Зеравшан, Зарафшан — река в Таджикистане и Узбекистане. В древности являлась притоком Амударьи, в настоящее время не доходит до неё из-за разбора воды на орошение, разделяясь на рукава в Бухарском и Каракульском оазисах. Зеравшан орошает земли с богатой культурной историей.
Карадарья́ — река в Ошской области Кыргызстана, Андижанской и Наманганской областях Узбекистана, левая составляющая реки Сырдарья. Одна из крупнейших рек, впадающих в Сырдарью.
Кашкадарья́ — река в Согдийской области Таджикистана и Кашкадарьинской области Узбекистана. Древний приток Зеравшана.
Бозсу́ — магистральный ирригационный канал (арык) в Ташкентской области и городе Ташкенте, питающий водой большинство других каналов на территории столицы. Представляет собой протоку реки Чирчик, которая ещё в древности была преобразована в канал.
Исфара́ — река бассейна Сырдарьи в Баткенской области Кыргызстана, Согдийской области Таджикистана и Ферганской области Узбекистана. В верхнем течении носит название Ак-суу (Аксу), в среднем течении — Каравшин, Каравшан.
Ю́жный Ферга́нский кана́л — магистральный ирригационный канал в Андижанской и Ферганской областях Узбекистана и Ошской области Кыргызстана, крупнейший отвод канала Шахрихансай.
Кашга́р — река в Ошской области Кыргызстана и Синьцзян-Уйгурском автономном районе Китая, приток реки Яркенд.
Санза́р, Сангзар — река в Джизакской области Узбекистана, крупнейшая река области вместе с Зааминсу.
Фандарья — река в Таджикистане, левый приток реки Зеравшан. Длина — 24 километра, площадь бассейна — 3230 км², расход воды — 62,6 м³/с.
Бюраганса́й — река (сай) в Согдийской области Таджикистана, Джизакской и Сырдарьинской областях Узбекистана.
Каттакурга́нское водохрани́лище — водохранилище в Каттакурганском районе Самаркандской области. Первое водохранилище, построенное на территории Узбекистана.
Даргом — древний ирригационный канал в Самаркандской области Узбекистана. Питает водой канал Эскианхор.
Шераба́д или Шерабаддарья́ — река в Сурхандарьинской области Узбекистана, правый приток реки Амударья. В верхнем течении носит название Мачайдарья́, перед впадением — Карасу́.
Танхизыдарья́, Танхаздарья, Танхаз, Танхазыдарья, Танхазы, Танхизадарья — река в Шахрисабзском и Чиракчинском районах Кашкадарьинской области Узбекистана, левый приток реки Кашкадарья.
Яккабагдарья́, Яккаба́г или Яккобагдарья — река в Камашинском, Яккабагском и Шахрисабзском районах Кашкадарьинской области Узбекистана, относится к бассейну реки Кашкадарья.
Могиендарья́, Магияндарья, Магиандарья или Магиа́н — река в Пенджикентском районе Согдийской области Таджикистана. Третий крупный левый приток реки Зеравшан. Длина — 68 километров, площадь бассейна — 1100 км².
Лянга́р, Лангар или Лянгардарья́ — река в Камашинском районе Кашкадарьинской области Узбекистана, в прошлом — левый приток реки Кашкадарья.
Иланса́й — горная река (сай) в Самаркандском районе Самаркандской области. Ранее впадала в канал Даргом, сейчас не доходит до него. В долине реки расположен археологический памятник значительной ценности — Наскальные изображения Илансая.
Акдарья́ — рукав реки Зеравшан на территории Узбекистана. Наряду с Карадарьёй, один из двух рукавов, на которые разделяется река близ Самарканда.
Каршинский магистральный канал — магистральный ирригационный канал, проходящий по территории Каршинской степи и соединяющий Амударью и Кашкадарью. Был прорыт в советское время; ныне располагается на территории двух стран: Узбекистана и Туркменистана.
