Станция Токио (яп. 東京駅 То:кё: эки) — железнодорожный вокзал, расположенный в бизнес-квартале Маруноути района Тиёда, недалеко от Гиндзы и Императорского Дворца.
Синагава (яп. 品川駅 синагава эки) — железнодорожная станция в Японии, первая главная станция к югу от станции Токио и главный пересадочный пункт для поездов, используемых JR East, JR Central и Кэйкю. Токайдо-синкансэн и поезда на полуостров Миура, полуостров Идзу и регион Токай острова Хонсю проходят через станцию. Несмотря на название, станция находится не в районе Синагава, а в районе Минато. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Сибуя (яп. 渋谷駅 Сибуя-эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Сибуя японской столицы Токио. На 2004 год являлась четвёртой по загруженности станцией в Японии и мире, с пассажиропотоком в 2,4 миллиона пассажиров в будний день. Является одной из основных узловых станций, связывающих пригороды с центральным Токио. Зданием железнодорожной станции является небоскрёб Shibuya Scramble Square. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Син-Аомори (яп. 新青森駅 Син-Аомори-эки) — железнодорожная станция в японском городе Аомори, обслуживаемая компанией JR East. С 4 декабря 2010 года, стала северной конечной точкой линии Тохоку-синкансэн. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Синдзюку (яп. 新宿駅 Синдзюку-эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальных районах Синдзюку и Сибуя японской столицы Токио.
Станция Итигая (яп. 市ヶ谷駅 итигая эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Тиёда, Токио.
Станция Кита-Сэндзю (яп. 北千住駅 кита сэндзю эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Адати, Токио. Станция была открыта 25 декабря 1896 года. Кита-Сэндзю является второй по загруженности станцией в сетях железных дорог Tobu Railway и Tokyo Metro. Также является 11-й по загруженности станцией JR East. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Линия Такасаки (яп. 高崎線 такасаки сэн) — железнодорожная линия японского железнодорожного оператора East Japan Railway Company, протянувшаяся от станции Омия расположенной в городе Сайтама префектуры Сайтама до станции Такасаки расположенной в городе Такасаки префектуры Гумма.
Главная линия Тохоку или линия Тохоку (яп. 東北本線 то:хоку хонсэн) — железнодорожная линия японского железнодорожного оператора East Japan Railway Company, протянувшаяся на 576 километров практически параллельно линии Тохоку-синкансэн от станции Токио, расположенной в специальном районе Тиёда, Токио, до станции Мориока, расположенной в городе Мориока префектуры Ивате. Хотя официально линия начинается на станции Токио, большинство составов на линии начинают движение на станции Уэно. 160-километровый участок от станции Уэно до станции Куроисо в городе Насусиобара префектуры Тотиги также носит название линия Уцуномия.
Станция Осиагэ (яп. 押上駅 осиагэ эки) — крупная железнодорожная станция на линиях Осиагэ, Асакуса, Хандзомон и Исэсаки, расположенная в специальном районе Сумида в Токио. Станция обозначена номером A-20 на линии Асакуса и Z-14 на линии Хандзомон. В непосредственной близости от станции расположена телебашня Небесное дерево Токио. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Канда (яп. 神田駅 канда эки) — железнодорожная станция на линиях Яманотэ, Кэйхин-Тохоку, Тюо (Скорая) и Гиндза, расположенная в специальном районе Тюо, Токио. Станция обозначена номером G-13 на линии Гиндза. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Ниси-Ниппори (яп. 西日暮里駅 ниси ниппори эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Аракава в Токио. Станция обозначена номером C-16 на линии Тиёда и 02 на линии Ниппори-Тонэри Лайнер. На платформе станции линии Ниппори-Тонэри Лайнер установлены платформенные раздвижные двери. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Одзи (яп. 王子駅 о:дзи эки) — железнодорожная станция на линиях Кэйхин-Тохоку и Намбоку расположенная в специальном районе Кита, Токио. Станция обозначена номером N-16 на линии Намбоку. Также на станции останавливается трамвай линии Тодэн-Аракава. Станция линии Тодэн-Аракава носит название Станция Одзи-Экимаэ (яп. 王子駅前停留場 о:дзи экимаэ тэйрю:дзё:). На платформе станции линии Намбоку установлены платформенные раздвижные двери. На платформе станции линии Кэйхин-Тохоку установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Эбису (яп. 恵比寿駅 эбису эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Сибуя, Токио. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Акихабара (яп. 秋葉原駅 акихабара эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Тиёда, Токио в центре торгового квартала Акихабара. Станция обозначена номером H-16 на линии Хибия и номером 01 на линии Tsukuba Express. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Юракутё (яп. 有楽町駅 ю:ракутё: эки) — железнодорожная станция на линиях Яманотэ, Кэйхин-Тохоку и Юракутё, расположенная в специальном районе Тиёда, Токио. Станция обозначена номером Y-18 на линии Юракутё. Секция JR East была открыта 25 июня 1910 года, секция Tokyo Metro 30 октября 1974 года. Станция соединена подземным переходом с находящейся неподалёку станцией Хибия. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Хамамацутё (яп. 浜松町駅 хамамацутё эки) — железнодорожная станция на линиях Яманотэ, Кэйхин-Тохоку и Токийского монорельса, расположенная в специальном районе Минато, Токио. Станция была открыта 16 декабря 1909 года. Монорельс открылся 17 декабря 1964 года. Станция монорельса официально носит носит название Станция монорельса Хамамацутё (яп. モノレール浜松町駅 монорэ:ру хамамацутё эки) и является конечной для данной линии. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Окатимати (яп. 御徒町駅 окатимати эки) — железнодорожная станция на линиях Яманотэ и Кэйхин-Тохоку, расположенная в специальном районе Тайто, Токио. Станция была открыта 1 ноября 1925 года. В непосредственной близости от станции расположены три станции метрополитена: Нака-Окатимати, Уэно-Окатимати и Уэно-Хирокодзи. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Станция Ниппори (яп. 日暮里駅 ниппори эки) — железнодорожная станция, расположенная в специальном районе Аракава в Токио. Станция обозначена номером 01 на линии Ниппори-Тонэри Лайнер. Станция JR East была открыта 1 апреля 1905 года, станция Кэйсэй — 19 декабря 1931 года. На станции установлены платформенные раздвижные двери. На станции установлены автоматические платформенные ворота.
Линия Уэно-Токио (яп. 上野東京ライン уэно то:кё: райн), ранее известная как Сквозная линия Тохоку (яп. 東北縦貫線 то:хоку дзю:кан сэн) — железнодорожная линия японского железнодорожного оператора East Japan Railway Company, соединяющая станции Уэно и Токио, служащая связным звеном между линиями Уцуномия, Такасаки и Дзёбан с одной стороны и линией Токайдо с другой. Реализация проекта начата 30 мая 2008 года. Линия была открыта 14 марта 2015 года, в то время как общая стоимость проекта составила около 40 миллиардов йен.