Прокарио́ты, или доя́дерные — одноклеточные живые организмы, не обладающие оформленным клеточным ядром и другими внутренними мембранными органеллами.
Систе́ма органи́ческого ми́ра — это систематическое описание всех существующих в настоящее время и существовавших ранее организмов.
Проти́сты — парафилетическая группа, к которой относят все эукариотические организмы, не входящие в состав животных, грибов и растений. Название введено Эрнстом Геккелем в 1866 году, однако в современном понимании его впервые использовал в 1969 году Роберт Уиттекер, автор «системы пяти царств». Традиционно протистов подразделяют на простейших (Protozoa), водоросли (Algae) и грибоподобные организмы; все эти группы имеют полифилетическую природу и не используются в качестве таксонов.
Хроми́сты — большая группа эукариот, которой многие современные макросистематики придают ранг царства. К группе относятся организмы, чьи клетки включают другую эукариотическую клетку, в которой находится хлоропласт, а также эволюционные потомки таких организмов, утратившие эукариотического симбионта. Большинство организмов группы имеют автотрофный тип питания, остальные являются гетеротрофами или сапротрофами. Включает как микроскопические одноклеточные организмы, так и относительно крупные многоклеточные, например, представители рода бурых водорослей Macrocystis могут достигать длины 60 м.
Хоанофлагеллаты, или воротничковые жгутиконосцы (лат. Choanoflagellata), — тип одноклеточных эукариот (протистов). Характерная черта — наличие у клетки одного жгутика, окружённого воротничком из 30—40 микроворсинок. Хоанофлагеллаты представлены одиночными и колониальными формами, обитающими в морских и пресных водах. Описано около 150 видов.
Солнечники — группа протистов, которой долгое время придавали статус таксона, однако позднее с помощью электронной микроскопии и молекулярной филогенетики было показано, что такие организмы возникали в эволюции эукариот многократно. Характерной чертой солнечников является наличие лучевидных псевдоподий — аксоподий. Благодаря аксоподиям клетка имеет очертания, напоминающие солнечный диск с лучами, что и отражено в названии. Аксоподии служат солнечникам для питания, а часто и для передвижения. В отличие от радиолярий — другой группы протистов с аксоподиями, солнечники никогда не имеют внутриклеточного минерального скелета и центральной капсулы
Страменопилы, страминопилы, или гетероконтные, разножгутиковые организмы (лат. Heterokonta), — большая группа одноклеточных, колониальных и многоклеточных эукариотических организмов. Для фотосинтезирующих представителей характерно наличие хлорофиллов a, c1, c2, c3, а также фукоксантина или вашериоксантина. Длинный жгутик в норме покрыт трёхчастными мастигонемами (ретронемами).
Томас Кавалье-Смит (Кавалир-Смит) — английский биолог-эволюционист, профессор эволюционной биологии в Оксфордском университете. Основные публикации касаются классификации протистов. Автор таксономической системы, классифицирующей всех эукариот на два надцарственных монофилетических таксона — Unikonta и Bikonta.
Экскаваты — большая группа протистов. К данной группе принадлежит множество разнообразных видов: свободно живущих, симбиотических и паразитических, в том числе некоторые важные виды паразитов человека.
Neomura — клада, состоящая из двух доменов: Archaea и Eukaryota.
Биконты, по системе Томаса Кавалир-Смита, — один из двух монофилетических таксонов (поддомена), на которые делятся Эукариоты.
Амёбозои (лат. Amoebozoa) — крупная группа простейших, включающая в себя большинство одноклеточных, обычно передвигающихся при помощи образования ложноножек (псевдоподий), и имеющих трубчатые митохондриальные кристы. Многие классификации причисляют амёбозоев к типам царства Протисты или царства Простейшие. По классификации, одобренной Международным обществом протистологов , Amoebozoa считаются внеранговой супергруппой эукариот. Молекулярно-генетическое исследование подтвердило, что эта группа является монофилетической. На большинстве филогенетических деревьев амёбозои представлены как сестринская группа заднежгутиковых, вместе с которой она входит в старший таксон одножгутиковые.
Collodictyon (лат.) — род одноклеточных эукариот, родство которого с остальными протистами долгое время не удавалось установить. Систематическое положение рода дискуссионно, но чаще его вместе с несколькими родственными протистами выделяют в отдельную ветвь эукариот.
Заднежгутиковые, или опистоконты (лат. Opisthokonta), — обширная группа эукариот, включающая царства грибов и животных, а также родственные им эукариотические микроорганизмы, которых ранее относили к расформированному царству протистов. Все генетические и ультраструктурные исследования подтвердили монофилию данного таксона.
Охрофи́товые во́доросли, или охрофи́ты , — клада одноклеточных, колониальных и многоклеточных водорослей, относящихся к страменопилам (Stramenopiles), или гетероконтам (Heterokonta). Классифицируются как отдел Ochrophyta или Heterokontophyta, либо как подотдел Ochrophytina в составе отдела Gyrista.
Ризарии — крупная клада одноклеточных и колониальных эукариот.
Sar, или SAR, также Harosa, — обширная клада эукариот, включающая страменопил, альвеолят и ризарий. Одноклеточные, многоклеточные и колониальные организмы; как автотрофы, так и гетеротрофы, очень различны по местообитанию и образу жизни. Описано более 60 тысяч видов.
Церкозои — тип протистов. Не имеют общих морфологических особенностей на микроскопическом уровне, поэтому определение осуществляется при помощи молекулярной филогении на основе рРНК, строения актина или полиубиквитина.
Retaria (лат.) — тип ризарий, объединяющий фораминифер и радиолярий. Существует спорное мнение о принадлежности к нему и Endomyxa.
Diaphoretickes (лат.) — обширная клада эукариот. Группа включает архепластид (Archaeplastida), страменопил (Stramenopiles), альвеолят (Alveolata) и ризарий (Rhizaria), а также ряд других эукариот. Страменопилы, альвеоляты и ризарии объединяются в кладу Sar, получившую своё имя по первым буквам названий включённых в неё таксонов.
