Нерль — река в Ярославской, Ивановской и Владимирской областях России, левый приток реки Клязьмы. Для отличия от одноимённой реки, впадающей в Волгу, иногда применяются уточняющие названия — «Нерль Малая», «Нерль Клязьменская».
Бакалейка — река в России, протекает в Суздальском районе Владимирской области. Берёт начало южнее села Туртино, течёт в северном направлении. Устье реки находится в 29 км по правому берегу реки Каменка от её устья. Длина реки составляет 10 км.
Берёзка — река в России, протекает по Ивановской и Владимирской областям. Левый приток Подыксы.
Воймига — река в России, протекает по Гаврилово-Посадскому району Ивановской области. Устье реки находится в 39 км по левому берегу реки Ирмес в городе Гаврилов Посад. Длина реки составляет 36 км, площадь водосборного бассейна — 210 км².
Желтуха (Печегда) — река в России, протекает в основном в Гаврилово-Посадском районе Ивановской области. Исток и первые два километра течения в Юрьев-Польском районе Владимирской области. Устье реки находится в 142 км по правому берегу реки Нерль. Длина реки составляет 15 км, площадь водосборного бассейна — 68,7 км².
Зименка — река в России, протекает в Ильинском и Гаврилово-Посадском районах Ивановской области. Устье реки находится в 138 км по левому берегу реки Нерль. Длина реки составляет 11 км.
Крапивновка (Устье) — река в России, протекает по Ивановской области. Длина реки составляет 13 км. Не судоходна.
Кушка — река в России, протекает в Ивановской области. Устье реки находится в 17 км по левому берегу реки Ухтома. Длина реки составляет 20 км. Площадь водосборного бассейна — 96,5 км².
Незванка, иначе Названка — река в России, протекает по Ивановской области. Устье реки находится в 118 км от устья Нерли по левому берегу. Исток теряется в лесах Тейковского района Ивановской области. Длина реки составляет 12 км. Не судоходна.
Пашма — река в России, протекает в Ивановской и Ярославской областях.
Печуга — река в России, протекает по Суздальскому и Камешковскому районам Владимирской области. Устье реки находится в 32 км от устья реки Нерль по левому берегу. Длина реки составляет 34 км, площадь водосборного бассейна — 423 км².
Пиклия — река в России, протекает в Юрьев-Польском районе Владимирской области. Устье реки находится в 158 км по правому берегу реки Нерль. Длина реки составляет 16 км, площадь водосборного бассейна — 90,8 км².
Селекша — река в России, протекает по территории Юрьево-Польского района Владимирской области. Устье реки находится в 159 км от устья Нерли по правому берегу. Длина реки составляет 68 км, площадь водосборного бассейна — 395 км².
Синюха (Булгаковка) — река в России, протекает по Ивановской области. Устье реки находится в 82 км от устья Нерли по левому берегу, в Гаврилово-Посадском районе. Исток реки — в лесах Тейковского района Ивановской области. Длина реки составляет 14 км. Не судоходна.
Сойба (Сойва) — река в России, протекает по Гаврилово-Посадскому району Ивановской области. Правый приток Нерли.
Туга — река в России, протекает по Ивановской области. Устье реки находится в 130 км по левому берегу реки Нерль, в Гаврилово-Посадском районе. Исток у села Крапивново Тейковского района Ивановской области. Длина реки составляет 18 км, площадь водосборного бассейна — 103 км². Не судоходна.
Шиха — река в России, протекает в Ильинском районе Ивановской области. Устье реки находится в 169 км по левому берегу реки Нерль. Длина реки составляет 15 км, площадь водосборного бассейна — 71,2 км².
Шоса — река в России, протекает по Юрьев-Польскому району Владимирской области. Устье реки находится в 192 км по правому берегу реки Нерль. Длина реки составляет 14 км.
Чёрная Речка — река в России, протекает по Ильинскому району Ивановской области. Длина реки составляет 10 км.
Сутяга (Каменка) — река в России, протекает в Переславском районе Ярославской области.
— исток, 
— устье
