirus | Crahelivirus agapo |
Fipivirus | Fipivirus besharpi |
Gruhelivirus | Gruhelivirus agrusa |
Hepatovirus | Hepatovirus ishrewi |
Rohelivirus | Rohelivirus arodenti |
Tremovirus | Tremovirus beturtli |
Danipivirus | Danipivirus abrafi |
Dicipivirus | Dicipivirus acadici |
Gallivirus | Gallivirus afowli |
Hemipivirus | Hemipivirus aholtge |
Kobuvirus | Kobuvirus aichi |
Livupivirus | Livupivirus asmonewi |
Ludopivirus | Ludopivirus agrewhifrogo |
Megrivirus | Megrivirus chigalli |
Myrropivirus | Myrropivirus achiwas |
Oscivirus | Oscivirus ahokorobi |
Passerivirus | Passerivirus bewaxi |
Pemapivirus | Pemapivirus brohepotu |
Poecivirus | Poecivirus ablacachi |
Pygoscepivirus | Pygoscepivirus apingu |
Rafivirus | Rafivirus crhima |
Rajidapivirus | Rajidapivirus ashaska |
Rosavirus | Rosavirus chewhibe |
Sakobuvirus | Sakobuvirus aportufeli |
Salivirus | Salivirus aklasse |
Sicinivirus | Sicinivirus ahiberni |
Symapivirus | Symapivirus atriliza |
Tropivirus | Tropivirus betero |
Aalivirus | Aalivirus apekidu |
Aquamavirus | Aquamavirus apinni |
Avihepatovirus | Avihepatovirus ahepati |
Avisivirus | Avisivirus aturki |
Crohivirus | Crohivirus beidoli |
Grusopivirus | Grusopivirus celori |
Kunsagivirus | Kunsagivirus agrepla |
Limnipivirus | Limnipivirus disploca |
Orivirus | Orivirus aoroshaza |
Parechovirus | Parechovirus feterobo |
Pasivirus | Pasivirus agallia |
Potamipivirus | Potamipivirus balaski |
Shanbavirus | Shanbavirus aminfuli |
Ampivirus | Ampivirus apilisi |
Harkavirus | Harkavirus alfoldi |
См. также
Примечания
- ↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
- ↑ Атлас по медицинской микробиологии, вирусологии и иммунологии : Учебное пособие для студентов медицинских вузов / Под ред. А. А. Воробьева, А. С. Быкова. — М. : Медицинское информационное агентство, 2003. — С. 117. — ISBN 5-89481-136-8.
- ↑ С. Дмитриев. Вирус — это хакер, взламывающий программу клетки // Наука и жизнь. — 2022. — № 5. — С. 8.
- ↑ Malcolm B. A. The picornaviral 3C proteinases: cysteine nucleophiles in serine proteinase folds. : [англ.] // Protein Sci. — 1995. — Vol. 4, no. 8 (August). — P. 1439—1445.
- ↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV). (Дата обращения: 24 мая 2024).
Литература
- Сергеев В. А., Непоклонов Е. А., Алипер Т. И. 10.23 Пикорнавирусы // Вирусы и вирусные вакцины. — М. : Библионика, 2007. — С. 448—462. — ISBN 5-98685-012-2.
- Semler B. L., and Wimmer E. 2002. Molecular Biology of Picornaviruses. American Society for Microbiology, Washington, D.C.