Хемоинформатика — применение методов информатики для решения химических проблем.
Поиск количественных соотношений структура-свойство — процедура построения моделей, позволяющих по структурам химических соединений предсказывать их разнообразные свойства. За моделями, позволяющими прогнозировать количественные характеристики биологической активности, исторически закрепилось англоязычное название Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR). Аббревиатура QSAR часто трактуется расширенно для обозначения любых моделей структура-свойство. За моделями, позволяющими прогнозировать физические и физикохимические свойства органических соединений, закрепилось англоязычное название Quantitative Structure-Property Relationship (QSPR). При качественном описании соотношений между структурами химических соединений и их биологической активностью употребляют англоязычный термин Structure-Activity Relationship (SAR).
Понятие молекулярного подобия является одной из ключевых концепций хемоинформатики. Оно играет важную роль в современных подходах к прогнозированию свойств химических соединений, дизайну новых соединений с заранее заданными свойствами и, в особенности, при поиске новых лекарственных препаратов путём проведения скрининга больших баз данных по доступным химическим соединениям. Подобный поиск основан на принципе подобия свойств, сформулированном Johnson и Maggiora: подобные химические соединения обладают подобными свойствами.
Молекуля́рный до́кинг — метод молекулярного моделирования, позволяющий предсказать наиболее выгодную для образования устойчивого комплекса ориентацию и конформацию одной молекулы (лиганда) в сайте связывания другой (рецептора). Данные о положении и конформации партнеров используются для предсказания силы взаимодействия посредством так называемых оценочных функций. В случае, если лиганд является макромолекулой, докинг называют макромолекулярным.
Опио́иды — вещества, способные связываться с опиоидными рецепторами организма, расположенными преимущественно в центральной нервной системе и желудочно-кишечном тракте. Опиоиды, обладающие структурным сходством с морфином, называют также опиа́тами, их молекулы имеют фенантреновую морфинановую основу.
Префе́новая кислота, по анионным формам называемая также префена́т, — органическая двухосновная кислота, образуется из хоризмата, является предшественником в биосинтезе фенилаланина, тирозина, фенилпропаноидов и других соединений. Шестичленный карбоцикл префената легко подвержен ароматизации в одну стадию. Фенильная группа фенилпирувата, фенилаланина происходит из префената, отсюда и название этого соединения. Название предложил Бернард Дэвис — американский микробиолог, обнаруживший метаболическую роль шикимовой кислоты и ставший наиболее крупной фигурой в ранних исследованиях шикиматного пути.
Ферментативный катализ — это увеличение скорости процесса с помощью биологической молекулы, «фермента». Большинство ферментов представляют собой белки, и большинство таких процессов представляют собой химические реакции. Внутри фермента катализ обычно происходит в локализованном центре, называемом активным центром.
ChemSpider — база данных химических соединений и смесей, принадлежащая королевскому химическому обществу Великобритании .
5-HT₆-рецептор — подтип серотониновых рецепторов, который связывает эндогенный нейромедиатор серотонин. Он относится к классу G-белок-связанных метаботропных рецепторов и связан с Gsα. Он медиирует возбуждающую нейротрансмиссию. Этот рецепторный белок у человека кодируется геном HTR6.
Малые молекулы — термин в молекулярной биологии, биохимии и фармакологии; обозначает химические соединения со сравнительно малой молекулярной массой, то есть низкомолекулярные вещества и обладающие той или иной биологической активностью, то есть способностью регулировать или воздействовать на те или иные биологические процессы. Характерный размер «малых молекул» не более 10−9 м. Определяющим свойством малых молекул является способность проникать в клетку и покидать ее без помощи других молекул. Большинство лекарств являются малыми молекулами.
Иолиомика – исследовательское направление, посвящённое изучению ионов в жидкостях или жидких фазах, где основное внимание уделено фундаментальным особенностям ионных взаимодействий. Данное научное направление было впервые сформулировано в публикации российских учёных, посвящённой ионным жидкостям. Название представляет собой комбинацию слов IOns (ионы), LIquids (жидкости) и -OMICS (омика). Иолиомика занимается широкой областью исследований структуры, свойств и приложений ионов, входящих в различные биологические и химические системы. Концепция иолиомики схожа с другими комплексными научными дисциплинами, такими как геномика, протеомика, гликомика и петролеомика, в названии которых присутствует «омика», что свидетельствует об обширности и многогранности данных.
Правило Липински, также известное как правило пяти — эмпирическое правило, помогающее определить, обладает ли химическое соединение с определённой фармакологической или биологической активностью свойствами, делающими его перорально активным лекарственным средством для человека. Правило было сформулировано Кристофером Липински в 1997 году. Правило основано на наблюдении, что большинство перорально вводимых лекарств представляют собой относительно небольшие и умеренно липофильные молекулы.
Атазанавир, продаваемый под торговой маркой Reyataz, представляет собой антиретровирусный препарат (АРТ), используемый для лечения ВИЧ/СПИДа. Обычно его рекомендуется использовать с другими антиретровирусными препаратами. Его можно использовать для профилактики после укола иглой или другого потенциального контакта. Его принимают внутрь один раз в день.
Тест Курнакова, также известный как реакция Курнакова, представляет собой химический тест, который различает пары цис- и транс-изомеров [PtA2X2] (A = NH3, X = галоген или псевдогалогенид). При обработке тиомочевиной транс-дигалогениды дают менее растворимые белые продукты, тогда как цис-дигалогениды дают более растворимые жёлтые продукты. Этот тест до сих пор используется для анализа образцов лекарственного препарата цисплатин, но он представляет, в основном, педагогический интерес, так как демонстрирует транс-эффект.
Кристофер Абель FRS FRSC FMedSci — британский химический биолог. Был профессором биологической химии на химическом факультете Кембриджского университета и научным сотрудником колледжа Тодд-Хэмид в Кембридже. После его избрания в Королевское общество в 2016 году общество охарактеризовало его исследование как «изменившее лицо процесса поиска лекарств».
78c является производным 4-аминохинолина, малой молекулой, которая действует как сильнодействующий и селективный ингибитор фермента CD38, осуществляющего регуляцию внутриклеточного пула НАД.
Гликолевая нуклеиновая кислота (GNA), иногда также называемая глицериновой нуклеиновой кислотой, представляет собой нуклеиновую кислоту, подобную ДНК или РНК, но отличающуюся составом её сахарно-фосфодиэфирной основы с использованием пропиленгликоля вместо рибозы или дезоксирибозы. GNA химически стабильна, но, как известно, не встречается в природе. Однако из-за своей простоты она могла сыграть роль в эволюции жизни.
ADME — аббревиатура, означающая «абсорбция, распределение, метаболизм и выведение» в фармакокинетике и фармакологии и описывающая расположение фармацевтического соединения в организме. Все эти четыре критерия влияют на уровень и кинетику воздействия лекарства на ткани и, следовательно, влияют на эффективность и фармакологическую активность соединения как лекарственного средства. Иногда учитываются также высвобождение и/или токсичность, в результатe чего образуются аббревиатуры LADME, ADMET или LADMET.
Механизм действия (MД) — в фармакологии означает конкретное биохимическое взаимодействие, посредством которого лекарственное вещество оказывает фармакологический эффект.