Апопто́з — регулируемый процесс программируемой клеточной гибели, в результате которого клетка распадается на отдельные апоптотические тельца, ограниченные плазматической мембраной. Фрагменты погибшей клетки обычно очень быстро фагоцитируются макрофагами либо соседними клетками, минуя развитие воспалительной реакции. Морфологически регистрируемый процесс апоптоза продолжается 1—3 часа. Одной из основных функций апоптоза является уничтожение дефектных клеток. В многоклеточных организмах апоптоз к тому же задействован в процессах дифференциации и морфогенеза, в поддержании клеточного гомеостаза, в обеспечении важных аспектов развития и функционирования иммунной системы. Апоптоз наблюдается у всех эукариотов, начиная от одноклеточных простейших и вплоть до высших организмов. В программируемой смерти прокариотов участвуют функциональные аналоги эукариотических белков апоптоза.
Цитохром — небольшой гем-содержащий белок, относится к классу цитохромов, содержит в структуре гем типа c. Выполняет в клетке две функции. С одной стороны, он является одноэлектронным переносчиком, свободно связанным с внутренней мембраной митохондрий, и необходимым компонентом дыхательной цепи. Он способен окисляться и восстанавливаться, но не связывает при этом кислород. С другой стороны, при определённых условиях он может отсоединяться от мембраны, переходить в раствор в межмембранном пространстве и активировать апоптоз. Такая двойственность связана со специфичными свойствами молекулы цитохрома c.
Инфламмасо́ма — многобелковый олигомерный комплекс, отвечающий за активацию воспалительного ответа. Инфламмасома способствует созреванию и секреции провоспалительных цитокинов интерлейкина-1β (IL-1β) и интерлейкина 18 (IL-18). Секреция этих цитокинов вызывает пироптоз — особый вид программируемой клеточной гибели. Нарушения в функционировании инфламмасом приводят к разнообразным болезням.
NLRP1 — цитозольный белок, Nod-подобный рецептор подсемейства NALP. Усиливает активацию прокаспазы 9, опосредованную APAF1 и цитохромом c (апоптосома), и последующий апоптоз. Стимулирует апоптоз за счёт активации прокаспазы 3. Как компонент NLRP1-инфламмасомы активирует провоспалительную каспазы 1 и 5, что приводит к внутриклеточному процессингу и образованию зрелой активной формы и высвобождению интерлейкинов 1 бета и 18.
Каспазы — протеолитические ферменты, относящихся к семейству цистеиновых протеаз, расщепляющих белки исключительно после аспартата. Каспазы играют важную роль в процессах апоптоза, некроза и воспалительных процессах.
Каспаза 9 — протеолитический фермент, одна из каспаз человека, кодируемая одноимённым геном — CASP9, который локализован на коротком плече (p-плече) 1-й хромосоме. Является инициаторной каспазой. Каспаза 9 играет важную роль в сигнальной цепочке апоптоза, вероятно, представляя наиболее «верхний» узел протеазного каскада этой цепочки после сборки апоптосомы. После активации апоптосомой каспаза 9 в свою очередь активирует ряд других молекул, что в конечном счёте и вызывает запрограммированную клеточную смерть. Такая способность позволила использовать её в генной инженерии в качестве индуцируемого малой молекулой "предохранителя" для самоликвидации ИПСК в случае необходимости.
NLRP6 — цитозольный белок, Nod-подобный рецептор семейства NALP, продукт гена NLRP6, участвует в регуляции апоптоза и воспаления.
NLRP7 — цитозольный белок, Nod-подобный рецептор семейства NALP, продукт гена NLRP7, участвует в регуляции воспаления.
NLRP10 — цитозольный белок, Nod-подобный рецептор семейства NALP, продукт гена NLRP10, отрицательный регулятор воспаления. Клонирован в 2004 году.
NLRC4 — цитозольный белок, Nod-подобный рецептор из подсемейства NOD, продукт гена NLRC4. Ген клонирован в 2001 году. Играет роль в активации апоптоза.
NAIP — цитозольный белок, Nod-подобный рецептор, продукт гена NAIP, ингибирует апоптоз.
TNFRSF10A — мембранный белок, рецептор из надсемейства рецепторов факторов некроза опухоли. Участвует в активации апоптоза. Продукт гена человека TNFRSF10A.
AIM2 — белок, участвует в регуляции иммунного ответа. Продукт гена человека AIM2.
PYCARD, или ASC — цитозольный адаптерный белок. Продукт гена человека PYCARD.
Сурвивин, также бакуловирусный ингибитор мотива апоптозных повторов 5, сокращённо BIRC5 — белок, кодируемый у человека геном BIRC5.
Каспаза 1, также интерлейкин-1 превращающий фермент — протеолитический фермент, является первым идентифицированным ферментом крупного семейства цистеиновых протеаз, представляет собой эволюционно консервативный фермент, который путём протеолиза расщепляет другие белки, такие как предшественники воспалительных цитокинов — интерлейкина 1β и интерлейкина 18, а также является индуктором пироптоза, сопровождаемого протеолизом гасдермина D с образованием активных зрелых пептидов.
Каспаза 3 — протеолитический фермент, одна из каспаз человека, взаимодействует с каспазой 8 и каспазой 9. Кодируется одноимённым геном — CASP3, который локализован на коротком плече (p-плече) 4-ой хромосомы. Ортологи CASP3 были идентифицированы у многих видов млекопитающих, для которых имеются полные данные генома. Уникальные ортологи также присутствуют у птиц, ящериц, лиссамфибий и телеостов. Длина полипептидной цепи белка составляет 277 аминокислотных остатков, а молекулярная масса — 31608 Да.
Каспаза 8 — протеолитический фермент, одна из каспаз, кодируется одноимённым геном CASP8, который у человека локализован на коротком плече (p-плече) 2-ой хромосомы. Является экзекуторной (эффекторной) каспазой. Скорее всего, действует на каспазу 3. Ортологи CASP8 были идентифицированы у многочисленных видов млекопитающих, для которых имеются полные данные генома. Эти уникальные ортологи также присутствуют у птиц.
Fas-ассоциированный белок с доменом смерти или белок, взаимодействующий с доменом смерти Fas-рецептора, также называемый MORT1 — адаптерный белок, кодируется одноимённым геном FADD, у человека он локализован на длинном плече (q-плече) 11-ой хромосомы.
Fas-рецептор, также известный как апоптозный антиген 1, кластер дифференцировки 95 (CD95) или член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухолей 6 (TNFRSF6) — белок, который у людей кодируется геном FAS. Впервые Fas был идентифицирован с использованием моноклональных антител, полученных путём иммунизации мышей клеточной линией FS-7. Таким образом, название Fas происходит от FS-7-ассоциированного поверхностного антигена.