Сейм — река, левый приток Десны, самый длинный из её притоков. Протекает по территории России и Украины.
Ялпуг — трансграничная река, формирующаяся на территории Чимишлийского, Комратского и Тараклийского районов Молдавии, и заканчивающаяся в Украине, протекая в границах Болградского района Одесской области, и впадая в озеро Ялпуг. Является рекой первого порядка.
Куколка — левый приток реки Сейм, протекающий по Конотопскому району Сумской области Украины.
Бишкинь — правый приток реки Сула, протекающий по Роменскому и Недригайловскому районам.
Будылка — левый приток реки Псёл, протекающий по Лебединскому району.
Олешня — правый приток реки Ворскла, протекающий по Тростянецкому и Ахтырскому районам Сумской области Украины.
Угорь — левый приток Десны, протекающий по Куликовскому и Черниговскому районам ; одна из рек, расположенных только в пойме Десны. Старое русло Десны, которое трансформировалось в самостоятельную реку вследствие русловых процессов.
Махнея — левый приток Десны, протекающий по Козелецкий район ; одна из рек, расположенных только в пойме Десны. Старое русло Десны, которое трансформировалось в самостоятельную реку вследствие русловых процессов.
Старуха — левый рукав Десны, протекающий по Козелецкий район ; один из многочисленных рукавов Десны, образованный вследствие русловых процессов: русловая многорукавность.
Боровая — река, впадающая в озеро Старая Десна, что по правый берег Десны, протекающий по Черниговскому району ; один из многочисленных рукавов Десны, образованный вследствие русловых процессов: русловая многорукавность.
Гнилуша , или Вир, — левый приток Десны, протекающий по Козелецкому району ; один из многочисленных рукавов Десны, образованных вследствие русловых процессов: русловая многорукавность.
Золотинка — левый приток Десны, протекающий по Черниговскому району ; один из многочисленных рукавов Десны, образованный вследствие русловых процессов: русловая многорукавность.
Быстрая или Деменка — левый приток Десны, протекающий по Черниговскому и Куликовскому районах ; один из многочисленных рукавов Десны, образованный вследствие русловых процессов: русловая многорукавность. В среднем течении называется Мыс, в верхнем — Деменка.
Пулка — ручей, правый приток Десны, протекающий по Менскому и Куликовскому районах ; один из многочисленных рукавов Десны, образованный вследствие русловых процессов: русловая многорукавность. Пулка сообщается с другим притоком Десны рекой Кривуша.
Десенка — левый приток Десны, протекающий по Новгород-Северскому и Шосткинскому районам ; один из многочисленных рукавов Десны, образованный вследствие русловых процессов: русловая многорукавность.
Валки — правый приток Сейма, протекающий по Сосницкому району ; один из многочисленных рукавов в долине Десны, образованный вследствие русловых процессов: русловая многорукавность.
Хвощевая или Руда — правый приток Ромена, расположенный на территории Бахмачского района.
Тихий Сейм — правый приток Сейма, протекающий по Сосницкому району ; один из рукавов в долине Сейма, образованный вследствие русловых процессов: русловая многорукавность.
Ладинка — левый приток Десны, протекающий по Черниговскому району ; один из многочисленных рукавов Десны, образованный вследствие русловых процессов: русловая многорукавность.
Ольховая Говтва или Ольховая Голтва — левый приток реки Говтва, протекающий по Полтавскому району Полтавской области Украины. В верхнем течении, до впадения притока Великая Говтва, называется Средняя Говтва.