Касумига́ура (яп. 霞ヶ浦 ) или Нисиура (яп. 西浦, «западное озеро») — лагунное озеро в Японии, находится в префектуре Ибараки региона Канто. Касумигаура является вторым по величине внутренним озером Японии.
Масю — бессточное кратерное озеро в восточной части японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Кусиро в префектуре Хоккайдо. Входит в состав национального парка Акан.
Инава́сиро — четвёртое по величине озеро Японии, располагается в центральной части префектуры Фукусима на острове Хонсю. Акватории озера является охраняемой природной территорией и входит в состав национального парка Бандай-Асахи.
Синдзи — солоноватое озеро лагунного происхождения на севере юго-западной части японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Симане. Относится к бассейну Японского моря, сообщаясь с ним на северо-востоке через канал Сада-Гава, впадающий в бухту Этомо. Седьмое по площади озеро Японии.
Аба́сири — солоноватое озеро лагунного происхождения на востоке японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Охотск в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Охотского моря, сообщаясь с ним через реку Абасири на северо-востоке, впадающую в залив Абасири. Вместе с озёрами Ноторо, Тофуцу и Сарома входит в состав квазинационального парка Абасири. В озеро впадают реки Абасири, Мемамбецу и Томаппу.
Дзюсан или Дзюсан-Ко (яп. 十三湖 дзю:сан-ко) — солоноватое лагунное озеро западного побережья полуострова Цугару на севере японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Аомори. Относится к водосборному бассейну Японского моря, сообщаясь с ним через пролив шириной 250 м на северо-западе. В 1959 году через пролив был перекинут деревянный мост, в 1979 заменён на бетонный.
Су́ва — пресноводное горное озеро в центре средней части японского острова Хонсю. Располагается между городами Окая и Сува, на территории префектуры Нагано. Относится к водосборному бассейну Филиппинского моря. Сток из озера идёт на запад через реку Тенрю в залив (плёс) Энсю-Нада.
Акан — пресноводное горное озеро в восточной части японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Кусиро в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Тихого океана. Сток из озера идёт на юго-восток через реку Акан, впадающую в залив у города Кусиро. Входит в состав национального парка Акан.
Тюдзендзи — пресноводное горное озеро на северо-востоке центральной части японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Тотиги. Входит в состав национального парка Никко. Относится к бассейну реки Тоне. Сток из озера идёт на восток через реку Дайя, впадающую в Кину.
Ике́да — пресноводное кратерное озеро юго-восточной оконечности полуострова Сацума на юге японского острова Кюсю. Располагается на территории префектуры Кагосима. Входит в состав национального парка Кирисима-Яку. Относится к водосборному бассейну Восточно-Китайского моря. Сток из озера идёт на юг через реку, впадающую в залив у населённого пункта Кавадзири.
Тофуцу — лагунное озеро на востоке японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Охотск в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Охотского моря, сообщаясь с ним на северо-западе через протоку, впадающую в залив Абасири. Вместе с озёрами Ноторо, Абасири и Сарома входит в состав квазинационального парка Абасири.
Инбанума — пресноводное озеро на востоке центральной части японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Тиба. Входит в состав префектурного природного парка Инба-Тега.
Хии (яп. 斐伊川 хиикава, варианты написания: Хиикава, Хии-Гава) — река в Японии на острове Хонсю. Протекает по территории префектур Тоттори и Симане через города Идзумо и Мацуэ и через озёра Синдзи и Накауми, и впадает в Японское море. Хии является крупнейшей рекой на востоке префектуры Симане. Длина реки составляет 153 км, площадь бассейна — 2540 км².
Торо-Ко — пресноводное эвтрофное озеро на юге восточной части японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Кусиро в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну реки Кусиро-Гава, впадающей в Тихий океан. C 1987 года входит в состав национального парка Кусиро-Сицугэн.
Онума — пресноводное эвтрофное озеро на юге западной части японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Осима в префектуре Хоккайдо. Входит в состав одноимённой особо охраняемой природной территории площадью 158,2 км², учреждённой в 1982 году.
Юдо-Нума — солоноватоводное дистрофное озеро на юго-восточном побережье южной части японского острова Хоккайдо. Административно располагается на территории посёлка Тоёкоро, относящегося к округу Токати в префектуре Хоккайдо.
Онума — пресноводное дистрофное озеро на побережье северной оконечности японского острова Хоккайдо. Административно располагается на территории города Вакканай, входящего в состав округа Соя в префектуре Хоккайдо Относится к бассейну реки Коэтои-Гава, впадающей в залив Соя. В 1993 году на базе озера создана особо охраняемая природная территория площадью 8,54 км².
Панке-Нума — солоноватоводное дистрофное озеро на западном побережье северной части японского острова Хоккайдо. Административно располагается на территории посёлка Хоронобе, входящего в состав округа Соя в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну реки Тесио-Гава, впадающей в Японское море.
Юкава (яп. 湯川 юкава) — река в Японии на острове Хонсю, соединяет озёра Юноко и Тюдзендзи. Протекает по территории префектуры Тотиги. Длина реки составляет 11,2 км. Юкава — крупнейшая из рек, впадающих в Тюдзендзи.
Сендзёгахара (яп. 戦場ヶ原 сэндзё:гахара, «равнина поля боя») — горное плато и лежащее на нём верховое болото в Японии, в префектуре Тотиги. Входит в национальный парк Никко. Признано рамсарским угодьем в 2005 году. Площадь болота составляет 4,4—9 км², оно является одним из крупнейших на острове Хонсю.