Тельце гистоновых локусов
Те́льце гисто́новых ло́кусов (англ. Histone Locus Body) — ядерное тельце, представляющее собой скопление факторов транскрипции генов, кодирующих гистоны, и созревания гистоновых пре-мРНК. К числу таких факторов относят белок NPAT[англ.], необходимый для транскрипции генов гистонов, а белок FLASH и малый ядерный рибонуклеопротеин U7[англ.] необходим для процессинга гистоновых пре-мРНК[1]. Тельца гистоновых локусов обнаружены в клетках млекопитающих и дрозофилы[2]. В клетках амфибий аналогичные ядерные тельца носят название C-снурпосома[1].
Структура
В S-фазе в клетках человека выявляется два маленьких и два больших тельца гистоновых локусов, которые соответствуют маленьким и большим кластерам генов гистонов. В клетках тельце гистоновых локусов и тельце Кахаля обычно располагаются рядом и нередко соприкасаются. Само же тельце гистоновых локусов локализуется в области генов, кодирующих гистоны. В тельце гистоновых локусов иногда даже обнаруживается белок коилин — маркер телец Кахаля[3][1]. Кроме того, в гистоновом тельце локализуется малый ядерный рибонуклеопротеин U7 и белок NPAT (Mxc в клетках дрозофилы), который фосфорилируется комплексом циклинзависимой киназы 2 и циклина E[англ.] и активирует экспрессию генов гистонов. Молекулы NPAT взаимодействую друг с другом своими N-концами, и это взаимодействие критически важно для стабильности тельца гистоновых локусов. Другой белок тельца гистоновых локусов, FLASH, непосредственно участвует в процессинге 3'-концов гистоновых мРНК. у дрозофилы в тельце гистоновых локусов находится белок Mute, необходимый для миогенеза[англ.] (гомолог Mute у млекопитающих называется YARP). Кроме того, он может негативно влиять на экспрессию генов гистонов[1]. FLASH и Mute взаимодействуют с С-концевым участком NPAT/Mxc[2].
Методы иммунофлуоресценции и окрашивания антителами позволили выявить в тельце гистоновых локусов другие белки. В основном они участвуют в транскрипции генов гистонов и процессинге их пре-мРНК. Например, CPSF-73 осуществляет разрезание гистоновых пре-мРНК, а CPSF100[англ.] и симплекин служат факторами полиаденилирования[1].
В целом, белки тельца гистоновых локусов можно подразделить на две группы. К первой относятся белки, локализующиеся в этом ядерном тельце на протяжении всего клеточного цикла и не выявляются в других местах, а во вторую группу попадают белки, которые перемещаются в тельце гистоновых локусов в S-фазе. К первой группе относятся NPAT/Mxc, FLASH и малый ядерный рибонуклеопротеин U7. Белки второй группы изучались в основном у дрозофилы, у которой гены гистонов регулируются значительно жёстче, чем в клетках млекопитающих. В эту группу попадают ключевые белки синтеза РНК: TBP[англ.], РНК-полимераза II, фактор элонгации транскрипции Spt6, транскрипционные факторы, например, Myc, и белки процессинга гистоновых пре-мРНК, такие как симплекин. Эти белки в ходе всего клеточного цикла можно также выявить в нуклеоплазме. Наконец, некоторые компоненты телец гистоновых локусов, такие как коилин и шаперон Cpn10, обнаруживаются не во всех тельцах гистоновых локусов и также локализуются в других ядерных тельцах (например, в тельце Кахаля в случае коилина)[1].
В таблице ниже представлены белки, которые можно обнаружить в тельце гистоновых локусов[1].
Название | Роль в биосинтезе гистоновых мРНК | Организм |
---|---|---|
NPAT/Mxc | Инициация транскрипции, сборка телец гистоновых локусов | Человек, мышь, дрозофила |
HiNF-P[англ.] | Инициация транскрипции | Человек |
РНК-полимераза II | Инициация транскрипции | Xenopus, дрозофила |
TBP | Инициация транскрипции | Дрозофила |
TRF2 | Инициация транскрипции | Дрозофила |
TFIIA | Инициация транскрипции | Дрозофила |
Myc | Инициация транскрипции | Дрозофила |
GAPDH[англ.] | Инициация транскрипции | Дрозофила |
NELF[англ.] | Элонгация транскрипции | Человек |
Spt6 | Элонгация транскрипции | Дрозофила |
ARS2[англ.] | Элонгация транскрипции | Человек |
FLASH | Процессинг 3'-конца мРНК, сборка тельца гистоновых локусов | Человек, мышь, дрозофила |
Симплекин | Процессинг 3'-конца мРНК | Xenopus, дрозофила |
ZFP100 | Процессинг 3'-конца мРНК | Человек |
мяРНП U7 | Процессинг 3'-конца мРНК | Человек, дрозофила, рыбы, лягушки |
Mute/YARP | Подавляет накопление гистоновых мРНК | Человек, дрозофила |
WGE | Подавляет накопление гистоновых мРНК | Дрозофила |
Abo | Подавляет накопление гистоновых мРНК | Дрозофила |
HERS | Подавляет накопление гистоновых мРНК | Дрозофила |
hCINAP | Неизвестна | Человек |
PARP | Неизвестна | Дрозофила |
Cpn10 | Неизвестна | Человек |
WDR79 | Неизвестна; вероятно, компонент тельца Кахаля | Дрозофила |
Коилин | Неизвестна | Человек, дрозофила |
MPM-2 | Детектирует Mxc, фосфорилированный циклином E/Cdk2 | Дрозофила |
Динамика
Для начала сборки тельца гистоновых локусов необходимо, чтобы молекулы NPAT/Mxc взаимодействовали друг с другом своими N-концами, образуя структурную основу для дальнейшей сборки ядерного тельца. Интересно, что сборка тельца гистоновых локусов обладает как чертами стохастической, неупорядоченной сборки, так и строго упорядоченной сборки. Так, в клетках млекопитающих гистоновая пре-мРНК может привлекать к себе другие компоненты тельца гистоновых локусов; такой же способностью обладают некоторые белки этого ядерного тельца, что свидетельствует в пользу стохастической сборки. В то же время у дрозофилы некоторые белки тельца гистоновых локусов, например, Mxc, необходимы для привлечения в тельце других белков — в случае Mxc Mute и мяРНП U7, но не наоборот, что говорит об упорядоченной сборке. Кроме того, удалось непосредственно пронаблюдать упорядоченную сборку телец гистоновых локусов в ходе раннего эмбриогенеза дрозофилы[1].
