Вы́тегра — река в Вытегорском районе Вологодской области, часть Волго-Балтийского водного пути.
И́лекса — река на северо-западе России, в Архангельской области и Республике Карелии.
Большая Парманжа — река в России, протекает по Онежскому району Архангельской области. Устье реки находится в 6,9 км от устья реки Верхней по левому берегу. Длина реки составляет 17 км, площадь водосборного бассейна — 53,9 км².
Верхняя Охтома, в верховьях Охтома — река в России, протекает в Карелии и Архангельской области. Впадает в озеро Нельмозеро, из которого вытекает Нижняя Охтома, правый приток Илексы. Длина реки — 25 км, площадь водосборного бассейна — 190 км². Протекает вдали от населённых пунктов.
Ве́рхняя — река в России, протекает по территории Онежского района Архангельской области.
Выжига — река в России, протекает по Онежскому району Архангельской области. Устье реки находится в 53 км по левому берегу реки Илекса. Длина реки составляет 15 км, площадь водосборного бассейна — 113 км².
Ельга — река в России, протекает по Онежскому району Архангельской области. Устье реки находится в 5,5 км по левому берегу реки Нижняя Охтома, впадающей в реку Илекса. Длина Ельги составляет 20 км, площадь водосборного бассейна — 137 км².
Мегеда — река в России, протекает в Архангельской области и Республике Карелия. Впадает в озеро Новгудозеро, из которого вытекает Новгуда — приток Илексы.
Ме́льничная — река в России, протекает в Онежском районе Архангельской области. Впадает в реку Илексу. Длина реки составляет 22 км.
Не́локса — река на северо-западе России, протекает по территории Онежского района Архангельской области.
Нетома — река в России, протекает по Республике Карелия и Архангельской области. Устье реки находится в 147 км по левому берегу Водлы. Длина реки составляет 107 км, площадь водосборного бассейна — 776 км².
Нижняя Колонжа — река в России, протекает по Пудожскому району Карелии. Устье реки находится в Колонжозере, через которое протекает Илекса, в 6 км по правому берегу Илексы. Длина реки составляет 20 км, площадь водосборного бассейна — 90,6 км².
Нижняя Охтома — река в России, протекает по территории Онежского района Архангельской области, недалеко от его границы с Пудожским районом Карелии.
Новгуда — река в России, протекает по Пудожскому району Карелии.
Нюдала — река в Вытегорском районе Вологодской области России, левый приток Илексы.
Оло́ва — река на северо-западе России, левый приток Илексы, протекает по территории Онежского района Архангельской области.
Пеможа, в верхнем течении — Осипов, — река в России, протекает по Онежскому району Архангельской области вдали от населённых пунктов, по территории Водлозерского национального парка.
Тунуда — река на северо-западе России, правый приток Илексы. Протекает по Онежскому району Архангельской области, по территории Водлозерского национального парка.
Чусрека́ — река в России, протекает в Онежском районе Архангельской области. Устье реки находится в 98 км по левому берегу реки Илекса. Длина реки составляет 63 км, площадь водосборного бассейна — 724 км². В 8 км от устья, по левому берегу реки впадает река Пеможа. В 37 км от устья, по правому берегу реки впадает река Большой Енгиш.
Илекса — река в Вытегорском районе Вологодской области России. Река берёт начало из Иготозера, впадает в озеро Матенжское. Длина реки составляет 34 км.
