Лендерка — река в России и Финляндии, протекает по территории Муезерского района Республики Карелия.
Долгая — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Киви — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Длина реки составляет 15 км, площадь водосборного бассейна 26,7 км². Река берёт своё начало из озера Корпи. Течёт в южном и юго-восточном направлении, протекая через Кивиозеро, Ермоозеро. Впадает в озеро Сула.
Килькон — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Мельничья, Колвас или Килвас — река в России, протекает по территории Муезерского района Карелии, впадает в Лексозеро. Длина реки — 14 км, площадь водосборного бассейна — 524 км². Берёт своё начало из озера Колвас, протекает через озёра: Ченус, Руогосельга, Лавансельга, Талвизлакши, плюс имеет приток, вытекающий из озера Струналампи.
Комариная — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии, параллельно проходящей менее чем в 10 км западнее государственной границе. Впадает в озеро Шаверы, через которое протекает река Лендерка. Длина реки составляет 16 км, площадь водосборного бассейна 80,2 км².
Короппи — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Впадает в губу Неунаш озера Тулос. Длина реки составляет 4,6 км, площадь водосборного бассейна — 325 км².
Кюляйоки — река в России, протекает по Суоярвскому району Карелии.
Кюно — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Река берёт начало из озера Редъярви, протекает через озеро Кюно и впадает в озеро Киви, которое через озеро Вожъярви связано с Лексозером. Длина реки составляет 17 км, площадь водосборного бассейна — 220 км².
Марья — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Мечелоут — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 6 км по левому берегу реки Сулы. Длина реки составляет 10 км, площадь водосборного бассейна 104 км². В реку впадает правобережный приток — река Можоки.
Ожма — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии, менее чем в 5 км от государственной границы.
Омельянйоки — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Пай — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 8 км от устья реки Термант по правому берегу. Длина реки составляет 11 км.
Пе́нинга — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Хауге, в верхнем течении Келарви, — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии.
Шаверка — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 25 км от устья Хаапайоки по левому берегу. Длина реки составляет 17 км, площадь водосборного бассейна — 290 км².
Шаори — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Впадает в озеро Войдома — исток реки Войдомы. Длина реки составляет 13 км.
Элин — река в России, протекает по Муезерскому району Карелии. Устье реки находится в 10 км по левому берегу реки Келарви. Длина реки составляет 11 км.
Сула — река в России, протекает в Муезерском районе Карелии Берёт своё начало из Лексозера, протекает через Каргиозеро. На берегу этого озера расположен единственный населённый пункт вблизи реки — Кимоваара. Сула впадает в одноимённое озеро. Длина Сулы составляет 21 км, площадь водосборного бассейна 3760 км².