Показано, что у дрозофилы сборка телец гистоновых локусов начинается строго на кластере генов гистонов. Непосредственно нуклеация тельца происходит на последовательности длиной 300 пар оснований (п. о.), содержащей промоторы гистонов H3[англ.]/H4[англ.], а соответствующая последовательность, содержащая промоторы гистонов H2A[англ.]/H2B[англ.], — нет. Если заблокировать транскрипцию H3/H4, то Mxc и FLASH придут в тельце гистоновых локусов, а Mute и мяРНП U7 — нет, поэтому для сборки тельца гистоновых локусов необходима активная транскрипция генов гистонов. В то же время в тканях дрозофилы, в которых не образуются гистоновые мРНК, в фазах G1 и G2 тельца гистоновых локусов есть. Поэтому, вероятно, для нуклеации тельца гистоновых локусов необходима транскрипция с промоторов H3/H4, а не сами мРНК как таковые[1].
В ходе митоза тельце гистоновых локусов разбирается, однако у дрозофилы небольшие количества Mxc и FLASH выявляются на конденсированных хромосомах в течение всего митоза. Механизм разборки телец гистоновых локусов при митозе неизвестен, но, возможно, в нём задействовано фосфорилирование белков ядерного тельца циклинзависимыми киназами. У дрозофилы небольшое количество NPAT/Mxc может оставаться связанным с митотическими хромосомами, отмечая собой расположение генов гистонов, и в начале интерфазы они запускают быструю сборку тельца гистоновых локусов. Подобным образом себя ведёт TBP, отмечая собой гены гистонов даже при нокдауне Mxc[1].
Имеются некоторые свидетельства в пользу того, что при сборке телец гистоновых локусов наблюдается разделение фаз на границе жидкость-жидкость[англ.] (или просто разделение фаз). Для разделения фаз необходимы белки, содержащие участки низкой сложности[англ.] (англ. Intrinsically disordered regions (IDRs)), и, в самом деле, они имеются у белков Mxc, NPAT, FLASH и Mute. Известно также, что разделению фаз способствует поли(АДФ-рибоза), и поли(АДФ-рибоза)-полимераза была обнаружена в тельцах гистоновых локусов у дрозофилы[1].
Функции
У дрозофилы и млекопитающих в тельце гистоновых локусов происходит биосинтез гистоновых мРНК. В этих ядерных тельцах сконцентрированы различные белковые факторы, задействованные в экспрессии генов гистонов. Когда клетка вступает в S-фазу, уровень гистоновых мРНК в клетке резко повышается, поскольку после активации комплекса циклин E/Cdk2 запускается транскрипция генов гистонов и процессинг пре-мРНК гистонов. Как упоминалось выше, комплекс циклин E/Cdk2 фосфорилирует NPAT, что и запускает экспрессию генов гистонов, а также привлекает в тельце гистоновых локусов факторы процессинга пре-мРНК, например, симплекин[1].
Любопытно, что некоторые гены, кодирующие белки телец гистоновых локусов у дрозофилы, первоначально были открыты в связи с поиском мутаций, затрагивающих развитие органов. Например, мутации гена mxc выражаются в изменении строения ног у самцов. Ген Mute был открыт как ген, необходимый для развития мышц в ходе эмбриогенеза. Сверхэкспрессия гена wge приводит к превращению глаза в крыло[1].
Примечания
- ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 Duronio R. J., Marzluff W. F. Coordinating cell cycle-regulated histone gene expression through assembly and function of the Histone Locus Body. (англ.) // RNA Biology. — 2017. — 3 June (vol. 14, no. 6). — P. 726—738. — doi:10.1080/15476286.2016.1265198. — PMID 28059623.
- ↑ 1 2 Marzluff W. F., Koreski K. P. Birth and Death of Histone mRNAs. (англ.) // Trends In Genetics : TIG. — 2017. — October (vol. 33, no. 10). — P. 745—759. — doi:10.1016/j.tig.2017.07.014. — PMID 28867047.
- ↑ Nizami Z., Deryusheva S., Gall J. G. The Cajal body and histone locus body. (англ.) // Cold Spring Harbor Perspectives In Biology. — 2010. — July (vol. 2, no. 7). — P. 000653—000653. — doi:10.1101/cshperspect.a000653. — PMID 20504965.