Ки́словка — река в Томске и Томском районе Томской области, левый приток Томи.
Шега́рка — река на севере Новосибирской и юге Томской областей, левый приток Оби. Длина реки — 382 км. Площадь водосборного бассейна — 12 тысяч км². Средний расход воды — 12,6 м³/с. Высота истока — 148 м над уровнем моря. Уклон реки — 0,23 м/км.
Пёноровка — река в Томской области России, правый приток Васюгана. Устье реки находится в 331 км по правому берегу реки Васюган. Длина реки составляет 118 км.
Андрава — река в России, протекает по Томскому и Кожевниковскому районам Томской области. Устье реки находится в 7 км по правому берегу реки Таган. Длина реки составляет 17 км.
Бакса — река в России, протекает по Новосибирской и Томской областям. Устье реки находится в 213 км по правому берегу реки Шегарка. Длина реки — 206 км, площадь водосборного бассейна — 4800 км².
Бровка — река в России, протекает в Томской области. Устье реки находится в 2589 км по левому берегу реки Обь, в селе Кривошеино. Длина реки составляет 42 км.
Ира — река в России, протекает в Томской области. Устье реки находится в 8 км по левому берегу реки Таган. Длина реки составляет 14 км.
Осиновый Исток — река в Томской области России. Устье реки находится в 40 км по левому берегу реки Таган. Длина реки составляет 13 км.
Оспа — река в Томской области России. В верховье, до слияния с Красной, носит название Кунчурук и протекает по Новосибирской области. Устье реки находится в 26 км по правому берегу реки Таган. Длина реки составляет 67 км, площадь водосборного бассейна 693 км².
Ояш — река в России, протекает в Новосибирской области. Устье реки находится в 2830 км от устья по правому берегу реки Обь.
Ташлаир — река в России, протекает по Томскому и Кожевниковскому районам Томской области. Устье реки находится в 10 км по правому берегу реки Таган. Длина реки составляет 16 км.
Тоя — река в России, протекает в Новосибирской области. Исток находится в Тойском займище на высоте 153 м над уровнем моря, в верховье протекает через озёра Соловьёвское, Бакса, Отоково, Долгое и Круглое. Населённые пункты на реке — Середино, Верх-Тоя и Воробьи. Устье реки находится в 100 км по правому берегу реки Бакса, возле деревни Усть-Тоя. Длина реки составляет 114 км, площадь водосборного бассейна 1830 км².
Лы́мбелька — река в России, протекает по Томской области. Устье реки находится в 472 км по правому берегу реки Тым. Длина реки составляет 240 км, площадь водосборного бассейна 2150 км². Название происходит от селькупских лымб — «орёл» и ка — «река».
Чунджелька — река в России, протекает в Томской области. Образуется слиянием рек Варга-Чунджелька и Кыпа-Чунджелька в 99 км от устья. Устье реки находится в 10 км по левому берегу реки Корыльга. Длина реки составляет 99 км, площадь водосборного бассейна 1580 км².
Шеделга — река в России, протекает по Томской области. Устье реки находится в 22 км от устья по правому берегу Казальцевской протоки, впадающей в Обь в 2134 км по правому берегу. Длина реки составляет 93 км, площадь водосборного бассейна 674 км².
Андарма́ — река в России, протекает по Томской области, однако 500 м — в Новосибирской области. Устье реки находится в 68 км по правому берегу реки Парбиг. Длина реки составляет 232 км, площадь водосборного бассейна — 3070 км².
Ню́рса — река в России, протекает по Томской области. Устье реки находится в 156 км от устья реки Чая по левому берегу. Длина реки составляет 179 км, площадь водосборного бассейна — 1800 км². Высота истока — 121 м над уровнем моря.
Чингис — река в Новосибирской области России. Устье реки находится в 3112 км по правому берегу Новосибирского водохранилища. Длина реки составляет 24 км. Высота устья — 113,5 м над уровнем моря.
Большая Юкса — река в Томской области России, левый приток Чулыма. Устье реки находится в 180 км от устья по левому берегу Чулыма. Длина реки составляет 177 км, водосборная площадь — 2670 км². Высота истока — 184 м. Высота устья — 79 м.
Оськина — река в Томской области России. Устье реки находится в 59 км от устья по левому берегу реки Верхняя Анма. Длина реки составляет 33 км.