AIM2

Перейти к навигацииПерейти к поиску
AIM2
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3RN2, 3RN5, 3VD8, 4O7Q

Идентификаторы
ПсевдонимыAIM2, PYHIN4, absent in melanoma 2
Внешние IDOMIM: 604578 MGI: 2686159 HomoloGene: 83226 GeneCards: AIM2
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме AIM2
Расположение в геноме AIM2
Локус1q23.1|1q23.1-q23.2Начало159,061,599 bp[1]
Конец159,187,843 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме AIM2
Расположение в геноме AIM2
Локус1|1 H3Начало173,350,879 bp[2]
Конец173,466,040 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004833
NM_001348247

NM_001013779

RefSeq (белок)

NP_004824
NP_001335176

NP_001013801

Локус (UCSC)Chr 1: 159.06 – 159.19 MbChr 1: 173.35 – 173.47 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

AIM2 (от англ. absent in melanoma 2) — белок, участвует в регуляции иммунного ответа. Продукт гена человека AIM2.[5][6]

Белок входит в особый тип инфламмосом, распознающих инородную бактериальную или вирусную ДНК.[7]

Функции

Белок входит в семейство цитокинов Ifi202/IFI16, содержащих HIN-200 домен. Экспрессия AIM2 индуцируется интерфероном-гамма.[6]

AIM2 способен к образования особого типа инфламмасом, называемые также ДНК-инфламмасомы по их способности распознавать инородную ДНК за счёт HIN200 домена, который связывает ДНК, и PYD домена, который рекрутирует адаптерный белок ASC, необходимый для формирования инфламмасомы. Олигомеризация комплекса происходит в присутствии бактериальной либо вирусной ДНК, а также собственной повреждённой ДНК. Последнее приводит в результате к аутоиммунной реакции. ASC содержит CARD домен (англ. caspase activation and recruitment domain), который, в свою очередь, рекрутирует прокаспазу-1, что приводит к самоактивации каспазы-1. Активированная каспаза-1 процессирует в активную форму воспалительные цитокины интелейкин-1 бета и интерлейкин-18.[7]

Структура

Белок AIM2 состоит из 343 аминокислот. Содержит N-терминальный пириновый домен DAPIN (участок 1-87) и C-терминальный HIN-200 домен (участок 138-337), который включает 2 фрагмента, способных связывать олигонуклеотиды.[8]

Клиническое значение

Повышенный уровень белка AIM2 обнаружен в коже больных псориазом.[9]

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163568 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037860 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. DeYoung K. L., Ray M. E., Su Y. A., Anzick S. L., Johnstone R. W., Trapani J. A., Meltzer P. S., Trent J. M. Cloning a novel member of the human interferon-inducible gene family associated with control of tumorigenicity in a model of human melanoma (англ.) // Oncogene : journal. — 1997. — August (vol. 15, no. 4). — P. 453—457. — doi:10.1038/sj.onc.1201206. — PMID 9242382.
  6. 1 2 Entrez Gene: AIM2 absent in melanoma 2 [ Homo sapiens (human) ] (англ.). NCBI. NIH. Дата обращения: 20 августа 2024. Архивировано 8 марта 2010 года.
  7. 1 2 Schroder K., Tschopp J. The inflammasomes (англ.) // Cell. — Cell Press, 2010. — March (vol. 140, no. 6). — P. 821—832. — doi:10.1016/j.cell.2010.01.040. — PMID 20303873.
  8. Fernandes-Alnemri T., Yu J. W., Datta P., Wu J., Alnemri E. S. AIM2 activates the inflammasome and cell death in response to cytoplasmic DNA (англ.) // Nature : journal. — 2009. — March (vol. 458, no. 7237). — P. 509—513. — doi:10.1038/nature07710. — PMID 19158676. — PMC 2862225.
  9. Dombrowski, Y; Peric, M., Koglin, S., Kammerbauer, C., Göß, C., Anz, D., Simanski, M., Gläser, R., Harder, J., Hornung, V., Gallo, R. L., Ruzicka, T., Besch, R., Schauber, J. Cytosolic DNA Triggers Inflammasome Activation in Keratinocytes in Psoriatic Lesions (англ.) // Science translational medicine : journal. — 2011. — 11 May (vol. 3, no. 82). — P. 82ra38—82ra38. — doi:10.1126/scitranslmed.3002001. — PMID 21562230.

Литература

  • Landolfo S., Gariglio M., Gribaudo G., Lembo D. The Ifi 200 genes: an emerging family of IFN-inducible genes (англ.) // Biochimie[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 80, no. 8—9. — P. 721—728. — doi:10.1016/S0300-9084(99)80025-X. — PMID 9865494.
  • Woerner SM; Kloor M; Schwitalle Y; Youmans, Hanni; Doeberitz, Magnus von Knebel; Gebert, Johannes; Dihlmann, Susanne. The putative tumor suppressor AIM2 is frequently affected by different genetic alterations in microsatellite unstable colon cancers (англ.) // Genes Chromosomes Cancer[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 46, no. 12. — P. 1080—1089. — doi:10.1002/gcc.20493. — PMID 17726700.
  • Gregory SG; Barlow KF; McLay KE; Kaul, R.; Swarbreck, D.; Dunham, A.; Scott, C. E.; Howe, K. L.; Woodfine, K. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 (англ.) // Nature : journal. — 2006. — Vol. 441, no. 7091. — P. 315—321. — doi:10.1038/nature04727. — PMID 16710414.
  • Chen IF; Ou-Yang F; Hung JY; Liu, JC; Wang, H; Wang, SC; Hou, MF; Hortobagyi, GN; Hung, M. C. AIM2 suppresses human breast cancer cell proliferation in vitro and mammary tumor growth in a mouse model (англ.) // Mol. Cancer Ther. : journal. — 2006. — Vol. 5, no. 1. — P. 1—7. — doi:10.1158/1535-7163.MCT-05-0310. — PMID 16432157.
  • Cresswell KS; Clarke CJ; Jackson JT; Darcy, Phillip K.; Trapani, Joseph A.; Johnstone, Ricky W. Biochemical and growth regulatory activities of the HIN-200 family member and putative tumor suppressor protein, AIM2 (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 326, no. 2. — P. 417—424. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.11.048. — PMID 15582594.
  • Liu G; Yu JS; Zeng G; Yin, Dong; Xie, Dong; Black, Keith L.; Ying, Han. AIM-2: a novel tumor antigen is expressed and presented by human glioma cells (англ.) // J. Immunother. : journal. — 2004. — Vol. 27, no. 3. — P. 220—226. — doi:10.1097/00002371-200405000-00006. — PMID 15076139.
  • Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, G. D. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Choubey D., Walter S., Geng Y., Xin H. Cytoplasmic localization of the interferon-inducible protein that is encoded by the AIM2 (absent in melanoma) gene from the 200-gene family (англ.) // FEBS Lett.[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 474, no. 1. — P. 38—42. — doi:10.1016/S0014-5793(00)01571-4. — PMID 10828447.