Псевдоуридин

Перейти к навигацииПерейти к поиску
Псевдоуридин
Изображение химической структуры
Общие
Систематическое
наименование		 5-​[​(2S,3R,4S,5R)​-​3,4-​Дигидрокси-​5-​​(гидроксиметил)​-​оксолан-​2-​ил]-​1H-​пиримидин-​2,4-​дион
Хим. формулаC9H12N2O6
Физические свойства
Состояние Белый гранулированный порошок
Молярная масса244,20 г/моль
Химические свойства
Растворимость
 • в воде хорошо растворим в воде
Классификация
Рег. номер CAS1445-07-4
PubChem94312
SMILES
 
InChI
 
ChEBI17802
ChemSpider85115
Приведены данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иное.
Логотип Викисклада Медиафайлы на Викискладе

Псевдоуриди́н (сокращённо обозначается греческой буквой Ψ) — C-гликозид, изомер нуклеозида уридина. Это наиболее часто встречающееся модифицированное основание из более чем сотни различных модифицированных оснований, которые встречаются в РНК[1]. Псевдоуридин встречается во всех видах и многих классах РНК[2][3][4][5]. Он синтезируется ферментом псевдоуридинсинтазой, который посттранскрипционно изомеризует определённые остатки уридина в РНК. Такой процесс называют псевдоуридинилирование[6].

Синтез псевдоуридина из уридина при помощи псевдоуридинсинтазы

Широко распространён в тРНК, где находится в комплексе с тимидином и цитозином в так называемом TΨC-плече. Относится к консервативной, инвариантной части тРНК. Функция псевдоуридина в РНК остаётся неясной, но как предполагают, он играет роль во взаимодействии с аминоацилтрансферазами и, следовательно, в инициации трансляции. Недавние исследования показали, что он, возможно, обеспечивает защиту от радиации[7].

тРНКAla из S. cerevisiae.
Псевдоуридин обозначен Ψ
Взаимодействие пары оснований A—Ψ

См. также

  • Псевдоуридинкиназа
  • тРНК-псевдоуридинсинтаза


Примечания

  1. ↑ Hamma T., Ferré-D'Amaré A. R. Pseudouridine synthases (англ.) // Chem. Biol.[англ.]. — 2006. — Vol. 13, no. 11. — P. 1125—1135. — doi:10.1016/j.chembiol.2006.09.009. — PMID 17113994.
  2. ↑ Charette M., Gray M. W. Pseudouridine in RNA: what, where, how, and why (англ.) // IUBMB Life. — 2000. — Vol. 49, no. 5. — P. 341—351. — doi:10.1080/152165400410182. — PMID 10902565.
  3. ↑ Liang X. H., Xu Y. X., MIchaeli S. The spliced leader-associated RNA is a trypanosome-specific sn(o) RNA that has the potential to guide pseudouridine formation on the SL RNA (англ.) // RNA. — 2002. — Vol. 8, no. 2. — P. 237—246. — doi:10.1017/S1355838202018290. — PMID 11911368. — PMC 1370245.
  4. ↑ Carlile T. et al. Pseudouridine profiling reveals regulated mRNA pseudouridylation in yeast and human cells (англ.) // Nature. — 2014. — Vol. 515. — P. 143–146. — doi:10.1038/nature13802.
  5. ↑ Schwartz S. et al. Transcriptome-wide Mapping Reveals Widespread Dynamic-Regulated Pseudouridylation of ncRNA and mRNA (англ.) // Cell. — Cell Press, 2014. — Vol. 159, iss. 1. — P. 148—162. — doi:10.1016/j.cell.2014.08.028.
  6. ↑ Ferré-D'Amaré A. R. RNA-modifying enzymes (англ.) // Curr. Opin. Struct. Biol.. — 2003. — Vol. 13, iss. 1. — P. 49—55. — doi:10.1016/S0959-440X(02)00002-7. — PMID 12581659.
  7. ↑ Monobe M., Arimoto-Kobayashi S., Ando K. β-Pseudouridine, a beer component, reduces radiation-induced chromosome aberrations in human lymphocytes (англ.) // Mutation research/Genetic toxicology and environmental mutagenesis. — 2003. — Vol. 538, iss. 1—2. — P. 93—99. — doi:10.1016/S1383-5718(03)00094-9. — PMID 12834758. Архивировано 15 сентября 2009 года.