Ми́кроРНК — малые некодирующие молекулы РНК длиной 18—25 нуклеотидов, обнаруженные у растений, животных и некоторых вирусов, принимающие участие в транскрипционной и посттранскрипционной регуляции экспрессии генов путём РНК-интерференции. Помимо внутриклеточной обнаружена внеклеточная (циркулирующая) микроРНК.
Белки группы polycomb — это семейство белков, которые способны ремоделировать хроматин. Эти белки-регуляторы были впервые описаны у дрозофил, где они подавляют гомеозисные гены, контролирующие индивидуальные отличия сегментов развивающегося эмбриона.
Резухови́дка Та́ля, или Резу́шка Та́ля — небольшое цветковое растение, вид рода Резуховидка (Arabidopsis) семейства Капустные (Brassicaceae). Его исходный ареал включает Европу, Азию и север Африки, а в наше время резуховидка Таля распространилась по всем континентам, кроме Антарктиды.
Энхансер — небольшой участок ДНК, который после связывания с ним факторов транскрипции стимулирует транскрипцию с основных промоторов гена или группы генов. Энхансеры не обязательно находятся в непосредственной близости от генов, активность которых они регулируют, и даже не обязательно располагаются с ними на одной хромосоме. Энхансеры могут располагаться как в 5'-, так и в 3'-положении относительно матричной цепи регулируемого гена и в любой ориентации к ней. Энхансеры также могут находиться внутри интронов. Тем не менее для работы энхансера необходим его физический контакт с промотором, который осуществляется за счёт «выпетливания» ДНК между энхансером и промотором. Молекулярный механизм действия энхансера заключается в том, что он благодаря собранному на нём белковому комплексу привлекает РНК-полимеразу II и кофакторы транскрипции в область промотора.
CD58, или LFA3, — мембранный белок, молекула клеточной адгезии. Продукт гена человека CD58.
Транс-активи́рующие ма́лые интерфери́рующие РНК, tasiРНК, TAS РНК — группа малых некодирующих РНК наземных растений, подавляющие экспрессию генов путём пост-трансляционного сайленсинга. TasiРНК транскрибируются в геноме в форме двуцепочечных полиаденилированных РНК, которые в дальнейшем процессируются и превращаются во фрагменты РНК длиной 21 нуклеотид. Эти фрагменты включаются в РНК-индуцируемый комплекс выключения гена (RISC). tasiРНК часто относят к малым интерферирующим РНК (siРНК) ввиду того, что обе этих группы малых РНК транскрибируются в форме двуцепочечных РНК и подвергаются схожему процессингу. Впрочем, tasiРНК отличаются от других siРНК тем, что они связывают свои последовательности-мишени с меньшей специфичностью. В этом их механизм более схож с механизмом действия микроРНК, так как они не нуждаются в полной комплементарности последовательностей со своей мишенью, чтобы направлять её распад.
Е-бокс — ДНК-последовательность, найденная в некоторых промоторных областях у эукариот, которые действует в качестве связывающего сайта белка и, как было установлено, регулируют экспрессию генов в нейронах, мышцах и других тканях. Спецификация такой ДНК-последовательности — CANNTG, с палиндромной канонической последовательностью. CACGTG распознаётся и связывается факторами транскрипции для инициации транскрипции генов. После того, как факторы транскрипции связываются с промоторами через E-бокс, другие ферменты могут связываться с промотором и облегчать транскрипцию мРНК из ДНК.
MADS-box (MADS-бокс) — консервативная последовательность нуклеотидов, кодирующая MADS-домен, при помощи которого белки связываются с ДНК. MADS-домен белков связывается с ДНК, в которой есть последовательность CC[A/T]6GG, коротко обозначаемая как CArG-box. Большинство белков, содержащих этот домен, являются транскрипционными факторами и влияют на экспрессию генов. Разные исследователи приводят разные данные относительно длины MADS-box, но обычно она составляет около 168—180 пар оснований, то есть закодированный в ней MADS-домен состоит из 56—60 аминокислот. Существуют данные, согласно которым MADS-домен эволюционировал из последовательности белка топоизомераза второго типа, который, как полагают, был у общего предка всех ныне живущих эукариот.
