Тоне или Тонегава (яп. 利根川 тонэ-гава) — река в Японии, протекает по территории региона Канто.
Го (яп. 江の川 го:нокава) — река в Японии, протекающая по территории префектур Хиросима и Симане. Самая крупная река региона Тюгоку. Иногда её называют «Тюгоку таро». Длина реки Го составляет 194 км. Площадь водосборного бассейна — 3900 км². Средний расход воды — 75,1 м³/с.
Сина́но, или Синано-Гава (яп. 信濃川), в префектуре Нагано — Тикума или Тикума-Гава (яп. 千曲川), протекающая на острове Хонсю, — самая длинная из рек Японии и первая по расходу воды. Её протяжённость — 367 км, на территории её бассейна проживает почти три миллиона человек. Протекает по территории префектур Ниигата и Нагано через города Нагано и Нагаока и впадает в Японское море в порту Ниигата. По площади бассейна Синано занимает третье место после Тоне и Исикари. Согласно японской классификации, Синано является рекой первого класса.
Аракава — река на острове Хонсю, Япония. Протекает по территории префектур Токио и Сайтама.
Куробе (яп. 黒部川 куробэ-гава) — река, протекающая в префектуре Тояма в Японии. Длина реки — 85 км, площадь водосборного бассейна — 682 км². На территории её бассейна проживает около 56 тыс. человек.
Тикуго́ (яп. 筑後川 тикугогава) — крупнейшая река на острове Кюсю, Япония. Она протекает по территории префектур Кумамото, Оита, Фукуока и Сага. Впадает в Ариаке — залив Восточно-Китайского моря. Длина реки составляет 143 км, площадь водосборного бассейна — 2860 км². На территории её бассейна проживает около миллиона человек, крупнейшим городом является Курумэ. Согласно японской классификации, она является рекой первого класса.
Ага́но (яп. 阿賀野川 агано-гава, в префектуре Фукусима — Ага яп. 阿賀川 ага-гава) — река на острове Хонсю, Япония. Протекает через префектуры Фукусима и Ниигата.
Дзиндзу (яп. 神通川 дзиндзу:-гава) — река в Японии в префектурах Тояма и Гифу. Длина реки — 120 км. Площадь водосборного бассейна — 2720 км². Средний расход воды — 175,2 м³/с. На территории её бассейна проживает около 380.000 человек.
Кисо́ (яп. 木曽山脈 кисо-саммяку) — горный хребет в центральной части японского острова Хонсю. Является составной частью так называемых Японских Альп. Горы Кисо расположены в южной части префектуры Нагано и популярны среди местного населения и туристов как Центральные Альпы.
По официальным данным 2019 года в Японии насчитывается 21 147 рек.
Накауми — солоноватое лагунное озеро на севере юго-западной части японского острова Хонсю. Располагается на границе префектур Симане и Тоттори. Относится к бассейну Японского моря, сообщаясь с ним на северо-востоке через пролив Накаэносето (Сакай), впадающий в бухту Михо.
Синдзи — солоноватое озеро лагунного происхождения на севере юго-западной части японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Симане. Относится к бассейну Японского моря, сообщаясь с ним на северо-востоке через канал Сада-Гава, впадающий в бухту Этомо. Седьмое по площади озеро Японии.
Хамана — солоноватое лагунное озеро на юге центральной части японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Сидзуока. Относится к бассейну Тихого океана, сообщаясь с ним на юге через пролив шириной 200 м, впадающий в залив (плёс) Энсю-Нада.
Аба́сири — солоноватое озеро лагунного происхождения на востоке японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Охотск в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Охотского моря, сообщаясь с ним через реку Абасири на северо-востоке, впадающую в залив Абасири. Вместе с озёрами Ноторо, Тофуцу и Сарома входит в состав квазинационального парка Абасири. В озеро впадают реки Абасири, Мемамбецу и Томаппу.
Су́ва — пресноводное горное озеро в центре средней части японского острова Хонсю. Располагается между городами Окая и Сува, на территории префектуры Нагано. Относится к водосборному бассейну Филиппинского моря. Сток из озера идёт на запад через реку Тенрю в залив (плёс) Энсю-Нада.
Сендай или Сендай-Гава (яп. 川内川 сэндайгава) — река в Японии на острове Кюсю. Протекает по территории префектур Кагосима, Миядзаки и Кумамото. Длина реки составляет 137 км, на территории её бассейна проживает около 200 тыс. человек.
Токоро (яп. 常呂川 токорогава) — река в Японии на острове Хоккайдо. Протекает по территории округа Охотск.
Абасири (яп. 網走川 абасиригава) — река в Японии на острове Хоккайдо. Протекает по территории округа Охотск.
Кусиро-Сицугэн (яп. 釧路湿原国立公園 кусиро-сицугэн) — национальный парк на территории округа Кусиро японского острова Хоккайдо. Основан 31 июля 1987 года; имеет площадь 287,88 км².
Сай или Сайгава (яп. 犀川 саи-гава) — река в Японии на острове Хонсю, приток крупнейшей реки Японии — Тикума. Протекает по территории префектуры Нагано.