Систе́ма органи́ческого ми́ра — это систематическое описание всех существующих в настоящее время и существовавших ранее организмов.
Хроми́сты — большая группа эукариот, которой многие современные макросистематики придают ранг царства. К группе относятся организмы, чьи клетки включают другую эукариотическую клетку, в которой находится хлоропласт, а также эволюционные потомки таких организмов, утратившие эукариотического симбионта. Большинство организмов группы имеют автотрофный тип питания, остальные являются гетеротрофами или сапротрофами. Включает как микроскопические одноклеточные организмы, так и относительно крупные многоклеточные, например, представители рода бурых водорослей Macrocystis могут достигать длины 60 м.
Солнечники — группа протистов, которой долгое время придавали статус таксона, однако позднее с помощью электронной микроскопии и молекулярной филогенетики было показано, что такие организмы возникали в эволюции эукариот многократно. Характерной чертой солнечников является наличие лучевидных псевдоподий — аксоподий. Благодаря аксоподиям клетка имеет очертания, напоминающие солнечный диск с лучами, что и отражено в названии. Аксоподии служат солнечникам для питания, а часто и для передвижения. В отличие от радиолярий — другой группы протистов с аксоподиями, солнечники никогда не имеют внутриклеточного минерального скелета и центральной капсулы
Страменопилы, страминопилы, или гетероконтные, разножгутиковые организмы (лат. Heterokonta), — большая группа одноклеточных, колониальных и многоклеточных эукариотических организмов. Для фотосинтезирующих представителей характерно наличие хлорофиллов a, c1, c2, c3, а также фукоксантина или вашериоксантина. Длинный жгутик в норме покрыт трёхчастными мастигонемами (ретронемами).
Архепластиды — растения в широком смысле, одна из основных групп эукариот, включающая зелёные, красные и глаукофитовые водоросли, а также огромное множество наземных растений.
Лабири́нтулы, или лабиринтуломице́ты — класс протистов, относящихся к надтипу Heterokonta, или Stramenopiles. Включает около 40 видов — преимущественно морских гетеротрофных грибоподобных организмов.
Acanthocystis antonkomolovi (лат.) — вид центрохелидных солнечников из рода Acanthocystis.
Acanthocystis olgashelestae (лат.) — вид центрохелидных солнечников из рода Acanthocystis (Acanthocystidae).
Neomura — клада, состоящая из двух доменов: Archaea и Eukaryota.
Collodictyon (лат.) — род одноклеточных эукариот, родство которого с остальными протистами долгое время не удавалось установить. Систематическое положение рода дискуссионно, но чаще его вместе с несколькими родственными протистами выделяют в отдельную ветвь эукариот.
Глаукофи́товые во́доросли, или глаукофи́ты, или глаукоцистофи́ты — небольшой древний отдел одноклеточных водорослей, включающий восемь родов и 21 вид. Глаукофиты особенно интересны своими уникальными хлоропластами (цианеллами), довольно примитивно устроенными по сравнению с хлоропластами других водорослей: они содержат слой муреина между мембранами и характеризуются множеством других свойств, присущих цианобактериям. Согласно современным представлениям, глаукофитовые водоросли обособились в отдельную группу у самого основания Archaeplastida.
Охрофи́товые во́доросли, или охрофи́ты , — клада одноклеточных, колониальных и многоклеточных водорослей, относящихся к страменопилам (Stramenopiles), или гетероконтам (Heterokonta). Классифицируются как отдел Ochrophyta или Heterokontophyta, либо как подотдел Ochrophytina в составе отдела Gyrista.
Ризарии — крупная клада одноклеточных и колониальных эукариот.
Sar, или SAR, также Harosa, — обширная клада эукариот, включающая страменопил, альвеолят и ризарий. Одноклеточные, многоклеточные и колониальные организмы; как автотрофы, так и гетеротрофы, очень различны по местообитанию и образу жизни. Описано более 60 тысяч видов.
Церкозои — тип протистов. Не имеют общих морфологических особенностей на микроскопическом уровне, поэтому определение осуществляется при помощи молекулярной филогении на основе рРНК, строения актина или полиубиквитина.
Retaria (лат.) — тип ризарий, объединяющий фораминифер и радиолярий. Существует спорное мнение о принадлежности к нему и Endomyxa.
HAVCR2, или TIM-3 — мембранный белок, продукт гена HAVCR2.
Haptista (лат.) — клада эукариот, которая объединяет центрохелидных солнечников и гаптофитовые водоросли. Филогенетические исследования показали, что Haptista и TSAR образуют сестринскую группу по отношению к Cryptista и Archaeplastida.
Ancoracysta twista (лат.) — вид микробов-эукариот, единственный в роде Ancoracysta. Относится к типу Nebulidia, принадлежащему к супергруппе Provora в составе клады Diaphoretickes.
Diaphoretickes (лат.) — обширная клада эукариот. Группа включает архепластид (Archaeplastida), страменопил (Stramenopiles), альвеолят (Alveolata) и ризарий (Rhizaria), а также ряд других эукариот. Страменопилы, альвеоляты и ризарии объединяются в кладу Sar, получившую своё имя по первым буквам названий включённых в неё таксонов.