Развитие цветка — это процесс, посредством которого цветковые растения запускают каскад экспрессии генов в меристеме, который приводит к образованию органа полового размножения — цветка. Чтобы это произошло, растение должно пройти три стадии развития и сопутствующие им физиологические изменения: во-первых, оно должно достичь половой зрелости и стать половозрелой особью ; во-вторых, должно произойти преобразование апикальной меристемы из вегетативной во флоральную меристему ; и, наконец, рост и развитие индивидуальных органов цветка. Для объяснения механизма последней стадии была придумана модель ABC, которая пытается описать биологическую основу процесса с точки зрения молекулярной генетики и биологии развития.
Superman — ген растения резуховидка Таля, обеспечивает связь развития тычинок и плодолистиков. Ген назван в честь героя комиксов — Супермена, поэтому связанные гены kryptonite (ген) и clark kent были названы соответственно. Он кодирует транскрипционный фактор. При мутации по этому гену у резуховидки происходит снижение количества плодолистиков в цветке и увеличение числа тычинок. Гомологичные гены известны у петунии и львиного зева, где они тоже участвуют в развитии цветка, хотя в обоих случаях есть существенные отличия в их функциях от функции superman в Arabidopsis. Superman начинает экспрессироваться уже на ранних этапах развития цветка, продукт гена обнаруживается в мутовке тычинок, смежной с мутовкой плодолистиков. Ген взаимодействует с гомеозисными генами из модели ABC и даёт множество необычных фенотипов.
HOTHEAD (HTH) — ген растения Arabidopsis thaliana, который кодирует ФАД-содержащую оксидоредуктазу. Он участвует в развитии плодолистиков, обеспечивая слияние эпидермальных клеток. В 2005 году было сделано сенсационное заявление, что растения с делетированным геном HOTHEAD способны «помнить» генетическую последовательность своих предков путём некой неменделевской наследственности: у потомков мутантов гомозигот по гену hth появлялась нормальная форма HTH. Более поздние исследования показали, что причиной этого странного фенотипа, был выраженный уклон в сторону аутбридинга, в то время дикие растения Arabidopsis обычно самоопыляются.
Stp4 — ген модельного растения Arabidopsis thaliana. Этот ген кодирует интегральный мембранный белок плазматической мембраны клеток в корнях, пыльниках и проводящих тканях.
Флориген, или гормон цветения — гипотетическая гормоноподобная молекула, ответственная за контроль или инициирование цветения растений. Флориген образуется в листьях и действует в меристемах почек и растущих побегов. Известно, что он передаётся прививанием и даже функционирует между видами. Однако, несмотря на поиски с 1930-х годов, точная природа флоригена до сих пор не выяснена.
Нейрогенин-1 — белок, который у человека кодируется геном NEUROG1.
CXCR2, или β-рецептор интерлейкина 8 — мембранный белок, высокоаффинный рецептор к интерлейкину 8, провоспалительному хемокину, один из двух рецепторов к этому хемокину. Продукт гена человека IL8RB. Относится к большой группе рецепторов, сопряженных с G-белком.
CD3e — трансмембранный белок семейства гликопротеинов CD3, локализованных на поверхности T-лимфоцитов. Продукт гена человека CD3E, расположен на 11-й хромосоме.
HAVCR1, или TIM-1 — мембранный белок, продукт гена HAVCR1. Член семейства белков TIM, которые играют критическую роль в регулировании активности иммунных клеток, в особенности в ответ на вирусную инфекцию. Семейство включает 8 генов, из которых у человека присутствуют 3: TIM-1, TIM-3 и TIM-4. Кроме этого, белок участвует в процессах аллергического ответа, астмы и толерантности к транспланту.
RHAG — мембранный белок из семейства транспортёров растворённых веществ, переносчик аммония, продукт гена RHAG. Мутации гена RHAG могут приводить к наследственному стоматоцитозу.
CD155 — мембранный белок, клеточный рецептор суперсемейства иммуноглобулинов, представлен только у приматов. Продукт гена человека PVR.
Убиквитин карбокси-концевая гидролаза L1 представляет собой деубиквитинирующий фермент.
